Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

MGAT4C

MGAT4 family member C

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
12q21.31-q21.32
Koordináták
12. kromoszóma: 85 955 667–86 256 391 (GRCh38)
Exonok
5 exon, összesen 300,7 kb
Fehérje
478 aminosav
Más néven ismert
HGNT-IV-H
MANE Select transzkriptum
ENST00000611864.5NM_001351288.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) MGAT4C gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A MGAT4C felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
12. kromoszóma, a MGAT4C helyét zárójel jelöli. A MGAT4C és környékén 2 gén a 12. kromoszómán, 85 606 029–86 606 028 között.12. kromoszóma12q21.31-q21.32p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3385,8 Mb86 Mb86,2 Mb86,4 Mb86,6 MbRASSF9: 85 800 703–85 836 589, fordított szálRASSF9NTS: 85 874 162–85 882 992, előre szálNTSMGAT4C: 85 955 667–86 256 391, fordított szálMGAT4CA MGAT4C ábrája: 5 exon a(z) 12. kromoszóma fordított szálán5. exon: 85 955 667–85 980 430, 24 764 bázis4. exon: 85 983 523–85 983 670, 148 bázis3. exon: 85 989 400–85 989 552, 153 bázis2. exon: 86 049 674–86 049 723, 50 bázis1. exon: 86 256 239–86 256 391, 153 bázis543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 300,7 kb-jából 25,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1437 bázis kódolja a fehérjét.

MGAT4C szekvenálása

7Könnyű

Mennyire nehéz a MGAT4C szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A MGAT4C exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a MGAT4C exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség1,6%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,8%
  • GC-tartalom17%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). MGAT4C gén: MGAT4 family member C. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/mgat4c

Vancouver

Dante Labs. MGAT4C gén: MGAT4 family member C [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/mgat4c

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet