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Gene

MGAT4C

MGAT4 family member C

Sintesi

Localizzazione citogenetica
12q21.31-q21.32
Coordinate
Cromosoma 12: 85.955.667–86.256.391 (GRCh38)
Esoni
5 esoni su 300,7 kb
Proteina
478 amminoacidi
Noto anche come
HGNT-IV-H
Trascritto MANE Select
ENST00000611864.5NM_001351288.2
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora MGAT4C. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di MGAT4C

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 12, con una parentesi dove si trova MGAT4C. MGAT4C e 2 geni nelle vicinanze sul cromosoma 12, da 85.606.029 a 86.606.028.Cromosoma 1212q21.31-q21.32p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3385,8 Mb86 Mb86,2 Mb86,4 Mb86,6 MbRASSF9: 85.800.703–85.836.589, filamento inversoRASSF9NTS: 85.874.162–85.882.992, filamento direttoNTSMGAT4C: 85.955.667–86.256.391, filamento inversoMGAT4CDiagramma di MGAT4C: 5 esoni sul filamento inverso del cromosoma 12Esone 5: 85.955.667–85.980.430, 24.764 basiEsone 4: 85.983.523–85.983.670, 148 basiEsone 3: 85.989.400–85.989.552, 153 basiEsone 2: 86.049.674–86.049.723, 50 basiEsone 1: 86.256.239–86.256.391, 153 basi543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 25,3 kb dei 300,7 kb del gene; 1437 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di MGAT4C

3Facile

Quanto è difficile sequenziare MGAT4C con letture corte, su 100

Almost all of MGAT4C's exons sit where short reads map cleanly.

What adds to it: the share of MGAT4C's exons in each kind of hard region

  • Mappabilità1,6%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni6,8%
  • Contenuto GC17%
  • Copertura del riferimento0%

A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scored

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene MGAT4C: MGAT4 family member C. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/mgat4c

Vancouver

Dante Labs. Gene MGAT4C: MGAT4 family member C [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/mgat4c

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