Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

MEIS3

Meis homeobox 3

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19q13.32
Koordináták
19. kromoszóma: 47 403 124–47 419 527 (GRCh38)
Exonok
13 exon, összesen 16,4 kb
Fehérje
375 aminosav
Más néven ismert
MRG2, DKFZp547H236
MANE Select transzkriptum
ENST00000558555.6NM_001301059.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) MEIS3 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A MEIS3 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
19. kromoszóma, a MEIS3 helyét zárójel jelöli. A MEIS3 és környékén 23 gén a 19. kromoszómán, 46 911 326–47 911 325 között.19. kromoszóma19q13.32p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4347 Mb47,2 Mb47,4 Mb47,6 Mb47,8 MbARHGAP35: 46 860 433–47 005 077, előre szálARHGAP35NPAS1: 47 019 474–47 047 242, előre szálNPAS1TMEM160: 47 045 909–47 048 650, fordított szálTMEM160ZC3H4: 47 064 187–47 113 776, fordított szálZC3H4SAE1: 47 113 274–47 210 636, előre szálSAE1BBC3: 47 220 822–47 233 019, fordított szálBBC3CCDC9: 47 255 980–47 274 055, előre szálCCDC9INAFM1: 47 274 373–47 277 755, előre szálINAFM1C5AR1: 47 290 023–47 322 075, előre szálC5AR1C5AR2: 47 332 148–47 347 329, előre szálC5AR2DHX34: 47 349 280–47 383 255, előre szálDHX34MEIS3: 47 403 124–47 419 527, fordított szálMEIS3SLC8A2: 47 428 017–47 472 184, fordított szálSLC8A2KPTN: 47 475 141–47 484 265, fordított szálKPTNNAPA: 47 484 530–47 515 122, fordított szálNAPAZNF541: 47 520 638–47 573 148, fordított szálZNF541BICRA: 47 608 196–47 703 277, előre szálBICRAEHD2: 47 713 388–47 745 089, előre szálEHD2NOP53: 47 745 481–47 758 208, előre szálNOP53SELENOW: 47 778 508–47 784 686, előre szálSELENOWTPRX1: 47 801 232–47 819 051, fordított szálTPRX1CRX: 47 819 779–47 843 330, előre szálCRXTPRX2: 47 859 235–47 861 721, előre szálTPRX2SULT2A1: 47 870 327–47 886 479, fordított szálSULT2A1A MEIS3 ábrája: 13 exon a(z) 19. kromoszóma fordított szálán13. exon: 47 403 124–47 403 553, 430 bázis12. exon: 47 406 460–47 406 526, 67 bázis11. exon: 47 406 888–47 406 971, 84 bázis10. exon: 47 407 079–47 407 137, 59 bázis9. exon: 47 407 352–47 407 428, 77 bázis8. exon: 47 409 099–47 409 247, 149 bázis7. exon: 47 409 436–47 409 547, 112 bázis6. exon: 47 414 717–47 414 866, 150 bázis5. exon: 47 415 051–47 415 101, 51 bázis4. exon: 47 416 652–47 416 702, 51 bázis3. exon: 47 416 804–47 416 963, 160 bázis2. exon: 47 417 178–47 417 350, 173 bázis1. exon: 47 419 070–47 419 527, 458 bázis131210864215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 16,4 kb-jából 2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1128 bázis kódolja a fehérjét.

MEIS3 szekvenálása

17Közepes

Mennyire nehéz a MEIS3 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A MEIS3 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a MEIS3 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség2,4%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések5,2%
  • GC-tartalom70%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). MEIS3 gén: Meis homeobox 3. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/meis3

Vancouver

Dante Labs. MEIS3 gén: Meis homeobox 3 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/meis3

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet