Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LCE2B

late cornified envelope 2B

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
1q21.3
Koordináták
1. kromoszóma: 152 686 123–152 687 397 (GRCh38)
Exonok
2 exon, összesen 1,3 kb
Fehérje
110 aminosav
Más néven ismert
LEP10, XP5
Korábbi jelölések
SPRL1B
MANE Select transzkriptum
ENST00000368780.4NM_014357.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LCE2B gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LCE2B felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
1. kromoszóma, a LCE2B helyét zárójel jelöli. A LCE2B és környékén 38 gén a 1. kromoszómán, 152 186 760–153 186 759 között.1. kromoszóma1q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44152,2 Mb152,4 Mb152,6 Mb152,8 Mb153 MbHRNR: 152 212 076–152 224 193, fordított szálHRNRFLG: 152 302 165–152 325 239, fordított szálFLGFLG2: 152 348 735–152 360 006, fordított szálFLG2CRNN: 152 409 242–152 414 279, fordított szálCRNNLCE5A: 152 510 803–152 512 177, előre szálLCE5ACRCT1: 152 514 482–152 516 008, előre szálCRCT1LCE3E: 152 565 654–152 566 780, fordított szálLCE3ELCE3D: 152 579 381–152 580 516, fordított szálLCE3DLCE3C: 152 600 234–152 601 086, előre szálLCE3CLCE3B: 152 613 811–152 614 098, előre szálLCE3BLCE3A: 152 622 834–152 623 103, fordított szálLCE3ALCE2D: 152 658 824–152 664 659, előre szálLCE2C: 152 675 279–152 676 569, előre szálLCE2CLCE2B: 152 686 123–152 687 397, előre szálLCE2BLCE2A: 152 698 345–152 699 442, előre szálLCE2ALCE4A: 152 708 160–152 709 434, előre szálLCE4AKPLCE: 152 719 522–152 720 470, előre szálKPRP: 152 758 025–152 762 056, előre szálKPRPLCE1F: 152 775 140–152 777 024, előre szálLCE1FLCE1E: 152 786 214–152 788 426, előre szálLCE1ELCE1D: 152 796 721–152 798 181, előre szálLCE1DLCE1C: 152 804 832–152 806 651, fordított szálLCE1B: 152 811 971–152 813 108, előre szálLCE1A: 152 827 473–152 828 097, előre szálLCE6A: 152 842 856–152 843 983, előre szálLCE6ALCE7A: 152 859 996–152 861 252, előre szálLCE7ASMCP: 152 870 060–152 885 047, előre szálSMCPIVL: 152 908 539–152 911 886, előre szálIVLSPRR5: 152 947 206–152 949 255, előre szálSPRR5SPRR4: 152 970 648–152 972 574, előre szálSPRR4SPRR1A: 152 984 081–152 985 814, előre szálSPRR1ASPRR3: 153 001 743–153 003 859, előre szálSPRR3SPRR1B: 153 031 196–153 032 900, előre szálSPRR1BSPRR2D: 153 039 726–153 066 351, fordított szálSPRR2DSPRR2A: 153 056 118–153 065 583, fordított szálSPRR2ASPRR2B: 153 070 216–153 087 834, fordított szálSPRR2BSPRR2E: 153 093 135–153 119 469, fordított szálSPRR2ESPRR2F: 153 112 119–153 122 899, fordított szálSPRR2FSPRR2G: 153 149 565–153 164 447, fordított szálSPRR2GA LCE2B ábrája: 2 exon a(z) 1. kromoszóma előre szálán1. exon: 152 686 123–152 686 156, 34 bázis2. exon: 152 686 824–152 687 397, 574 bázis125′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 1,3 kb-jából 0,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 333 bázis kódolja a fehérjét.

LCE2B szekvenálása

15Közepes

Mennyire nehéz a LCE2B szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A LCE2B exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ami tovább nehezíti: a LCE2B exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség20%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések20%
  • GC-tartalom47%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LCE2B gén: late cornified envelope 2B. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/lce2b

Vancouver

Dante Labs. LCE2B gén: late cornified envelope 2B [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/lce2b

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet