Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

IFNLR1

interferon lambda receptor 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
1p36.11
Koordináták
1. kromoszóma: 24 154 168–24 187 289 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 33,1 kb
Fehérje
520 aminosav
Más néven ismert
CRF2/12, IFNLR, IL-28R1
Korábbi jelölések
IL28RA
MANE Select transzkriptum
ENST00000327535.6NM_170743.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) IFNLR1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A IFNLR1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
1. kromoszóma, a IFNLR1 helyét zárójel jelöli. A IFNLR1 és környékén 18 gén a 1. kromoszómán, 23 670 729–24 670 728 között.1. kromoszóma1p36.11p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4423,8 Mb24 Mb24,2 Mb24,4 Mb24,6 MbRPL11: 23 691 685–23 698 426, előre szálRPL11ELOA: 23 743 153–23 762 059, előre szálELOAPITHD1: 23 778 365–23 788 232, előre szálPITHD1LYPLA2: 23 791 110–23 795 545, előre szálLYPLA2GALE: 23 795 599–23 800 804, fordított szálGALEHMGCL: 23 801 877–23 838 620, fordított szálHMGCLFUCA1: 23 845 077–23 868 361, fordított szálFUCA1CNR2: 23 870 515–23 913 396, fordított szálCNR2PNRC2: 23 956 839–23 963 776, előre szálPNRC2SRSF10: 23 962 474–23 980 927, fordított szálSRSF10MYOM3: 24 054 822–24 112 190, fordított szálMYOM3IL22RA1: 24 119 769–24 143 301, fordított szálIL22RA1IFNLR1: 24 154 168–24 187 289, fordított szálIFNLR1GRHL3: 24 199 558–24 364 482, előre szálGRHL3STPG1: 24 355 830–24 416 934, fordított szálSTPG1NIPAL3: 24 413 515–24 476 735, előre szálNIPAL3RCAN3: 24 502 320–24 541 040, előre szálRCAN3NCMAP: 24 556 061–24 609 328, előre szálNCMAPSRRM1: 24 631 716–24 673 281, előre szálSRRM1A IFNLR1 ábrája: 7 exon a(z) 1. kromoszóma fordított szálán7. exon: 24 154 168–24 157 891, 3724 bázis6. exon: 24 159 052–24 159 182, 131 bázis5. exon: 24 159 474–24 159 633, 160 bázis4. exon: 24 161 542–24 161 684, 143 bázis3. exon: 24 169 417–24 169 601, 185 bázis2. exon: 24 180 731–24 180 854, 124 bázis1. exon: 24 187 191–24 187 289, 99 bázis764215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 33,1 kb-jából 4,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1563 bázis kódolja a fehérjét.

IFNLR1 szekvenálása

6Könnyű

Mennyire nehéz a IFNLR1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A IFNLR1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a IFNLR1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség4,5%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések5,3%
  • GC-tartalom2,4%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). IFNLR1 gén: interferon lambda receptor 1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ifnlr1

Vancouver

Dante Labs. IFNLR1 gén: interferon lambda receptor 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ifnlr1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet