Gén

GABARAPL2

GABA type A receptor associated protein like 2

Citogenetikai elhelyezkedés: 16q23.1
Koordináták: 16. kromoszóma: 75 566 379–75 577 881 (GRCh38)
Exonok: 4 exon, összesen 11,5 kb
Fehérje: 117 aminosav, 13,7 kDa
Más néven ismert: GEF2, ATG8, GATE16, GATE-16, ATG8C
MANE Select transzkriptum: ENST00000037243.7NM_007285.7
Lokusz típusa: Fehérjét kódoló

Nagyon magas
Megbízható
Alacsony
Nagyon alacsony

Ez az oldal adatként

Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.

library(jsonlite)

url <- "https://dantelabs.com/genes/gabarapl2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$name

JSON megnyitása

Olvassa el a GABARAPL2-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) GABARAPL2 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A GABARAPL2 felépítése

Kódoló szekvencia
Transzlálatlan régió
Intron
A transzkripció iránya
Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 11,5 kb-jából 1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 354 bázis kódolja a fehérjét.

GABARAPL2 szekvenálása

8Könnyű

Mennyire nehéz a GABARAPL2 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A GABARAPL2 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a GABARAPL2 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

Leképezhetőség0%
Homológia0%
Közös a chrY-nal0%
Referencia-lefedettség0%
Ismétlődések14%
GC-tartalom18%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Génadatok

Átirat

Fehérje

Variánsok

Klinikai

Az adatok forrásai

HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). GABARAPL2 gén: GABA type A receptor associated protein like 2. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/gabarapl2

Vancouver

Dante Labs. GABARAPL2 gén: GABA type A receptor associated protein like 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/gabarapl2

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.