Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

FXYD1

FXYD domain containing ion transport regulator 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19q13.12
Koordináták
19. kromoszóma: 35 138 824–35 143 109 (GRCh38)
Exonok
8 exon, összesen 4,3 kb
Fehérje
92 aminosav
Korábbi jelölések
PLM
MANE Select transzkriptum
ENST00000351325.9NM_021902.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) FXYD1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A FXYD1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
19. kromoszóma, a FXYD1 helyét zárójel jelöli. A FXYD1 és környékén 33 gén a 19. kromoszómán, 34 640 967–35 640 966 között.19. kromoszóma19q13.12p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4334,8 Mb35 Mb35,2 Mb35,4 Mb35,6 MbSCGB2B2: 34 590 644–34 677 159, fordított szálSCGB2B2ZNF302: 34 677 084–34 687 065, előre szálZNF302ZNF181: 34 734 155–34 750 437, előre szálZNF181ZNF599: 34 758 073–34 773 253, fordított szálZNF599ZNF30: 34 926 887–34 945 172, előre szálZNF30ZNF792: 34 956 167–34 964 293, fordított szálZNF792GRAMD1A: 34 994 537–35 027 406, előre szálGRAMD1ASCN1B: 35 030 444–35 040 455, előre szálSCN1BHPN: 35 040 506–35 066 592, előre szálHPN: 35 106 510–35 124 297, előre szálFXYD3: 35 115 521–35 125 653, előre szálFXYD3LGI4: 35 124 507–35 142 451, fordított szálLGI4FXYD1: 35 138 824–35 143 109, előre szálFXYD1FXYD7: 35 143 148–35 154 303, előre szálFXYD7FXYD5: 35 154 440–35 171 796, előre szálFAM187B: 35 224 800–35 228 739, fordított szálFAM187BLSR: 35 248 330–35 267 967, előre szálLSRUSF2: 35 268 485–35 279 821, előre szálUSF2HAMP: 35 280 716–35 285 146, előre szálHAMPMAG: 35 291 647–35 316 932, előre szálMAGCD22: 35 319 261–35 347 361, előre szálCD22FFAR1: 35 347 902–35 353 864, előre szálFFAR1FFAR3: 35 358 348–35 360 489, előre szálFFAR3GPR42: 35 371 068–35 372 962, előre szálGPR42FFAR2: 35 443 907–35 451 767, előre szálFFAR2KRTDAP: 35 487 324–35 495 558, fordított szálKRTDAPDMKN: 35 497 220–35 513 704, fordított szálDMKNSBSN: 35 523 367–35 528 351, fordított szálSBSNGAPDHS: 35 533 455–35 545 319, előre szálGAPDHSTMEM147: 35 545 600–35 547 527, előre szálATP4A: 35 549 339–35 563 658, fordított szálATP4APMIS2: 35 586 161–35 587 296, előre szálPMIS2HAUS5: 35 612 735–35 625 355, előre szálHAUS5RBM42: 35 628 989–35 638 927, előre szálRBM42A FXYD1 ábrája: 8 exon a(z) 19. kromoszóma előre szálán1. exon: 35 138 824–35 138 894, 71 bázis2. exon: 35 140 076–35 140 140, 65 bázis3. exon: 35 140 597–35 140 629, 33 bázis4. exon: 35 141 132–35 141 206, 75 bázis5. exon: 35 141 536–35 141 572, 37 bázis6. exon: 35 142 472–35 142 521, 50 bázis7. exon: 35 142 720–35 142 771, 52 bázis8. exon: 35 142 917–35 143 109, 193 bázis123456785′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 4,3 kb-jából 0,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 279 bázis kódolja a fehérjét.

FXYD1 szekvenálása

17Közepes

Mennyire nehéz a FXYD1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A FXYD1 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ami tovább nehezíti: a FXYD1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések13%
  • GC-tartalom69%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). FXYD1 gén: FXYD domain containing ion transport regulator 1. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/fxyd1

Vancouver

Dante Labs. FXYD1 gén: FXYD domain containing ion transport regulator 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/fxyd1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet