Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

FHIP1A

FHF complex subunit HOOK interacting protein 1A

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
4q31.3
Koordináták
4. kromoszóma: 151 409 176–151 670 503 (GRCh38)
Exonok
14 exon, összesen 261,3 kb
Fehérje
1040 aminosav
Más néven ismert
FLJ43373, FHIP-L
Korábbi jelölések
FAM160A1
MANE Select transzkriptum
ENST00000435205.6NM_001109977.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) FHIP1A gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A FHIP1A felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
4. kromoszóma, a FHIP1A helyét zárójel jelöli. A FHIP1A és környékén 4 gén a 4. kromoszómán, 151 039 840–152 039 839 között.4. kromoszóma4q31.3p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.2151,2 Mb151,4 Mb151,6 Mb151,8 Mb152 MbRPS3A: 151 099 564–151 104 652, előre szálRPS3ASH3D19: 151 102 751–151 409 365, fordított szálSH3D19PRSS48: 151 277 161–151 291 862, előre szálPRSS48FHIP1A: 151 409 176–151 670 503, előre szálFHIP1AGATB: 151 670 053–151 761 038, fordított szálGATBA FHIP1A ábrája: 14 exon a(z) 4. kromoszóma előre szálán1. exon: 151 409 176–151 409 465, 290 bázis2. exon: 151 454 701–151 454 808, 108 bázis3. exon: 151 482 524–151 482 648, 125 bázis4. exon: 151 566 138–151 566 364, 227 bázis5. exon: 151 577 450–151 578 076, 627 bázis6. exon: 151 586 641–151 586 799, 159 bázis7. exon: 151 588 840–151 588 926, 87 bázis8. exon: 151 629 702–151 629 869, 168 bázis9. exon: 151 638 677–151 638 756, 80 bázis10. exon: 151 646 558–151 646 748, 191 bázis11. exon: 151 649 459–151 650 592, 1134 bázis12. exon: 151 656 232–151 656 410, 179 bázis13. exon: 151 656 760–151 656 898, 139 bázis14. exon: 151 662 501–151 670 503, 8003 bázis124681012145′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 261,3 kb-jából 11,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3123 bázis kódolja a fehérjét.

FHIP1A szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a FHIP1A szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-as skálán

A FHIP1A exonjainak szinte mindegyike olyan helyen található, ahol a rövid olvasatok tisztán illeszthetők.

Ehhez hozzájárul: a FHIP1A exonjainak aránya az egyes nehéz régiótípusokban

  • Leképezhetőség0,2%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések2,4%
  • GC-tartalom2,2%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle nehezen szekvenálható régiókat bemutató térképeire épül.Hogyan számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). FHIP1A gén: FHF complex subunit HOOK interacting protein 1A. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/fhip1a

Vancouver

Dante Labs. FHIP1A gén: FHF complex subunit HOOK interacting protein 1A [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/fhip1a

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet