Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

FGFR1OP2

FGFR1 oncogene partner 2

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
12p11.23
Koordináták
12. kromoszóma: 26 938 470–26 966 648 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 28,2 kb
Fehérje
253 aminosav
Más néven ismert
DKFZp564O1863
MANE Select transzkriptum
ENST00000229395.8NM_015633.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) FGFR1OP2 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A FGFR1OP2 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
12. kromoszóma, a FGFR1OP2 helyét zárójel jelöli. A FGFR1OP2 és környékén 8 gén a 12. kromoszómán, 26 452 559–27 452 558 között.12. kromoszóma12p11.23p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3326,6 Mb26,8 Mb27 Mb27,2 Mb27,4 MbITPR2: 26 335 352–26 833 239, fordított szálITPR2INTS13: 26 904 250–26 938 331, fordított szálINTS13FGFR1OP2: 26 938 470–26 966 648, előre szálFGFR1OP2TM7SF3: 26 954 298–27 014 507, fordított szálTM7SF3MED21: 27 022 544–27 066 343, előre szálMED21C12orf71: 27 081 057–27 084 592, fordított szálC12orf71STK38L: 27 243 968–27 325 961, előre szálSTK38LBMAL2: 27 332 801–27 425 289, előre szálBMAL2SMCO2: 27 446 736–27 502 873, előre szálSMCO2A FGFR1OP2 ábrája: 7 exon a(z) 12. kromoszóma előre szálán1. exon: 26 938 470–26 938 710, 241 bázis2. exon: 26 954 145–26 954 293, 149 bázis3. exon: 26 956 543–26 956 660, 118 bázis4. exon: 26 957 601–26 957 743, 143 bázis5. exon: 26 960 515–26 960 628, 114 bázis6. exon: 26 963 342–26 963 455, 114 bázis7. exon: 26 964 596–26 966 648, 2053 bázis12345675′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 28,2 kb-jából 2,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 762 bázis kódolja a fehérjét.

FGFR1OP2 szekvenálása

46Nehéz

Mennyire nehéz a FGFR1OP2 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A FGFR1OP2 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a FGFR1OP2 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0,7%
  • Homológia70%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,1%
  • GC-tartalom24%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). FGFR1OP2 gén: FGFR1 oncogene partner 2. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/fgfr1op2

Vancouver

Dante Labs. FGFR1OP2 gén: FGFR1 oncogene partner 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/fgfr1op2

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet