Gen
FGFR1OP2
FGFR1 oncogene partner 2
- HGNC 23098↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000111790↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 26127↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 12p11.23
- Koordinater
- Kromosom 12: 26 938 470–26 966 648 (GRCh38)
- Exoner
- 7 exoner på 28,2 kb
- Protein
- 253 aminosyror
- Även känd som
- DKFZp564O1863
- MANE Select-transkript
- ENST00000229395.8NM_015633.3
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fgfr1op2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs FGFR1OP2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser FGFR1OP2 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är FGFR1OP2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,9 kb av genens 28,2 kb, och 762 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av FGFR1OP2
25Måttlig
Hur svår FGFR1OP2 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av FGFR1OP2s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0,7 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.70 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.6,1 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.24 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). FGFR1OP2-genen: FGFR1 oncogene partner 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/fgfr1op2
Dante Labs. FGFR1OP2-genen: FGFR1 oncogene partner 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/fgfr1op2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor