Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

EXOC3L1

exocyst complex component 3 like 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
16q22.1
Koordináták
16. kromoszóma: 67 184 379–67 190 136 (GRCh38)
Exonok
14 exon, összesen 5,8 kb
Fehérje
746 aminosav
Más néven ismert
FLJ35539, FLJ35587
Korábbi jelölések
EXOC3L
MANE Select transzkriptum
ENST00000314586.11NM_178516.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) EXOC3L1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A EXOC3L1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
16. kromoszóma, a EXOC3L1 helyét zárójel jelöli. A EXOC3L1 és környékén 42 gén a 16. kromoszómán, 66 687 258–67 687 257 között.16. kromoszóma16q22.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.366,8 Mb67 Mb67,2 Mb67,4 Mb67,6 MbCMTM4: 66 614 750–66 696 856, fordított szálCMTM4DYNC1LI2: 66 720 893–66 751 856, fordított szálDYNC1LI2TERB1: 66 754 640–66 801 620, fordított szálTERB1NAE1: 66 802 874–66 873 256, fordított szálNAE1CA7: 66 844 414–66 854 153, előre szálCA7PDP2: 66 878 589–66 895 754, előre szálPDP2CDH16: 66 908 122–66 919 187, fordított szálCDH16RRAD: 66 921 682–66 926 308, fordított szálRRADCIAO2B: 66 931 938–66 934 929, fordított szálCIAO2BCES2: 66 934 433–66 945 096, előre szálCES2CES3: 66 961 219–66 975 162, előre szálCES3CES4A: 66 988 574–67 010 417, előre szálCES4ACBFB: 67 028 984–67 101 058, előre szálCBFBPHAF1: 67 109 941–67 148 544, előre szálB3GNT9: 67 142 023–67 151 260, fordított szálTRADD: 67 153 969–67 163 760, fordított szálFBXL8: 67 159 932–67 164 570, előre szál: 67 163 385–67 165 815, előre szálHSF4: 67 164 681–67 169 945, előre szálNOL3: 67 170 154–67 176 189, előre szálNOL3MATCAP1: 67 175 599–67 184 228, fordított szálMATCAP1EXOC3L1: 67 184 379–67 190 136, fordított szálEXOC3L1E2F4: 67 192 117–67 198 919, előre szálE2F4ELMO3: 67 199 105–67 204 029, előre szálTMEM208: 67 227 103–67 229 281, előre szálFHOD1: 67 229 387–67 247 539, fordított szálFHOD1SLC9A5: 67 237 683–67 272 191, előre szálSLC9A5PLEKHG4: 67 277 510–67 289 499, előre szálPLEKHG4KCTD19: 67 289 428–67 326 766, fordított szálKCTD19LRRC36: 67 326 798–67 385 221, előre szálLRRC36TPPP3: 67 389 027–67 393 518, fordított szálTPPP3ZDHHC1: 67 394 152–67 416 833, fordított szálZDHHC1HSD11B2: 67 430 652–67 437 553, előre szálHSD11B2ATP6V0D1: 67 437 523–67 481 227, fordított szálATP6V0D1AGRP: 67 482 571–67 483 552, fordított szálAGRPRIPOR1: 67 518 418–67 546 788, előre szálRIPOR1CTCF: 67 561 831–67 639 189, előre szálCTCFCARMIL2: 67 644 988–67 657 569, előre szálCARMIL2ACD: 67 657 512–67 660 810, fordított szálACDPARD6A: 67 660 350–67 664 266, előre szálPARD6AENKD1: 67 662 945–67 667 954, fordított szálC16orf86: 67 666 802–67 668 757, előre szálGFOD2: 67 674 527–67 719 352, fordított szálA EXOC3L1 ábrája: 14 exon a(z) 16. kromoszóma fordított szálán14. exon: 67 184 379–67 184 604, 226 bázis13. exon: 67 184 686–67 184 810, 125 bázis12. exon: 67 184 902–67 185 057, 156 bázis11. exon: 67 185 136–67 185 258, 123 bázis10. exon: 67 185 361–67 185 490, 130 bázis9. exon: 67 186 237–67 186 347, 111 bázis8. exon: 67 186 557–67 186 657, 101 bázis7. exon: 67 186 759–67 186 884, 126 bázis6. exon: 67 187 021–67 187 138, 118 bázis5. exon: 67 187 225–67 187 837, 613 bázis4. exon: 67 188 721–67 188 940, 220 bázis3. exon: 67 189 020–67 189 180, 161 bázis2. exon: 67 189 631–67 189 683, 53 bázis1. exon: 67 189 971–67 190 136, 166 bázis14131211109876543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 5,8 kb-jából 2,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2241 bázis kódolja a fehérjét.

EXOC3L1 szekvenálása

12Könnyű

Mennyire nehéz a EXOC3L1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A EXOC3L1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a EXOC3L1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések0,1%
  • GC-tartalom58%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). EXOC3L1 gén: exocyst complex component 3 like 1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/exoc3l1

Vancouver

Dante Labs. EXOC3L1 gén: exocyst complex component 3 like 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/exoc3l1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet