Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

DCLRE1A

DNA cross-link repair 1A

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
10q25.3
Koordináták
10. kromoszóma: 113 834 725–113 854 082 (GRCh38)
Exonok
9 exon, összesen 19,4 kb
Fehérje
1040 aminosav
Más néven ismert
SNM1, PSO2, KIAA0086, hSNM1
MANE Select transzkriptum
ENST00000361384.7NM_014881.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) DCLRE1A gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A DCLRE1A felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
10. kromoszóma, a DCLRE1A helyét zárójel jelöli. A DCLRE1A és környékén 10 gén a 10. kromoszómán, 113 344 404–114 344 403 között.10. kromoszóma10q25.3p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.3113,4 Mb113,6 Mb113,8 Mb114 Mb114,2 MbHABP2: 113 550 837–113 592 878, előre szálHABP2NRAP: 113 588 714–113 664 121, fordított szálNRAPCASP7: 113 679 158–113 731 668, előre szálCASP7PLEKHS1: 113 751 262–113 783 429, előre szálPLEKHS1DCLRE1A: 113 834 725–113 854 082, fordított szálDCLRE1ANHLRC2: 113 854 475–113 917 194, előre szálNHLRC2ADRB1: 114 043 866–114 046 904, előre szálADRB1CCDC186: 114 120 862–114 174 237, fordított szálCCDC186TDRD1: 114 179 270–114 232 666, előre szálTDRD1VWA2: 114 239 246–114 294 489, előre szálVWA2AFAP1L2: 114 293 604–114 405 132, fordított szálAFAP1L2A DCLRE1A ábrája: 9 exon a(z) 10. kromoszóma fordított szálán9. exon: 113 834 725–113 835 312, 588 bázis8. exon: 113 837 062–113 837 203, 142 bázis7. exon: 113 841 406–113 841 560, 155 bázis6. exon: 113 842 343–113 842 488, 146 bázis5. exon: 113 844 104–113 844 244, 141 bázis4. exon: 113 845 685–113 845 803, 119 bázis3. exon: 113 847 202–113 847 335, 134 bázis2. exon: 113 848 980–113 850 644, 1665 bázis1. exon: 113 852 723–113 854 082, 1360 bázis9876543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 19,4 kb-jából 4,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3123 bázis kódolja a fehérjét.

DCLRE1A szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a DCLRE1A rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A DCLRE1A exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a DCLRE1A exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2%
  • GC-tartalom3,9%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). DCLRE1A gén: DNA cross-link repair 1A. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/dclre1a

Vancouver

Dante Labs. DCLRE1A gén: DNA cross-link repair 1A [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/dclre1a

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet