Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

CSE1L

chromosome segregation 1 like

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
20q13.13
Koordináták
20. kromoszóma: 49 046 312–49 096 949 (GRCh38)
Exonok
25 exon, összesen 50,6 kb
Fehérje
971 aminosav
Más néven ismert
CAS, XPO2, CSE1
MANE Select transzkriptum
ENST00000262982.3NM_001316.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) CSE1L gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A CSE1L felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
20. kromoszóma, a CSE1L helyét zárójel jelöli. A CSE1L és környékén 7 gén a 20. kromoszómán, 48 571 631–49 571 630 között.20. kromoszóma20q13.13p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3348,6 Mb48,8 Mb49 Mb49,2 Mb49,4 MbPREX1: 48 624 249–48 828 096, fordított szálPREX1ARFGEF2: 48 921 707–49 036 693, előre szálARFGEF2CSE1L: 49 046 312–49 096 949, előre szálCSE1LSTAU1: 49 113 324–49 188 417, fordított szálSTAU1DDX27: 49 219 347–49 244 077, előre szálDDX27ZNFX1: 49 237 946–49 278 473, fordított szálZNFX1KCNB1: 49 293 394–49 484 570, fordított szálKCNB1PTGIS: 49 503 874–49 568 333, fordított szálPTGISA CSE1L ábrája: 25 exon a(z) 20. kromoszóma előre szálán1. exon: 49 046 312–49 046 423, 112 bázis2. exon: 49 058 453–49 058 548, 96 bázis3. exon: 49 063 202–49 063 344, 143 bázis4. exon: 49 066 192–49 066 293, 102 bázis5. exon: 49 066 365–49 066 510, 146 bázis6. exon: 49 067 190–49 067 280, 91 bázis7. exon: 49 068 715–49 068 822, 108 bázis8. exon: 49 070 205–49 070 297, 93 bázis9. exon: 49 072 286–49 072 453, 168 bázis10. exon: 49 072 568–49 072 697, 130 bázis11. exon: 49 074 785–49 074 850, 66 bázis12. exon: 49 075 318–49 075 520, 203 bázis13. exon: 49 076 980–49 077 064, 85 bázis14. exon: 49 078 561–49 078 622, 62 bázis15. exon: 49 084 026–49 084 162, 137 bázis16. exon: 49 085 283–49 085 386, 104 bázis17. exon: 49 088 009–49 088 106, 98 bázis18. exon: 49 089 247–49 089 397, 151 bázis19. exon: 49 089 538–49 089 746, 209 bázis20. exon: 49 090 742–49 090 839, 98 bázis21. exon: 49 090 937–49 091 022, 86 bázis22. exon: 49 092 046–49 092 127, 82 bázis23. exon: 49 094 140–49 094 286, 147 bázis24. exon: 49 094 732–49 094 963, 232 bázis25. exon: 49 096 349–49 096 949, 601 bázis124681012141618202224255′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 50,6 kb-jából 3,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2916 bázis kódolja a fehérjét.

CSE1L szekvenálása

2Könnyű

Mennyire nehéz a CSE1L rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A CSE1L exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a CSE1L exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések0%
  • GC-tartalom7,9%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). CSE1L gén: chromosome segregation 1 like. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/cse1l

Vancouver

Dante Labs. CSE1L gén: chromosome segregation 1 like [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/cse1l

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet