Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

CNNM3

cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
2q11.2
Koordináták
2. kromoszóma: 96 816 268–96 835 382 (GRCh38)
Exonok
8 exon, összesen 19,1 kb
Fehérje
707 aminosav
Más néven ismert
SLC70A3
Korábbi jelölések
ACDP3
MANE Select transzkriptum
ENST00000305510.4NM_017623.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) CNNM3 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A CNNM3 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
2. kromoszóma, a CNNM3 helyét zárójel jelöli. A CNNM3 és környékén 14 gén a 2. kromoszómán, 96 325 825–97 325 824 között.2. kromoszóma2q11.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.396,4 Mb96,6 Mb96,8 Mb97 Mb97,2 MbITPRIPL1: 96 324 977–96 330 517, előre szálITPRIPL1NCAPH: 96 335 728–96 377 091, előre szálNCAPHNEURL3: 96 497 644–96 508 153, fordított szálNEURL3ARID5A: 96 536 699–96 552 639, előre szálARID5AKANSL3: 96 584 179–96 642 787, fordított szálKANSL3FER1L5: 96 642 737–96 704 887, előre szálFER1L5LMAN2L: 96 704 824–96 740 087, fordított szálLMAN2LCNNM4: 96 760 858–96 811 888, előre szálCNNM4CNNM3: 96 816 268–96 835 382, előre szálCNNM3ANKRD23: 96 821 811–96 857 934, fordított szálANKRD23ANKRD39: 96 836 240–96 858 070, fordított szálANKRD39SEMA4C: 96 859 718–96 873 840, fordított szálSEMA4CFAM178B: 96 875 882–96 986 580, fordított szálFAM178BFAHD2B: 97 078 759–97 094 903, fordított szálFAHD2BANKRD36: 97 113 112–97 264 521, előre szálANKRD36A CNNM3 ábrája: 8 exon a(z) 2. kromoszóma előre szálán1. exon: 96 816 268–96 817 502, 1235 bázis2. exon: 96 825 058–96 825 201, 144 bázis3. exon: 96 826 833–96 826 982, 150 bázis4. exon: 96 827 731–96 827 900, 170 bázis5. exon: 96 828 099–96 828 195, 97 bázis6. exon: 96 828 567–96 828 700, 134 bázis7. exon: 96 828 996–96 829 134, 139 bázis8. exon: 96 832 552–96 835 382, 2831 bázis123456785′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 19,1 kb-jából 4,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2124 bázis kódolja a fehérjét.

CNNM3 szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a CNNM3 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-as skálán

A CNNM3 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen található, ahol a rövid olvasatok tisztán illeszthetők.

Ehhez hozzájárul: a CNNM3 exonjainak aránya az egyes nehéz régiótípusokban

  • Leképezhetőség1%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések3,5%
  • GC-tartalom25%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle nehezen szekvenálható régiókat bemutató térképeire épül.Hogyan számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). CNNM3 gén: cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/cnnm3

Vancouver

Dante Labs. CNNM3 gén: cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/cnnm3

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet