Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ATG13

autophagy related 13

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
11p11.2
Koordináták
11. kromoszóma: 46 617 553–46 674 518 (GRCh38)
Exonok
19 exon, összesen 57 kb
Fehérje
550 aminosav
Korábbi jelölések
KIAA0652
MANE Select transzkriptum
ENST00000683050.1NM_001346311.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ATG13 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ATG13 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
11. kromoszóma, a ATG13 helyét zárójel jelöli. A ATG13 és környékén 13 gén a 11. kromoszómán, 46 146 036–47 146 035 között.11. kromoszóma11p11.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2546,2 Mb46,4 Mb46,6 Mb46,8 Mb47 MbCREB3L1: 46 277 636–46 321 422, előre szálCREB3L1DGKZ: 46 332 665–46 380 555, előre szálDGKZMDK: 46 380 748–46 383 837, előre szálMDKCHRM4: 46 383 589–46 391 990, fordított szálCHRM4AMBRA1: 46 396 414–46 594 242, fordított szálAMBRA1HARBI1: 46 601 280–46 617 909, fordított szálHARBI1ATG13: 46 617 553–46 674 518, előre szálATG13ARHGAP1: 46 677 075–46 700 977, fordított szálARHGAP1ZNF408: 46 701 011–46 705 913, előre szálZNF408F2: 46 719 079–46 768 566, előre szálF2CKAP5: 46 742 768–46 846 308, fordított szálCKAP5LRP4: 46 856 717–46 918 642, fordított szálLRP4CSTPP1: 46 936 689–47 165 535, előre szálCSTPP1ARFGAP2: 47 135 667–47 177 474, fordított szálARFGAP2A ATG13 ábrája: 19 exon a(z) 11. kromoszóma előre szálán1. exon: 46 617 553–46 617 890, 338 bázis2. exon: 46 630 045–46 630 100, 56 bázis3. exon: 46 644 279–46 644 360, 82 bázis4. exon: 46 645 339–46 645 419, 81 bázis5. exon: 46 645 870–46 645 989, 120 bázis6. exon: 46 649 137–46 649 183, 47 bázis7. exon: 46 650 177–46 650 317, 141 bázis8. exon: 46 656 233–46 656 273, 41 bázis9. exon: 46 657 095–46 657 191, 97 bázis10. exon: 46 657 524–46 657 622, 99 bázis11. exon: 46 659 392–46 659 485, 94 bázis12. exon: 46 663 997–46 664 095, 99 bázis13. exon: 46 664 849–46 664 959, 111 bázis14. exon: 46 665 383–46 665 519, 137 bázis15. exon: 46 667 773–46 667 887, 115 bázis16. exon: 46 668 499–46 668 576, 78 bázis17. exon: 46 668 794–46 668 910, 117 bázis18. exon: 46 669 404–46 669 532, 129 bázis19. exon: 46 672 255–46 674 518, 2264 bázis151015195′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 57 kb-jából 4,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1653 bázis kódolja a fehérjét.

ATG13 szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a ATG13 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A ATG13 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a ATG13 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2,9%
  • GC-tartalom0,9%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ATG13 gén: autophagy related 13. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/atg13

Vancouver

Dante Labs. ATG13 gén: autophagy related 13 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/atg13

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet