PMS2 gén – A PMS2 gén által okozott Lynch-szindróma rákos megbetegedésekre gyakorolt hatása kisebb, mint az MLH1 vagy az MSH2 géné, azonban a PMS2CL pszeudogén miatt a szokásos genetikai vizsgálatok megbízhatatlanok, ezért a teljes genomszekvenálás (WGS) pontosabb eredményeket nyújt.
A teljes genom szekvenálás a komplex PMS2/PMS2CL pszeudogén régió átvizsgálásával nagyobb pontossággal értékeli a PMS2-t, mint a panelvizsgálat, mivel képes megkülönböztetni a valódi patogén variánsokat a pszeudogén szekvenciáktól.
PMS2 gén – Lynch-szindróma
A PMS2 gén (7p22.1 kromoszóma) egy DNS-mismatch-javító fehérjét kódol. A patogén PMS2-variánsok a MLH1/MSH2-nél alacsonyabb penetranciájú Lynch-szindrómát okoznak – körülbelül 15–20%-os élethosszig tartó vastagbélrák-kockázatot és 15%-os endometriumrák-kockázatot (szemben a MLH1/MSH2 esetében jellemző 50–80%-os vastagbélrák-kockázattal). Az alacsonyabb penetrancia ellenére a PMS2-Lynch-szindróma továbbra is klinikailag jelentős rákos megbetegedés kockázatával jár, ami fokozott megfigyelést igényel.
A PMS2-vel kapcsolatban egyedi vizsgálati kihívás áll fenn: a PMS2CL pszeudogén szekvenciája több mint 98%-ban megegyezik a PMS2 1–5. exonjainak szekvenciájával, ami a szokásos új generációs szekvenálási paneleknél a variánsok téves besorolásához vezet. A pszeudogénben található variánsokat tévesen PMS2-patogén variánsoknak minősíthetik (hamis pozitív eredmények), vagy a valódi PMS2-variánsokat pszeudogén-artefaktumoknak tekinthetik (hamis negatív eredmények). A hosszú távú PCR, a génspecifikus amplifikáció vagy a teljes genomra kiterjedő megközelítések javítják a pontosságot.
A PMS2-Lynch-szindróma kezelése magában foglalja a 25–30 éves kor között 1–2 évente elvégzendő kolonoszkópiát (az alacsonyabb penetrancia miatt későbbi időpontban, mint az MLH1/MSH2 esetében), a hordozó nőknél az endometriumrák szűrését, valamint az aszpirin-alapú kemoprevenció fontolóra vételét. A PMS2-hiányos rákok immunterápiája rendkívül hatékony – az MSI-magas/dMMR tumorok drámai módon reagálnak a pembrolizumabra, függetlenül attól, hogy melyik MMR-gén hiányzik.
A PMS2 pszeudogén, a PMS2CL megnehezíti a szokásos genetikai vizsgálatokat. A variánsokat gyakran tévesen sorolják be. Ha panelvizsgálat során PMS2 „VUS” vagy „patogén” eredményt kapott, javasolt a teljes genomszekvenálás (WGS) segítségével történő megerősítés.
A PMS2 a pszeudogénje miatt a legnehezebben pontosan vizsgálható Lynch-gén. A teljes genom szekvenálása (WGS) a teljes genomikus kontextus elemzésével biztosít kiváló minőségű értékelést, csökkentve a pszeudogén okozta téves pozitív és negatív eredmények számát.
A pszeudogén interferencia PMS2-es téves pozitív és negatív eredményeket okoz – a teljes genomszekvenálás (WGS) tisztázza a kétértelműséget
A szokásos NGS-panelek gyakran tévesen sorolják be a PMS2 és a PMS2CL gén közötti variánsokat. Előfordulhat, hogy egy beteg, akinek PMS2-patogén variánst állapítottak meg, valójában egy jóindulatú pszeudogén variánssal rendelkezik (hamis pozitív eredmény → felesleges megfigyelés). Ezzel szemben egy valódi PMS2-variáns pszeudogén zajként kerülhet kiszűrésre (hamis negatív eredmény → elmulasztott Lynch-diagnózis). A teljes genomiális szekvenálás (WGS) a teljes genomikus kontextust figyelembe veszi, javítva ezzel a variánsok besorolásának pontosságát.
A PMS2-Lynch-típusú rákok reagálnak az immunterápiára – a dMMR-státusz lehetővé teszi a pembrolizumab alkalmazását, függetlenül a konkrét MMR-géntől
A PMS2-hiányos daganatok MSI-pozitívak, és reagálnak az immunellenőrző pont gátlókra. A pembrolizumabot az FDA minden MSI-pozitív/dMMR rák esetében jóváhagyta, függetlenül a származási szövet típusától. A PMS2 csíravonalbeli státuszának megerősítése azonosítja az MSI-pozitív státusz mögött meghúzódó molekuláris mechanizmust, és elindítja a családtagok szűrővizsgálatát.
A teljes DNS-ed (nem csak egy része)
A hagyományos genetikai vizsgálatok csak szűk génköröket vizsgálnak, így a genom nagy része kimarad. Mi a teljes genomját szekvenáljuk – minden gént és a gének közötti minden régiót.
Átfogó elemzések és szakértői jelentések
Könnyen érthető, és olyan válaszokat tartalmaz, amelyek alapján Ön és orvosa cselekedhetnek. Nem egy értelmezésre szoruló dokumentum – több mint 200 klinikai jelentés, kategóriák szerint rendezve.
A vizsgád évről évre egyre értékesebbé válik
A DNS-ed nem változik, de a genomkutatás rohamosan fejlődik. Minden hónapban új összefüggéseket fedeznek fel a variánsok és a betegségek között. Ezeket az eredményeket ellenőrizzük, és a jelentéseidet automatikusan frissítjük. A vizsgálatod évről évre egyre értékesebbé válik.
Az eredmények, amelyekkel az orvosok a legnehezebb eseteket is sikeresen kezelik.
Negyven év bizonytalanság. Egyetlen teszt.
Egy beteg évtizedeken át diagnózis nélkül élt az Egyesült Királyság egészségügyi rendszerében. A glasgow-i Queen Elizabeth University Hospital NHS klinikai csapatai által elfogadott Dante-adatok alapján Noonan-szindrómát és egy eddig fel nem fedezett, leukémiával összefüggő RUNX1-variánst azonosítottak. 40 év után végre megkapták a választ.
A teljes szöveg elolvasása teljes képet ad.
Egy beteg időszakos bénulás kivizsgálása céljából kereste fel a Dante-t. A teljes genom elemzése során egy egyidejűleg fennálló örökletes szívbetegséget – Brugada-szindrómát – azonosítottak, amelyet a beteg kezelőorvosa EKG-vizsgálattal megerősített. Az eredmény egy családtag eddig tisztázatlan szívbetegségének hátterét is megmagyarázta. Egyetlen vizsgálat. Minden válasz benne van.
A szekvenálás 2019-ben történt. Az adatok feldolgozása 2021-ben történt.
Jennifer két évvel azelőtt, hogy mellrákot diagnosztizáltak nála, szekvenáltatta a genomját a Dante segítségével. A kezelés megkezdésekor a Dante farmakogenomikai adatai azt mutatták, hogy az előírt kemoterápia súlyos mellékhatásokat okozhat. Orvosa egy alternatív kezelést választott – így ő már az első naptól kezdve hatékony kezelésben részesült.
Minden genetikai kérdésre teljes körű választ érdemel.
Akár ma válaszokat keres, akár a jövőbeli egészségét szeretné megőrizni, a teljes genomjának feltérképezése az egyetlen kiindulási pont.
Ez a családodban öröklődik. Most már megtudhatod, hogy a génjeidben is benne van-e.
A genomja olyan örökletes variánsokat tartalmaz, amelyek olyan betegségekkel állnak összefüggésben, mint a szívbetegségek, a rák és az idegrendszeri betegségek. Mi mindet elemezzük – olyan klinikai mélységben, amely értelmet ad az eredménynek.
További információk →Amikor a hagyományos laborvizsgálatok szerint minden rendben van. Te viszont tudod, hogy nem így van.
A szokásos diagnosztikai vizsgálatok egy előre meghatározott válaszlehetőségek körét vizsgálják. Mi viszont a teljes DNS-edet szekvenáljuk — beleértve azokat a részeket is, amelyek vizsgálatára eddig egyetlen teszt sem készült. Ha a válasz a genomodban rejlik, mi segítünk megtalálni.
További információk →Lehet, hogy a diagnózisa helyes. Lehet, hogy a kezelési terve nem teljes.
A génjei határozzák meg, melyik kezelésnek van a legnagyobb esélye a sikerre – és melyiknek nincs. Mi biztosítjuk orvosának azokat az eszközöket és információkat, amelyek alapján összeállíthatja a kezelési tervet.
További információk →Jobb, ha előre tudod, mielőtt valami miatt felmerülne a kérdés.
Vannak, akik nem várják meg a diagnózist vagy a családi kórtörténetet, hogy cselekedjenek. A teljes genomszekvenálás már most teljes képet ad a genetikai háttérről – így Ön és orvosa megalapozott döntéseket hozhatnak, mielőtt a helyzet sürgőssé válna.
További információk →Már elvégeztél egy DNS-tesztet. Íme, amit az nem tudott megmondani neked.
A legtöbb fogyasztói DNS-teszt a genom kevesebb mint 0,1%-át vizsgálja. Mi az egészet.
További információk →Klinikai színvonalú eredmények. Magánszemélyek választják, az orvosok pedig a legbonyolultabb esetek kezeléséhez is rábízzák magukat.
A Dante Genome Test segítségével egy brit állami sürgősségi kórház szakemberei azonosítani tudták a Noonan-szindrómát, valamint egy eddig fel nem fedezett, ritka, leukémiával összefüggő genetikai variánst. Ez az eredmény megváltoztatta a beteg kezelését.
A következő szervezetek által akkreditált és a következő kiadványokban megjelent
Gyakori kérdések a teljes genomszekvenálásról.
Mi a különbség a teljes genomszekvenálás és a célzott genetikai vizsgálat között?
A célzott genetikai vizsgálatok – beleértve a szokásos örökletes rákpaneleket is – egy előre meghatározott listát olvasnak le egy adott génkészlet ismert variánsairól. Úgy tervezték őket, hogy azt keressék, amit már előre tudnak. A teljes genomszekvenálás a teljes genomot vizsgálja: mind a 6 milliárd bázispárt, minden gént, minden gének közötti régiót. A JAMA Oncology folyóiratban megjelent Mayo Clinic-tanulmány megállapította, hogy a standard vizsgálati irányelvek az örökletes rákos mutációval rendelkező betegek több mint felét nem észlelték. A Genomtesztnek nincs rögzített listája.
Mit kapok, amikor elkészülnek az eredményeim?
A Dante Genome szolgáltatás több mint 200, orvosok számára kész jelentést biztosít klinikai kategóriák szerint csoportosítva – örökletes rák, szívbetegségek, ritka betegségek, farmakogenomika, hordozói státusz és egyebek. A jelentéseket a biztonságos Genome Manager felületére töltjük fel, és azok formázása közvetlen klinikai felhasználásra alkalmas. A genomadatok tartósan megőrzésre kerülnek, és a tudomány fejlődésével automatikusan újraelemzésre kerülnek.
Mi történik, ha klinikailag jelentős variánst találnak?
Ha kórokozó vagy valószínűleg kórokozó variánst azonosítunk, azt egyértelműen jelöljük az Ön orvos számára készített jelentésében, amely tartalmazza a klinikai összefüggéseket, a publikált bizonyítékokat és az ajánlott további lépéseket. Javasoljuk, hogy minden klinikailag jelentős eredményt ossza meg kezelőorvosával vagy egy genetikai tanácsadóval, aki segítséget nyújthat a megfigyeléssel, a kockázatcsökkentéssel vagy a családtagok kaszkádvizsgálatával kapcsolatos döntések meghozatalában.
Miben különbözik ez az olyan fogyasztói DNS-tesztektől, mint a 23andMe vagy az AncestryDNA?
A fogyasztói DNS-tesztek olyan genotípus-meghatározó chipeket használnak, amelyek a genom kevesebb mint 0,1%-át olvassák le – ez egy apró, előre kiválasztott halmaz a gyakori variánsokból. Ezeket az ősök és a populációs szintű jellemzők vizsgálatára optimalizálták, nem pedig klinikai genetikai eredmények megállapítására. A Dante Genomteszt a genom 100%-át szekvenálja 30-szoros lefedettséggel, ami ugyanaz a szabvány, mint a klinikai diagnosztikában. A két teszt nem összehasonlítható sem hatókörét, sem módszertanát, sem klinikai hasznosságát tekintve.
Mennyi idő alatt láthatók az eredmények, és hogyan kapjuk meg őket?
A mintavételi készletet a megrendeléstől számított 48 órán belül postázzuk. Amint a mintája megérkezik a CLIA-tanúsítvánnyal rendelkező laboratóriumunkba, a szekvenálás és az elemzés 6–8 hetet vesz igénybe. Az eredményeket biztonságosan a Genome Manager fiókjába továbbítjuk, ahol hozzáférhet a jelentésekhez, megoszthatja azokat orvosával, és automatikus értesítéseket kaphat, amint új eredményeket igazolnak a genomjával összehasonlítva.
Világszerte együttműködünk betegjogi szervezetekkel.
A Dante Labs bármilyen méretű betegjogi szervezettel együttműködik – a PMS2 génnel kapcsolatos – Lynch-szindróma, valamint egyéb ritka és gyakori betegségek területén. Bármely országban működő szervezeteket támogatunk, beleértve a virtuális betegjogi szervezeteket is.
Személyre szabott jelentéseket, csoportos kedvezményeket és a tagjaik igényeire szabott csomagokat kínálunk. Kérjük, vegye fel velünk a kapcsolatot az űrlapon keresztül, és két munkanapon belül visszahívjuk.
- Személyre szabott genomikai jelentések a tagjaid számára
- Csoportos kedvezmények és személyre szabott csomagok
- Bármely ország – beleértve a virtuális csoportokat is
- A lefedett ritka és gyakori betegségek
Üzenet fogadva.
2 munkanapon belül felvesszük Önnel a kapcsolatot. Ha közvetlenül szeretne kapcsolatba lépni velünk: hello@dantelabs.com
Egy teszt.
Egy életre szóló válaszok.
Egy készlet, házhoz szállítva. Teljes genomjának szekvenálása a diagnosztikai döntésekhez használt klinikai szabvány szerint. Több mint 200 orvosok számára kész jelentés, amelyet 6–8 héten belül elküldünk a Genome Manager fiókjába — végleges és a tudomány fejlődésével folyamatosan frissül.
48 órán belül kiszállítjuk · Az eredmények 6–8 héten belül
