Peutz–Jeghers-szindróma – örökletes hamartóma-szindróma, amely hat szervrendszerben összesen 85%-ot meghaladó kumulatív rákkockázattal jár, és amelynek megfigyelése már gyermekkorban meg kell kezdődjön.
Az STK11 szerepel az ACMG SF v3.2 másodlagos leletek listáján. A teljes genom szekvenálás lehetővé teszi az STK11 gén teljes jellemzését, beleértve azokat a nagy genomikus deléciókat is, amelyek a PJS-esetek mintegy 30%-át teszik ki, és amelyeket a szokásos szekvenálási panelek nem képesek megbízhatóan kimutatni.
Peutz–Jeghers-szindróma
A Peutz–Jeghers-szindróma (PJS) egy autoszomális domináns öröklődésű gyomor-bélrendszeri polipózis és rákra való hajlamot okozó szindróma, amelyet a 19p13.3 kromoszómán található STK11 (szerin/treonin-kináz 11, más néven LKB1) gén csíravonalbeli patogén variánsai okoznak. Az STK11 gén egy tumor szuppresszor kinázt kódol, amely aktiválja az AMPK-t, és szabályozza a sejtek polaritását és az energia-anyagcserét. A PJS-t a gyomor-bélrendszer egészében (leginkább a vékonybélben) kialakuló jellegzetes hamartomatózus polipok, a jellegzetes nyálkahártya- és bőrpigmentáció (melaninfoltok az ajkakon, a szájnyálkahártyán, az ujjakon és a végbélnyílás környékén), valamint a több szervre kiterjedő, drámaian megnövekedett rákkockázat jellemzi. A PJS prevalenciája körülbelül 1:50 000–200 000.
A PJS-ben az élethosszig tartó kumulatív rákos megbetegedés kockázata rendkívül magas – 70 éves korra bármely rákos megbetegedés esetében 85%-ra becsülik. Az egyes rákfajtákra vonatkozó élethosszig tartó kockázatok a következők: gyomor-bélrendszeri rákok (vékonybél ~13%, vastagbél és végbél ~40%, gyomor ~29%), hasnyálmirigyrák (~36%), emlőrák (~54% a nőknél), nőgyógyászati rákok (méhnyak-adenokarcinóma ~10%, méh ~9%, gyűrűs tubulusos petefészek-szexkord tumor ~21%) és tüdőrák (~15%). A szűrésnek már gyermekkorban meg kell kezdődnie, és egyszerre több szervrendszert kell magában foglalnia. A vékonybélpolipok gyermekkorban visszatérő intusszuszcepciót okoznak, ami gyakran sürgősségi műtétet igényel — ez megelőzhető a vékonybél rendszeres megfigyelésével és profilaktikus polipektómiával, ha nagy polipokat azonosítanak.
A szindrómás diagnosztikai kritériumoknak megfelelő PJS-esetek körülbelül 94–96%-ában azonosítható STK11 patogén variáns található. Az MLPA-val vagy a kópiaszám-variáns elemzéssel kimutatható nagy deléciók vagy duplikációk az STK11 patogén variánsok körülbelül 30%-át teszik ki – ezeket a kizárólag exon-szekvenálásra épülő standard panelek nem észlelik. A fennmaradó ~4–6% klinikai PJS-eset, amelyekben nem mutathatók ki STK11-variánsok, szomatikus mozaikosságot, mély intronvariánsokat vagy genetikai heterogenitást jelenthet. Az STK11 szerepel az ACMG SF v3.2 másodlagos leletek listáján, ami tükrözi a hatékony szűrővizsgálati beavatkozások rendelkezésre állását, amelyek jelentősen csökkentik a rákos halálozást a megerősített hordozók körében.
Az STK11 gén kórokozó variánsainak 30%-a olyan nagy deléció, amelyet a szokásos szekvenálási panelek nem észlelnek. Egy olyan szindróma esetében, ahol a rákmegfigyelést már gyermekkorban el kell kezdeni, a téves diagnózis egész életre szóló következményekkel jár.
A PJS-t okozó STK11-variánsok egyharmada deléció – a szokásos szekvenálási panelek ezeket nem észlelik
A megerősített STK11 patogén variánsok körülbelül 30%-a egy vagy több exont átfogó nagy genomikus deléció. Az STK11 kódoló exonjait szekvenáló szokásos új generációs szekvenálási panelek nem képesek megbízhatóan kimutatni a nagy deléciókat speciális kópiaszám-variáns elemzés nélkül. Számos publikált PJS-család esetében, amelyek teljes klinikai fenotípussal rendelkeztek – nyálkahártya- és bőrpigmentáció, többszörös hamartomatózus polipok és jellegzetes családi anamnézis –, kiderült, hogy STK11-deléciók voltak jelen, amelyek hónapokkal vagy évekkel megelőzték a negatív paneleredményeket. Egy olyan szindróma esetében, ahol a gyermekek vékonybél-megfigyelése 8 éves korban kezdődik (NCCN-ajánlás), a hasnyálmirigy-megfigyelése pedig 35 éves korban, egy ilyen mértékű diagnosztikai késedelem közvetlen következményekkel jár a rákmegelőzésre nézve.
A PJS-szűrés egyszerre hat különböző rákfajtát ölel fel – a teljes protokoll elindításához egyetlen, végleges diagnózisra van szükség
Az STK11 molekuláris diagnózis felállítása egy többszervi megfigyelési protokollt indít el, amely jelentősen eltér a szokásos rák-szűrési ajánlásoktól. Az NCCN PJS irányelvek a következőket javasolják: felső gyomor- és vastagbél-endoszkópia 8–10 éves kortól; vékonybél-endoszkópia vagy kapszulás endoszkópia 8–10 éves kortól; éves emlő-MRI 25 éves kortól, mammográfia 30 éves kortól; éves kismedencei ultrahang vagy endometriumvizsgálat 18 éves kortól; hasnyálmirigy-megfigyelés 35 éves kortól (endoszkópos ultrahang/MRI); valamint hereszűrés férfiaknál születéstől kezdve (SCTAT-kockázat). Egyetlen standard rák szűrőprogram sem fedi le mindezeket – a megerősített PJS molekuláris diagnózis az előfeltétele annak az átfogó protokollnak, amely a megfigyelést értelmesvé teszi.
A teljes DNS-ed (nem csak egy része)
A hagyományos genetikai vizsgálatok csak szűk génköröket vizsgálnak, így a genom nagy része kimarad. Mi a teljes genomját szekvenáljuk – minden gént és a gének közötti minden régiót.
Átfogó elemzések és szakértői jelentések
Könnyen érthető, és olyan válaszokat tartalmaz, amelyek alapján Ön és orvosa cselekedhetnek. Nem egy értelmezésre szoruló dokumentum – több mint 200 klinikai jelentés, kategóriák szerint rendezve.
A vizsgád évről évre egyre értékesebbé válik
A DNS-ed nem változik, de a genomkutatás rohamosan fejlődik. Minden hónapban új összefüggéseket fedeznek fel a variánsok és a betegségek között. Ezeket az eredményeket ellenőrizzük, és a jelentéseidet automatikusan frissítjük. A vizsgálatod évről évre egyre értékesebbé válik.
Az eredmények, amelyekkel az orvosok a legnehezebb eseteket is sikeresen kezelik.
Negyven év bizonytalanság. Egyetlen teszt.
Egy beteg évtizedeken át diagnózis nélkül élt az Egyesült Királyság egészségügyi rendszerében. A glasgow-i Queen Elizabeth University Hospital NHS klinikai csapatai által elfogadott Dante-adatok alapján Noonan-szindrómát és egy eddig fel nem fedezett, leukémiával összefüggő RUNX1-variánst azonosítottak. 40 év után végre megkapták a választ.
A teljes szöveg elolvasása teljes képet ad.
Egy beteg időszakos bénulás kivizsgálása céljából kereste fel a Dante-t. A teljes genom elemzése során egy egyidejűleg fennálló örökletes szívbetegséget – Brugada-szindrómát – azonosítottak, amelyet a beteg kezelőorvosa EKG-vizsgálattal megerősített. Az eredmény egy családtag eddig tisztázatlan szívbetegségének hátterét is megmagyarázta. Egyetlen vizsgálat. Minden válasz benne van.
A szekvenálás 2019-ben történt. Az adatok feldolgozása 2021-ben történt.
Jennifer két évvel azelőtt, hogy mellrákot diagnosztizáltak nála, szekvenáltatta a genomját a Dante segítségével. A kezelés megkezdésekor a Dante farmakogenomikai adatai azt mutatták, hogy az előírt kemoterápia súlyos mellékhatásokat okozhat. Orvosa egy alternatív kezelést választott – így ő már az első naptól kezdve hatékony kezelésben részesült.
Minden genetikai kérdésre teljes körű választ érdemel.
Akár ma válaszokat keres, akár a jövőbeli egészségét szeretné megőrizni, a teljes genomjának feltérképezése az egyetlen kiindulási pont.
Ez a családodban öröklődik. Most már megtudhatod, hogy a génjeidben is benne van-e.
A genomja olyan örökletes variánsokat tartalmaz, amelyek olyan betegségekkel állnak összefüggésben, mint a szívbetegségek, a rák és az idegrendszeri betegségek. Mi mindet elemezzük – olyan klinikai mélységben, amely értelmet ad az eredménynek.
További információk →Amikor a hagyományos laborvizsgálatok szerint minden rendben van. Te viszont tudod, hogy nem így van.
A szokásos diagnosztikai vizsgálatok egy előre meghatározott válaszlehetőségek körét vizsgálják. Mi viszont a teljes DNS-edet szekvenáljuk — beleértve azokat a részeket is, amelyek vizsgálatára eddig egyetlen teszt sem készült. Ha a válasz a genomodban rejlik, mi segítünk megtalálni.
További információk →Lehet, hogy a diagnózisa helyes. Lehet, hogy a kezelési terve nem teljes.
A génjei határozzák meg, melyik kezelésnek van a legnagyobb esélye a sikerre – és melyiknek nincs. Mi biztosítjuk orvosának azokat az eszközöket és információkat, amelyek alapján összeállíthatja a kezelési tervet.
További információk →Jobb, ha előre tudod, mielőtt valami miatt felmerülne a kérdés.
Vannak, akik nem várják meg a diagnózist vagy a családi kórtörténetet, hogy cselekedjenek. A teljes genomszekvenálás már most teljes képet ad a genetikai háttérről – így Ön és orvosa megalapozott döntéseket hozhatnak, mielőtt a helyzet sürgőssé válna.
További információk →Már elvégeztél egy DNS-tesztet. Íme, amit az nem tudott megmondani neked.
A legtöbb fogyasztói DNS-teszt a genom kevesebb mint 0,1%-át vizsgálja. Mi az egészet.
További információk →Klinikai színvonalú eredmények. Magánszemélyek választják, az orvosok pedig a legbonyolultabb esetek kezeléséhez is rábízzák magukat.
A Dante Genome Test segítségével egy brit állami sürgősségi kórház szakemberei azonosítani tudták a Noonan-szindrómát, valamint egy eddig fel nem fedezett, ritka, leukémiával összefüggő genetikai variánst. Ez az eredmény megváltoztatta a beteg kezelését.
A következő szervezetek által akkreditált és a következő kiadványokban megjelent
Gyakori kérdések a teljes genomszekvenálásról.
Mi a különbség a teljes genomszekvenálás és a célzott genetikai vizsgálat között?
A célzott genetikai vizsgálatok – beleértve a szokásos örökletes rákpaneleket is – egy előre meghatározott listát olvasnak le egy adott génkészlet ismert variánsairól. Úgy tervezték őket, hogy azt keressék, amit már előre tudnak. A teljes genomszekvenálás a teljes genomot vizsgálja: mind a 6 milliárd bázispárt, minden gént, minden gének közötti régiót. A JAMA Oncology folyóiratban megjelent Mayo Clinic-tanulmány megállapította, hogy a standard vizsgálati irányelvek az örökletes rákos mutációval rendelkező betegek több mint felét nem észlelték. A Genomtesztnek nincs rögzített listája.
Mit kapok, amikor elkészülnek az eredményeim?
A Dante Genome szolgáltatás több mint 200, orvosok számára kész jelentést biztosít klinikai kategóriák szerint csoportosítva – örökletes rák, szívbetegségek, ritka betegségek, farmakogenomika, hordozói státusz és egyebek. A jelentéseket a biztonságos Genome Manager felületére töltjük fel, és azok formázása közvetlen klinikai felhasználásra alkalmas. A genomadatok tartósan megőrzésre kerülnek, és a tudomány fejlődésével automatikusan újraelemzésre kerülnek.
Mi történik, ha klinikailag jelentős variánst találnak?
Ha kórokozó vagy valószínűleg kórokozó variánst azonosítunk, azt egyértelműen jelöljük az Ön orvos számára készített jelentésében, amely tartalmazza a klinikai összefüggéseket, a publikált bizonyítékokat és az ajánlott további lépéseket. Javasoljuk, hogy minden klinikailag jelentős eredményt ossza meg kezelőorvosával vagy egy genetikai tanácsadóval, aki segítséget nyújthat a megfigyeléssel, a kockázatcsökkentéssel vagy a családtagok kaszkádvizsgálatával kapcsolatos döntések meghozatalában.
Miben különbözik ez az olyan fogyasztói DNS-tesztektől, mint a 23andMe vagy az AncestryDNA?
A fogyasztói DNS-tesztek olyan genotípus-meghatározó chipeket használnak, amelyek a genom kevesebb mint 0,1%-át olvassák le – ez egy apró, előre kiválasztott halmaz a gyakori variánsokból. Ezeket az ősök és a populációs szintű jellemzők vizsgálatára optimalizálták, nem pedig klinikai genetikai eredmények megállapítására. A Dante Genomteszt a genom 100%-át szekvenálja 30-szoros lefedettséggel, ami ugyanaz a szabvány, mint a klinikai diagnosztikában. A két teszt nem összehasonlítható sem hatókörét, sem módszertanát, sem klinikai hasznosságát tekintve.
Mennyi idő alatt láthatók az eredmények, és hogyan kapjuk meg őket?
A mintavételi készletet a megrendeléstől számított 48 órán belül postázzuk. Amint a mintája megérkezik a CLIA-tanúsítvánnyal rendelkező laboratóriumunkba, a szekvenálás és az elemzés 6–8 hetet vesz igénybe. Az eredményeket biztonságosan a Genome Manager fiókjába továbbítjuk, ahol hozzáférhet a jelentésekhez, megoszthatja azokat orvosával, és automatikus értesítéseket kaphat, amint új eredményeket igazolnak a genomjával összehasonlítva.
Világszerte együttműködünk betegjogi szervezetekkel.
A Dante Labs bármilyen méretű betegjogi szervezettel együttműködik – a Peutz-Jeghers-szindróma és egyéb, ritka vagy gyakori betegségek területén. Bármely országban működő szervezeteket támogatunk, beleértve a virtuális betegjogi szervezeteket is.
Személyre szabott jelentéseket, csoportos kedvezményeket és a tagjaik igényeire szabott csomagokat kínálunk. Kérjük, vegye fel velünk a kapcsolatot az űrlapon keresztül, és két munkanapon belül visszahívjuk.
- Személyre szabott genomikai jelentések a tagjaid számára
- Csoportos kedvezmények és személyre szabott csomagok
- Bármely ország – beleértve a virtuális csoportokat is
- A lefedett ritka és gyakori betegségek
Üzenet fogadva.
2 munkanapon belül felvesszük Önnel a kapcsolatot. Ha közvetlenül szeretne kapcsolatba lépni velünk: hello@dantelabs.com
Egy teszt.
Egy életre szóló válaszok.
Egy készlet, házhoz szállítva. Teljes genomjának szekvenálása a diagnosztikai döntésekhez használt klinikai szabvány szerint. Több mint 200 orvosok számára kész jelentés, amelyet 6–8 héten belül elküldünk a Genome Manager fiókjába — végleges és a tudomány fejlődésével folyamatosan frissül.
48 órán belül kiszállítjuk · Az eredmények 6–8 héten belül
