Mitokondriális betegség – 5 000 emberből 1-et érint, és a mitokondriális vagy a sejtmag-genom variánsai okozzák; ebben az esetben a teljes genomszekvenálás az egyetlen olyan vizsgálat, amely mindkét genomot egyszerre képes értékelni.
A teljes genom szekvenálás során a teljes mitokondriális genom (37 gén) és a mitokondriális fehérjéket kódoló több mint 300 maggén is leolvasásra kerül – ezáltal megoldva azt a kettős genomra vonatkozó diagnosztikai kihívást, amely miatt a mitokondriális betegségek az orvostudomány egyik legnehezebb molekuláris diagnózisát jelentik.
Mitokondriális betegség
A mitokondriális betegségek egy heterogén rendellenességcsoportot alkotnak, melyeket az oxidatív foszforiláció (OXPHOS) zavara okoz – ez az a mitokondriális energia-termelő folyamat, amely a sejtek ATP-jének mintegy 90%-át állítja elő. Ezek a rendellenességek genetikailag egyediek, mivel a mitokondriális funkció két genomtól függ: a mitokondriális genomtól (mtDNA, 37 gén, amely 13 OXPHOS alegységet, 22 tRNS-t és 2 rRNS-t kódol) és a sejtmaggenomtól (amely ~1500 mitokondriális célú fehérjét kódol, beleértve az OXPHOS szerkezeti faktorokat, az mtDNA karbantartó enzimeket és az anyagcsere-enzimeket). A kombinált prevalencia körülbelül 1 az 5000-hez, ami a mitokondriális betegségeket a leggyakoribb örökletes anyagcsere-betegségek közé sorolja.
A klinikai kép a szövetek energiaigényét tükrözi: elsősorban a magas anyagcseréjű szervek érintettek. A gyakori tünetek közé tartozik a progresszív külső szemmozgászavar (CPEO), a szemhéjlecsúszás, a myopathia, a cardiomyopathia, a szenzorineurális halláskárosodás, a diabetes mellitus, a rohamok, a stroke-szerű epizódok, az ataxia, a perifériás neuropathia, a retinális degeneráció és a tejsavas acidózis. A jól definiált mitokondriális szindrómák közé tartozik a MELAS (mitokondriális encephalopathia, tejsavas acidózis, stroke-szerű epizódok – jellemzően m.3243A>G az MT-TL1-ben), a MERRF (mioklonikus epilepszia ragged-red rostokkal – m.8344A>G az MT-TK-ban), a Kearns-Sayre-szindróma (CPEO, pigmentos retinopátia, szívvezetési zavarok – nagy mtDNS-deléciók) és a Leigh-szindróma (progresszív agytörzsi és bazális ganglionok neurodegeneratív elváltozásai – többféle genetikai ok).
A mitokondriális betegségek genetikai összetettsége egyedülálló diagnosztikai kihívásokat jelent. Az mtDNA-variánsok anyai öröklődést követnek, változó heteroplazmiával (az egyes szövetekben a mutáns és a vad típusú mtDNA aránya, amely meghatározza a klinikai súlyosságot). A nukleáris génvariánsok a standard mendeli öröklődést követik. Ugyanazt a klinikai szindrómát okozhatják akár mtDNA-, akár nukleáris variánsok (pl. a Leigh-szindrómának több mint 90 genetikai oka van). A kizárólag mtDNA-ra, majd nukleáris panelekre irányuló egymást követő vizsgálatok hónapokkal vagy évekkel késleltetik a diagnózist. A WGS mindkét genomot egyszerre értékeli – ez az egyetlen klinikailag elérhető teszt, amely ezt megteszi.
Az mtDNA-heteroplazmia – azaz a mutáns és a vad típusú mitokondriális genomok aránya – határozza meg a klinikai súlyosságot. A teljes genomszekvenálás (WGS) számszerűsíti a heteroplazmia mértékét, és olyan prognosztikai információkat nyújt, amelyek alacsony heteroplazmia-szint esetén a célzott mtDNA-vizsgálatok során kimaradhatnak.
A mitokondriális betegségeket két különálló genom variánsai okozzák. Ha egyszerre csak az egyik genomot vizsgálják, az hónapokkal késlelteti a diagnózist. A teljes genomszekvenálás (WGS) egyszerre vizsgálja mind az mtDNS-t, mind a sejtmag-DNS-t – ez az egyetlen ilyen vizsgálat.
Két genom vizsgálata egyetlen tesztben – a teljes genomszekvenálás (WGS) egyszerre olvassa le mind a mitokondriális DNS-t, mind a több mint 300 mitokondriális nukleáris gént
A mitokondriális betegségek hagyományos kivizsgálása egymást követő vizsgálatokból áll: először a mtDNS szekvenálása, majd (ha az eredmény negatív) a nukleáris génpanelek vizsgálata, végül (ha az eredmény továbbra is negatív) a nukleáris DNS teljes exomszekvenálása. Minden lépés hetekig vagy hónapokig tart, és sok beteg évekig tartó diagnosztikai odüsszeát él át. A WGS egyetlen vérmintából, egyetlen vizsgálattal értékeli a teljes mitokondriális genomot (beleértve a heteroplazmia kvantifikálását) és az összes nukleáris kódolású mitokondriális gént. Ez a párhuzamos értékelés egyszerre azonosítja mind az mtDNS-t, mind a nukleáris variánsokat, kiküszöbölve a szekvenciális vizsgálatok késedelmét.
A mitokondriális DNS-ben előforduló nagy deléciók a Kearns-Sayre-szindrómát és a CPEO-t okozzák – ezeket a mitokondriális DNS pontmutációs vizsgálati panelek nem észlelik
Egyetlen, nagyméretű mtDNS-deléció (jellemzően a 4 977 bázispáros „gyakori deléció” vagy más, 1–10 kb közötti egyedi deléciók) okozza a Kearns–Sayre-szindrómát, a krónikus progresszív külső szemmozgási zavart és a Pearson-szindrómát. A szokásos mtDNA pontmutációs panelek (amelyek specifikus nukleotidpozíciókat vizsgálnak) nem észlelik ezeket a deléciókat – ezekhez Southern blot, hosszú távú PCR vagy a teljes mitokondriális genom szekvenálása szükséges. A WGS a teljes mitokondriális genomot átolvassa, észlelve mind a pontvariánsokat, mind a szerkezeti átrendeződéseket, beleértve a deléciókat, duplikációkat és átrendeződéseket.
A teljes DNS-ed (nem csak egy része)
A hagyományos genetikai vizsgálatok csak szűk génköröket vizsgálnak, így a genom nagy része kimarad. Mi a teljes genomját szekvenáljuk – minden gént és a gének közötti minden régiót.
Átfogó elemzések és szakértői jelentések
Könnyen érthető, és olyan válaszokat tartalmaz, amelyek alapján Ön és orvosa cselekedhetnek. Nem egy értelmezésre szoruló dokumentum – több mint 200 klinikai jelentés, kategóriák szerint rendezve.
A vizsgád évről évre egyre értékesebbé válik
A DNS-ed nem változik, de a genomkutatás rohamosan fejlődik. Minden hónapban új összefüggéseket fedeznek fel a variánsok és a betegségek között. Ezeket az eredményeket ellenőrizzük, és a jelentéseidet automatikusan frissítjük. A vizsgálatod évről évre egyre értékesebbé válik.
Az eredmények, amelyekkel az orvosok a legnehezebb eseteket is sikeresen kezelik.
Negyven év bizonytalanság. Egyetlen teszt.
Egy beteg évtizedeken át diagnózis nélkül élt az Egyesült Királyság egészségügyi rendszerében. A glasgow-i Queen Elizabeth University Hospital NHS klinikai csapatai által elfogadott Dante-adatok alapján Noonan-szindrómát és egy eddig fel nem fedezett, leukémiával összefüggő RUNX1-variánst azonosítottak. 40 év után végre megkapták a választ.
A teljes szöveg elolvasása teljes képet ad.
Egy beteg időszakos bénulás kivizsgálása céljából kereste fel a Dante-t. A teljes genom elemzése során egy egyidejűleg fennálló örökletes szívbetegséget – Brugada-szindrómát – azonosítottak, amelyet a beteg kezelőorvosa EKG-vizsgálattal megerősített. Az eredmény egy családtag eddig tisztázatlan szívbetegségének hátterét is megmagyarázta. Egyetlen vizsgálat. Minden válasz benne van.
A szekvenálás 2019-ben történt. Az adatok feldolgozása 2021-ben történt.
Jennifer két évvel azelőtt, hogy mellrákot diagnosztizáltak nála, szekvenáltatta a genomját a Dante segítségével. A kezelés megkezdésekor a Dante farmakogenomikai adatai azt mutatták, hogy az előírt kemoterápia súlyos mellékhatásokat okozhat. Orvosa egy alternatív kezelést választott – így ő már az első naptól kezdve hatékony kezelésben részesült.
Minden genetikai kérdésre teljes körű választ érdemel.
Akár ma válaszokat keres, akár a jövőbeli egészségét szeretné megőrizni, a teljes genomjának feltérképezése az egyetlen kiindulási pont.
Ez a családodban öröklődik. Most már megtudhatod, hogy a génjeidben is benne van-e.
A genomja olyan örökletes variánsokat tartalmaz, amelyek olyan betegségekkel állnak összefüggésben, mint a szívbetegségek, a rák és az idegrendszeri betegségek. Mi mindet elemezzük – olyan klinikai mélységben, amely értelmet ad az eredménynek.
További információk →Amikor a hagyományos laborvizsgálatok szerint minden rendben van. Te viszont tudod, hogy nem így van.
A szokásos diagnosztikai vizsgálatok egy előre meghatározott válaszlehetőségek körét vizsgálják. Mi viszont a teljes DNS-edet szekvenáljuk — beleértve azokat a részeket is, amelyek vizsgálatára eddig egyetlen teszt sem készült. Ha a válasz a genomodban rejlik, mi segítünk megtalálni.
További információk →Lehet, hogy a diagnózisa helyes. Lehet, hogy a kezelési terve nem teljes.
A génjei határozzák meg, melyik kezelésnek van a legnagyobb esélye a sikerre – és melyiknek nincs. Mi biztosítjuk orvosának azokat az eszközöket és információkat, amelyek alapján összeállíthatja a kezelési tervet.
További információk →Jobb, ha előre tudod, mielőtt valami miatt felmerülne a kérdés.
Vannak, akik nem várják meg a diagnózist vagy a családi kórtörténetet, hogy cselekedjenek. A teljes genomszekvenálás már most teljes képet ad a genetikai háttérről – így Ön és orvosa megalapozott döntéseket hozhatnak, mielőtt a helyzet sürgőssé válna.
További információk →Már elvégeztél egy DNS-tesztet. Íme, amit az nem tudott megmondani neked.
A legtöbb fogyasztói DNS-teszt a genom kevesebb mint 0,1%-át vizsgálja. Mi az egészet.
További információk →Klinikai színvonalú eredmények. Magánszemélyek választják, az orvosok pedig a legbonyolultabb esetek kezeléséhez is rábízzák magukat.
A Dante Genome Test segítségével egy brit állami sürgősségi kórház szakemberei azonosítani tudták a Noonan-szindrómát, valamint egy eddig fel nem fedezett, ritka, leukémiával összefüggő genetikai variánst. Ez az eredmény megváltoztatta a beteg kezelését.
A következő szervezetek által akkreditált és a következő kiadványokban megjelent
Gyakori kérdések a teljes genomszekvenálásról.
Mi a különbség a teljes genomszekvenálás és a célzott genetikai vizsgálat között?
A célzott genetikai vizsgálatok – beleértve a szokásos örökletes rákpaneleket is – egy előre meghatározott listát olvasnak le egy adott génkészlet ismert variánsairól. Úgy tervezték őket, hogy azt keressék, amit már előre tudnak. A teljes genomszekvenálás a teljes genomot vizsgálja: mind a 6 milliárd bázispárt, minden gént, minden gének közötti régiót. A JAMA Oncology folyóiratban megjelent Mayo Clinic-tanulmány megállapította, hogy a standard vizsgálati irányelvek az örökletes rákos mutációval rendelkező betegek több mint felét nem észlelték. A Genomtesztnek nincs rögzített listája.
Mit kapok, amikor elkészülnek az eredményeim?
A Dante Genome szolgáltatás több mint 200, orvosok számára kész jelentést biztosít klinikai kategóriák szerint csoportosítva – örökletes rák, szívbetegségek, ritka betegségek, farmakogenomika, hordozói státusz és egyebek. A jelentéseket a biztonságos Genome Manager felületére töltjük fel, és azok formázása közvetlen klinikai felhasználásra alkalmas. A genomadatok tartósan megőrzésre kerülnek, és a tudomány fejlődésével automatikusan újraelemzésre kerülnek.
Mi történik, ha klinikailag jelentős variánst találnak?
Ha kórokozó vagy valószínűleg kórokozó variánst azonosítunk, azt egyértelműen jelöljük az Ön orvos számára készített jelentésében, amely tartalmazza a klinikai összefüggéseket, a publikált bizonyítékokat és az ajánlott további lépéseket. Javasoljuk, hogy minden klinikailag jelentős eredményt ossza meg kezelőorvosával vagy egy genetikai tanácsadóval, aki segítséget nyújthat a megfigyeléssel, a kockázatcsökkentéssel vagy a családtagok kaszkádvizsgálatával kapcsolatos döntések meghozatalában.
Miben különbözik ez az olyan fogyasztói DNS-tesztektől, mint a 23andMe vagy az AncestryDNA?
A fogyasztói DNS-tesztek olyan genotípus-meghatározó chipeket használnak, amelyek a genom kevesebb mint 0,1%-át olvassák le – ez egy apró, előre kiválasztott halmaz a gyakori variánsokból. Ezeket az ősök és a populációs szintű jellemzők vizsgálatára optimalizálták, nem pedig klinikai genetikai eredmények megállapítására. A Dante Genomteszt a genom 100%-át szekvenálja 30-szoros lefedettséggel, ami ugyanaz a szabvány, mint a klinikai diagnosztikában. A két teszt nem összehasonlítható sem hatókörét, sem módszertanát, sem klinikai hasznosságát tekintve.
Mennyi idő alatt láthatók az eredmények, és hogyan kapjuk meg őket?
A mintavételi készletet a megrendeléstől számított 48 órán belül postázzuk. Amint a mintája megérkezik a CLIA-tanúsítvánnyal rendelkező laboratóriumunkba, a szekvenálás és az elemzés 6–8 hetet vesz igénybe. Az eredményeket biztonságosan a Genome Manager fiókjába továbbítjuk, ahol hozzáférhet a jelentésekhez, megoszthatja azokat orvosával, és automatikus értesítéseket kaphat, amint új eredményeket igazolnak a genomjával összehasonlítva.
Világszerte együttműködünk betegjogi szervezetekkel.
A Dante Labs bármilyen méretű betegjogi szervezettel együttműködik – a mitokondriális betegségek és egyéb, ritka vagy gyakori betegségek területén. Bármely országban működő szervezeteket támogatunk, beleértve a virtuális betegjogi szervezeteket is.
Személyre szabott jelentéseket, csoportos kedvezményeket és a tagjaik igényeire szabott csomagokat kínálunk. Kérjük, vegye fel velünk a kapcsolatot az űrlapon keresztül, és két munkanapon belül visszahívjuk.
- Személyre szabott genomikai jelentések a tagjaid számára
- Csoportos kedvezmények és személyre szabott csomagok
- Bármely ország – beleértve a virtuális csoportokat is
- A lefedett ritka és gyakori betegségek
Üzenet fogadva.
2 munkanapon belül felvesszük Önnel a kapcsolatot. Ha közvetlenül szeretne kapcsolatba lépni velünk: hello@dantelabs.com
Egy teszt.
Egy életre szóló válaszok.
Egy készlet, házhoz szállítva. Teljes genomjának szekvenálása a diagnosztikai döntésekhez használt klinikai szabvány szerint. Több mint 200 orvosok számára kész jelentés, amelyet 6–8 héten belül elküldünk a Genome Manager fiókjába — végleges és a tudomány fejlődésével folyamatosan frissül.
48 órán belül kiszállítjuk · Az eredmények 6–8 héten belül
