Családi adenomatosus polipózis – az APC gén funkcióvesztése miatt kialakuló több száz vagy akár több ezer vastagbélpolip, amelyek műtéti beavatkozás nélkül szinte biztosan rákos elváltozássá alakulnak át.
A teljes genom szekvenálás során az APC gén teljes szekvenciáját leolvasják – beleértve a mély intronrégiókat, a nagy deléciókat és a mozaikszerű variánsokat is, amelyeket a hagyományos örökletes rákpanelek rendszeresen nem képesek kimutatni.
Családi adenomatózus polipózis
A familiáris adenomatosus polipózis (FAP) egy autoszomális domináns örökletes kolorektális rákos szindróma, amelyet az 5q22.2 kromoszómán található APC (adenomatosus polipózis coli) tumor szuppresszor gén kórokozó variánsai okoznak. A klasszikus FAP-ra jellemző, hogy a vastagbélben több száz vagy akár több ezer adenomatosus polip alakul ki, amelyek általában az élet második évtizedében jelennek meg. Sebészeti beavatkozás nélkül a vastagbélrák az ötödik évtizedre gyakorlatilag elkerülhetetlen – a kezeletlen klasszikus FAP esetén az élethosszig tartó vastagbélrák kockázata megközelíti a 100%-ot. A FAP az összes vastagbélrák körülbelül 0,5–1%-át teszi ki, és becslések szerint 5 000–10 000 emberből 1-et érint.
Az enyhített FAP (AFAP) egy enyhébb fenotípusváltozat, amelyet az APC gén meghatározott régióiban (az 5'-végén, a 9. exonban vagy a 3'-végén) előforduló variánsok okoznak, és amelyre jellemző a kevesebb polip (10–100), a polipózis későbbi megjelenése, az alacsonyabb, de még mindig jelentősen megnövekedett vastagbélrák-kockázat, valamint a változatosabb megnyilvánulás. A FAP genotípus-fenotípus összefüggései jól ismertek: a 1250–1464 kodonok (különösen a 1309. kodon) variánsai sűrű polipózissal és korai vastagbélrákkal társulnak; a 1310–1330 és 1445–1580 kodonok variánsai a desmoid tumorok magasabb kockázatával társulnak; az 5'-vég variánsai pedig az AFAP-hoz kapcsolódnak. A vastagbélrendszeren kívüli megnyilvánulások – beleértve a duodenális adenomákat (100%-os élethosszi kockázat), a pajzsmirigyrákot, a hepatoblastomát (gyermekeknél), a desmoid tumorokat, a retinális pigmentepitélium veleszületett hipertrófiáját (CHRPE) és az osteomákat – az APC-variánsok helyétől függően változnak.
A klasszikus FAP eseteinek körülbelül 20–30%-a olyan de novo APC-variánsokból ered, amelyeknél nincs polipózisra utaló családi anamnézis. Az FAP klinikai kritériumainak megfelelő betegek további 7–10%-ánál a standard szekvenálással nem mutatható ki APC-variáns – ez a csoport olyan mély intronikus szplicing-variánsokat, nagy genomikus átrendeződéseket (deléciók, duplikációk) vagy szomatikus mozaikizmust hordozhat, amelyeket a standard génpanel-vizsgálat nem képes kimutatni. A biallelikus MUTYH-variánsok által okozott MUTYH-társult polipózis (MAP) olyan fenotípust eredményezhet, amely megkülönböztethetetlen az enyhe FAP-tól, ezért APC-negatív polipózisban szenvedő betegeknél egyidejű MUTYH-genotipizálásra van szükség.
A klasszikus FAP, az attenuált FAP (AFAP) és a MUTYH-hez kapcsolódó polipózis (MAP) egymást átfedő klinikai képet mutatnak, amelyeknek azonban eltérő genetikai okai vannak, és a sebészi beavatkozásokra is eltérő következményekkel járnak. Az APC-gén variánsának helye határozza meg a vastagbélrendszeren kívüli tünetek kialakulásának kockázatát.
A szokásos örökletes rákvizsgálati panelek az APC gén kódoló exonjait vizsgálják. Ezek nem észlelik a mély intronális variánsokat, a nagy átrendeződéseket és a mozaikmutációkat – vagyis azokat a variánsokat, amelyek magyarázatot adnak a klinikailag érintett családokban előforduló negatív vizsgálati eredményekre.
A klinikailag diagnosztizált FAP-betegek akár 30%-a is APC-negatív eredményt ad a szokásos szűrővizsgálatok során
A szokásos örökletes rákvizsgálati panelek az APC kódoló régióját és a szplicing helyeket szekvenálják. Ezek nem képesek megbízhatóan kimutatni a több exont átfogó nagy genomikus deléciókat vagy duplikációkat, a rendellenes szplicing helyeket létrehozó mély intronikus variánsokat, illetve a szomatikus mozaikizmust – amely esetben az APC-variáns csak a sejtek egy részében van jelen. Tanulmányok kimutatták, hogy a klasszikus FAP-betegek 7–10%-ánál, akiknél nem azonosítottak APC kódoló variánst, mély intronikus vagy szerkezeti átrendeződési variánsok találhatók, amelyek csak átfogó genomikus elemzéssel mutathatók ki. Egy további alcsoport szomatikus mozaikos APC-mutációkat hordoz, ahol a variáns allél aránya 10–20% lehet, amit a standard panel szekvenálási mélysége nem képes kimutatni. A teljes genom 30-szoros lefedettségű szekvenálása és a másolatszám-variánsok elemzése mindezeket megoldja.
Az APC-variáns helye határozza meg a műtéti stratégiát és a megfigyelés intenzitását
A FAP esetében a kolorektális sebészi kezelés nem egységes. A 1250–1464-es kodonok variánsaival rendelkező és sűrű polipózisban szenvedő betegeknél általában helyreállító proktokolektómia ileális zsák-anális anasztomózissal szükséges. Az AFAP-ban vagy ritka polipózisban szenvedő betegek kezelése szegmentális kolektómia ileorektális anasztomózissal és endoszkópos megfigyeléssel történhet. A desmoid kockázat rétegzése – amely kritikus fontosságú a hasüregi desmoid tumor kockázatával rendelkező betegek műtéti tervezése szempontjából – az APC variáns helyétől függ a 1310–1580. kodonok között. Ezek a genotípus-fenotípus rétegzések nem lehetségesek a teljes APC genotípus ismerete nélkül, amihez a teljes gén szekvenálása szükséges, beleértve a szabályozó és intron régiókat is.
A teljes DNS-ed (nem csak egy része)
A hagyományos genetikai vizsgálatok csak szűk génköröket vizsgálnak, így a genom nagy része kimarad. Mi a teljes genomját szekvenáljuk – minden gént és a gének közötti minden régiót.
Átfogó elemzések és szakértői jelentések
Könnyen érthető, és olyan válaszokat tartalmaz, amelyek alapján Ön és orvosa cselekedhetnek. Nem egy értelmezésre szoruló dokumentum – több mint 200 klinikai jelentés, kategóriák szerint rendezve.
A vizsgád évről évre egyre értékesebbé válik
A DNS-ed nem változik, de a genomkutatás rohamosan fejlődik. Minden hónapban új összefüggéseket fedeznek fel a variánsok és a betegségek között. Ezeket az eredményeket ellenőrizzük, és a jelentéseidet automatikusan frissítjük. A vizsgálatod évről évre egyre értékesebbé válik.
Az eredmények, amelyekkel az orvosok a legnehezebb eseteket is sikeresen kezelik.
Negyven év bizonytalanság. Egyetlen teszt.
Egy beteg évtizedeken át diagnózis nélkül élt az Egyesült Királyság egészségügyi rendszerében. A glasgow-i Queen Elizabeth University Hospital NHS klinikai csapatai által elfogadott Dante-adatok alapján Noonan-szindrómát és egy eddig fel nem fedezett, leukémiával összefüggő RUNX1-variánst azonosítottak. 40 év után végre megkapták a választ.
A teljes szöveg elolvasása teljes képet ad.
Egy beteg időszakos bénulás kivizsgálása céljából kereste fel a Dante-t. A teljes genom elemzése során egy egyidejűleg fennálló örökletes szívbetegséget – Brugada-szindrómát – azonosítottak, amelyet a beteg kezelőorvosa EKG-vizsgálattal megerősített. Az eredmény egy családtag eddig tisztázatlan szívbetegségének hátterét is megmagyarázta. Egyetlen vizsgálat. Minden válasz benne van.
A szekvenálás 2019-ben történt. Az adatok feldolgozása 2021-ben történt.
Jennifer két évvel azelőtt, hogy mellrákot diagnosztizáltak nála, szekvenáltatta a genomját a Dante segítségével. A kezelés megkezdésekor a Dante farmakogenomikai adatai azt mutatták, hogy az előírt kemoterápia súlyos mellékhatásokat okozhat. Orvosa egy alternatív kezelést választott – így ő már az első naptól kezdve hatékony kezelésben részesült.
Minden genetikai kérdésre teljes körű választ érdemel.
Akár ma válaszokat keres, akár a jövőbeli egészségét szeretné megőrizni, a teljes genomjának feltérképezése az egyetlen kiindulási pont.
Ez a családodban öröklődik. Most már megtudhatod, hogy a génjeidben is benne van-e.
A genomja olyan örökletes variánsokat tartalmaz, amelyek olyan betegségekkel állnak összefüggésben, mint a szívbetegségek, a rák és az idegrendszeri betegségek. Mi mindet elemezzük – olyan klinikai mélységben, amely értelmet ad az eredménynek.
További információk →Amikor a hagyományos laborvizsgálatok szerint minden rendben van. Te viszont tudod, hogy nem így van.
A szokásos diagnosztikai vizsgálatok egy előre meghatározott válaszlehetőségek körét vizsgálják. Mi viszont a teljes DNS-edet szekvenáljuk — beleértve azokat a részeket is, amelyek vizsgálatára eddig egyetlen teszt sem készült. Ha a válasz a genomodban rejlik, mi segítünk megtalálni.
További információk →Lehet, hogy a diagnózisa helyes. Lehet, hogy a kezelési terve nem teljes.
A génjei határozzák meg, melyik kezelésnek van a legnagyobb esélye a sikerre – és melyiknek nincs. Mi biztosítjuk orvosának azokat az eszközöket és információkat, amelyek alapján összeállíthatja a kezelési tervet.
További információk →Jobb, ha előre tudod, mielőtt valami miatt felmerülne a kérdés.
Vannak, akik nem várják meg a diagnózist vagy a családi kórtörténetet, hogy cselekedjenek. A teljes genomszekvenálás már most teljes képet ad a genetikai háttérről – így Ön és orvosa megalapozott döntéseket hozhatnak, mielőtt a helyzet sürgőssé válna.
További információk →Már elvégeztél egy DNS-tesztet. Íme, amit az nem tudott megmondani neked.
A legtöbb fogyasztói DNS-teszt a genom kevesebb mint 0,1%-át vizsgálja. Mi az egészet.
További információk →Klinikai színvonalú eredmények. Magánszemélyek választják, az orvosok pedig a legbonyolultabb esetek kezeléséhez is rábízzák magukat.
A Dante Genome Test segítségével egy brit állami sürgősségi kórház szakemberei azonosítani tudták a Noonan-szindrómát, valamint egy eddig fel nem fedezett, ritka, leukémiával összefüggő genetikai variánst. Ez az eredmény megváltoztatta a beteg kezelését.
A következő szervezetek által akkreditált és a következő kiadványokban megjelent
Gyakori kérdések a teljes genomszekvenálásról.
Mi a különbség a teljes genomszekvenálás és a célzott genetikai vizsgálat között?
A célzott genetikai vizsgálatok – beleértve a szokásos örökletes rákpaneleket is – egy előre meghatározott listát olvasnak le egy adott génkészlet ismert variánsairól. Úgy tervezték őket, hogy azt keressék, amit már előre tudnak. A teljes genomszekvenálás a teljes genomot vizsgálja: mind a 6 milliárd bázispárt, minden gént, minden gének közötti régiót. A JAMA Oncology folyóiratban megjelent Mayo Clinic-tanulmány megállapította, hogy a standard vizsgálati irányelvek az örökletes rákos mutációval rendelkező betegek több mint felét nem észlelték. A Genomtesztnek nincs rögzített listája.
Mit kapok, amikor elkészülnek az eredményeim?
A Dante Genome szolgáltatás több mint 200, orvosok számára kész jelentést biztosít klinikai kategóriák szerint csoportosítva – örökletes rák, szívbetegségek, ritka betegségek, farmakogenomika, hordozói státusz és egyebek. A jelentéseket a biztonságos Genome Manager felületére töltjük fel, és azok formázása közvetlen klinikai felhasználásra alkalmas. A genomadatok tartósan megőrzésre kerülnek, és a tudomány fejlődésével automatikusan újraelemzésre kerülnek.
Mi történik, ha klinikailag jelentős variánst találnak?
Ha kórokozó vagy valószínűleg kórokozó variánst azonosítunk, azt egyértelműen jelöljük az Ön orvos számára készített jelentésében, amely tartalmazza a klinikai összefüggéseket, a publikált bizonyítékokat és az ajánlott további lépéseket. Javasoljuk, hogy minden klinikailag jelentős eredményt ossza meg kezelőorvosával vagy egy genetikai tanácsadóval, aki segítséget nyújthat a megfigyeléssel, a kockázatcsökkentéssel vagy a családtagok kaszkádvizsgálatával kapcsolatos döntések meghozatalában.
Miben különbözik ez az olyan fogyasztói DNS-tesztektől, mint a 23andMe vagy az AncestryDNA?
A fogyasztói DNS-tesztek olyan genotípus-meghatározó chipeket használnak, amelyek a genom kevesebb mint 0,1%-át olvassák le – ez egy apró, előre kiválasztott halmaz a gyakori variánsokból. Ezeket az ősök és a populációs szintű jellemzők vizsgálatára optimalizálták, nem pedig klinikai genetikai eredmények megállapítására. A Dante Genomteszt a genom 100%-át szekvenálja 30-szoros lefedettséggel, ami ugyanaz a szabvány, mint a klinikai diagnosztikában. A két teszt nem összehasonlítható sem hatókörét, sem módszertanát, sem klinikai hasznosságát tekintve.
Mennyi idő alatt láthatók az eredmények, és hogyan kapjuk meg őket?
A mintavételi készletet a megrendeléstől számított 48 órán belül postázzuk. Amint a mintája megérkezik a CLIA-tanúsítvánnyal rendelkező laboratóriumunkba, a szekvenálás és az elemzés 6–8 hetet vesz igénybe. Az eredményeket biztonságosan a Genome Manager fiókjába továbbítjuk, ahol hozzáférhet a jelentésekhez, megoszthatja azokat orvosával, és automatikus értesítéseket kaphat, amint új eredményeket igazolnak a genomjával összehasonlítva.
Világszerte együttműködünk betegjogi szervezetekkel.
A Dante Labs bármilyen méretű betegjogi szervezettel együttműködik – a familiáris adenomatosus polipózis és egyéb, ritka vagy gyakori betegségek területén. Bármely országban működő szervezeteket támogatunk, beleértve a virtuális betegjogi szervezeteket is.
Személyre szabott jelentéseket, csoportos kedvezményeket és a tagjaik igényeire szabott csomagokat kínálunk. Kérjük, vegye fel velünk a kapcsolatot az űrlapon keresztül, és két munkanapon belül visszahívjuk.
- Személyre szabott genomikai jelentések a tagjaid számára
- Csoportos kedvezmények és személyre szabott csomagok
- Bármely ország – beleértve a virtuális csoportokat is
- A lefedett ritka és gyakori betegségek
Üzenet fogadva.
2 munkanapon belül felvesszük Önnel a kapcsolatot. Ha közvetlenül szeretne kapcsolatba lépni velünk: hello@dantelabs.com
Egy teszt.
Egy életre szóló válaszok.
Egy készlet, házhoz szállítva. Teljes genomjának szekvenálása a diagnosztikai döntésekhez használt klinikai szabvány szerint. Több mint 200 orvosok számára kész jelentés, amelyet 6–8 héten belül elküldünk a Genome Manager fiókjába — végleges és a tudomány fejlődésével folyamatosan frissül.
48 órán belül kiszállítjuk · Az eredmények 6–8 héten belül
