BAP1 tumor-hajlam szindróma – egy nemrégiben azonosított, magas penetranciájú örökletes rákos szindróma, amelyben egy génvariáns egyszerre négy különböző rákos megbetegedésre hajlamosít, amelyek közül sok rendkívül ritka az általános populációban.
A teljes genom szekvenálása azonosítja a BAP1 gén patogén variánsait – amelyek szerepelnek az ACMG SF v3.2 listán – egy olyan szindróma esetében, amelyben egyetlen genetikai eredmény alapján megkezdődik az uveális melanóma, a mezotelióma, a bőrmelanóma és a vesesejtes karcinóma szűrése.
BAP1 tumorra való hajlam szindróma
A BAP1 tumorprediszpozíciós szindróma (BAP1-TPDS) egy autoszomális domináns örökletes rákos szindróma, amelyet a 3p21.1 kromoszómán található BAP1 (BRCA1-hez kapcsolódó fehérje 1) gén csíravonalbeli patogén variánsai okoznak. A BAP1 egy deubiquitináz, amely szerepet játszik a kromatin átalakításában, a DNS-károsodásra adott válaszban és a sejtciklus szabályozásában. A BAP1 gén csíravonalbeli patogén variánsait csak 2011-től kezdve jellemezték szisztematikusan – a szindrómát viszonylag nemrég írták le, ami azt jelenti, hogy sok érintett családban generációk óta halmozódtak fel szokatlan rákos megbetegedések örökletes magyarázat nélkül. A BAP1-TPDS-t ma már magas penetranciájú, többféle daganatra hajlamosító szindrómaként ismerik el.
A BAP1-TPDS-ben előforduló daganatok köre jellegzetes – a hordozók esetében jelentősen megnövekedett a kockázata az alábbiaknak: uveális melanoma (szemmelanoma, amely az érhártyát, az íriszt és a sugártestet érinti; >50-szerese a populációs kockázatnak), rosszindulatú pleurális mezotelióma (egy ritka rák, amely szorosan összefügg az azbeszt-expozícióval, de ma már tudjuk, hogy BAP1-hordozókban is előfordul, akiknek minimális vagy egyáltalán nincs azbeszt-expozíciója), bőrmelanoma (többszörös primer melanomák, gyakran jellegzetes melanocitás, BAP1-mutációval rendelkező atipikus intradermális daganatokkal – „BAPoma” elváltozások), valamint vesesejtes karcinóma (különösen a világos sejtes és a kromofób altípusok). Ezek a rákok önmagukban ritkák; egy családban való együttes előfordulásuk az a járványtani jel, amely alapján azonosították a BAP1-TPDS-t.
A BAP1 molekuláris diagnózis klinikai következményei azonnaliak és több szakterületet érintenek. A diagnózis felállítását követően megkezdődik az éves szemészeti vizsgálat, beleértve a fundusvizsgálatot (uveális melanoma szűrés), az éves dermatológiai vizsgálat dermatoszkópiával (bőrmelanoma és BAPoma szűrés), a 30–40 éves kor között kezdődő veseimaging (RCC szűrés), az éves mellkasimaging fontolóra vétele (mesothelioma szűrés az expozíciónak kitett hordozók esetében), valamint az összes elsőfokú rokon kaszkádvizsgálata. Fontos kiemelni, hogy a BAP1-hez kapcsolódó mezoteliómát az azbeszt által kiváltott mezoteliómától eltérő klinikai entitásként ismerik el – a BAP1-mezoteliómás betegek általában fiatalabbak, a diagnózis után hosszabb túlélési idővel rendelkeznek, és eltérő kemoterápiás válaszprofilokkal rendelkezhetnek.
A BAP1 gént csak 2011 után ismerték fel örökletes rákgénként, ezért számos régebbi örökletes rákvizsgálati panelben nem szerepel. Azoknál a családoknál, ahol uveális melanóma, mezotelióma vagy szokatlan rákos megbetegedések halmozódása fordul elő, előfordulhat, hogy BAP1-TPDS-ben szenvednek, de soha nem vizsgálták meg őket megfelelően.
A BAP1 gén hiányzik a régebbi örökletes rákvizsgálati panelekből – a szokatlan rákos előzményekkel rendelkező családokat soha nem vizsgálták
A BAP1-TPDS szisztematikus jellemzése csak 2011-ben kezdődött meg. Az elmúlt évtizedben számos, BAP1 patogén variánsokkal rendelkező család vett részt örökletes rákpanel-vizsgálatokon, amelyek nem tartalmazták a BAP1 gént. Azok a személyek, akiknek családjában előfordult uveális melanoma, mezotelióma vagy a melanoma és a veserák szokatlan együttes előfordulása – a BAP1 tumorok fő spektruma –, negatív panel-eredményeket kaphattak a 2011 előtti vizsgálatokból vagy olyan panelekből, amelyek soha nem vették fel a BAP1 gént a génlistájukra. A teljes genom szekvenálás a teljes genomot értékeli, és azonosítja a BAP1 patogén variánsait, függetlenül attól, hogy mikor végezték a szekvenálást, és nincs korlátozás egy előre meghatározott génlista tekintetében.
A BAP1-vizsgálat megerősített eredménye négy rákmegfigyelési protokoll egyidejű elindítását eredményezi
Azokkal az örökletes rákos szindrómákkal ellentétben, ahol egyetlen gén elsősorban egy rákfajtára hajlamosít, a BAP1-TPDS négy különböző rákfajta – az uveális melanoma (szemészet), a bőrmelanoma (bőrgyógyászat), a vesesejtes karcinóma (urológia/radiológia) és a mezotelióma (pulmonológia/onkológia) – összehangolt megfigyelését igényli. Ez a több szakterületet érintő koordináció az első molekuláris diagnózissal kezdődik, és egész életen át évente folytatódik. Minden megfigyelési módszer olyan rákot céloz meg, amelyet a szokásos népességi szűrés nem foglal magában – jelenleg nincs olyan általános rák szűrési program, amely az uveális melanómát lefedné, és a mezotelióma szűrés nem szokásos a diagnosztizálatlan BAP1-hordozók esetében. A molekuláris diagnózis előfeltétele ennek a több szervet érintő megfigyelési hálózatnak az aktiválásának.
A teljes DNS-ed (nem csak egy része)
A hagyományos genetikai vizsgálatok csak szűk génköröket vizsgálnak, így a genom nagy része kimarad. Mi a teljes genomját szekvenáljuk – minden gént és a gének közötti minden régiót.
Átfogó elemzések és szakértői jelentések
Könnyen érthető, és olyan válaszokat tartalmaz, amelyek alapján Ön és orvosa cselekedhetnek. Nem egy értelmezésre szoruló dokumentum – több mint 200 klinikai jelentés, kategóriák szerint rendezve.
A vizsgád évről évre egyre értékesebbé válik
A DNS-ed nem változik, de a genomkutatás rohamosan fejlődik. Minden hónapban új összefüggéseket fedeznek fel a variánsok és a betegségek között. Ezeket az eredményeket ellenőrizzük, és a jelentéseidet automatikusan frissítjük. A vizsgálatod évről évre egyre értékesebbé válik.
Az eredmények, amelyekkel az orvosok a legnehezebb eseteket is sikeresen kezelik.
Negyven év bizonytalanság. Egyetlen teszt.
Egy beteg évtizedeken át diagnózis nélkül élt az Egyesült Királyság egészségügyi rendszerében. A glasgow-i Queen Elizabeth University Hospital NHS klinikai csapatai által elfogadott Dante-adatok alapján Noonan-szindrómát és egy eddig fel nem fedezett, leukémiával összefüggő RUNX1-variánst azonosítottak. 40 év után végre megkapták a választ.
A teljes szöveg elolvasása teljes képet ad.
Egy beteg időszakos bénulás kivizsgálása céljából kereste fel a Dante-t. A teljes genom elemzése során egy egyidejűleg fennálló örökletes szívbetegséget – Brugada-szindrómát – azonosítottak, amelyet a beteg kezelőorvosa EKG-vizsgálattal megerősített. Az eredmény egy családtag eddig tisztázatlan szívbetegségének hátterét is megmagyarázta. Egyetlen vizsgálat. Minden válasz benne van.
A szekvenálás 2019-ben történt. Az adatok feldolgozása 2021-ben történt.
Jennifer két évvel azelőtt, hogy mellrákot diagnosztizáltak nála, szekvenáltatta a genomját a Dante segítségével. A kezelés megkezdésekor a Dante farmakogenomikai adatai azt mutatták, hogy az előírt kemoterápia súlyos mellékhatásokat okozhat. Orvosa egy alternatív kezelést választott – így ő már az első naptól kezdve hatékony kezelésben részesült.
Minden genetikai kérdésre teljes körű választ érdemel.
Akár ma válaszokat keres, akár a jövőbeli egészségét szeretné megőrizni, a teljes genomjának feltérképezése az egyetlen kiindulási pont.
Ez a családodban öröklődik. Most már megtudhatod, hogy a génjeidben is benne van-e.
A genomja olyan örökletes variánsokat tartalmaz, amelyek olyan betegségekkel állnak összefüggésben, mint a szívbetegségek, a rák és az idegrendszeri betegségek. Mi mindet elemezzük – olyan klinikai mélységben, amely értelmet ad az eredménynek.
További információk →Amikor a hagyományos laborvizsgálatok szerint minden rendben van. Te viszont tudod, hogy nem így van.
A szokásos diagnosztikai vizsgálatok egy előre meghatározott válaszlehetőségek körét vizsgálják. Mi viszont a teljes DNS-edet szekvenáljuk — beleértve azokat a részeket is, amelyek vizsgálatára eddig egyetlen teszt sem készült. Ha a válasz a genomodban rejlik, mi segítünk megtalálni.
További információk →Lehet, hogy a diagnózisa helyes. Lehet, hogy a kezelési terve nem teljes.
A génjei határozzák meg, melyik kezelésnek van a legnagyobb esélye a sikerre – és melyiknek nincs. Mi biztosítjuk orvosának azokat az eszközöket és információkat, amelyek alapján összeállíthatja a kezelési tervet.
További információk →Jobb, ha előre tudod, mielőtt valami miatt felmerülne a kérdés.
Vannak, akik nem várják meg a diagnózist vagy a családi kórtörténetet, hogy cselekedjenek. A teljes genomszekvenálás már most teljes képet ad a genetikai háttérről – így Ön és orvosa megalapozott döntéseket hozhatnak, mielőtt a helyzet sürgőssé válna.
További információk →Már elvégeztél egy DNS-tesztet. Íme, amit az nem tudott megmondani neked.
A legtöbb fogyasztói DNS-teszt a genom kevesebb mint 0,1%-át vizsgálja. Mi az egészet.
További információk →Klinikai színvonalú eredmények. Magánszemélyek választják, az orvosok pedig a legbonyolultabb esetek kezeléséhez is rábízzák magukat.
A Dante Genome Test segítségével egy brit állami sürgősségi kórház szakemberei azonosítani tudták a Noonan-szindrómát, valamint egy eddig fel nem fedezett, ritka, leukémiával összefüggő genetikai variánst. Ez az eredmény megváltoztatta a beteg kezelését.
A következő szervezetek által akkreditált és a következő kiadványokban megjelent
Gyakori kérdések a teljes genomszekvenálásról.
Mi a különbség a teljes genomszekvenálás és a célzott genetikai vizsgálat között?
A célzott genetikai vizsgálatok – beleértve a szokásos örökletes rákpaneleket is – egy előre meghatározott listát olvasnak le egy adott génkészlet ismert variánsairól. Úgy tervezték őket, hogy azt keressék, amit már előre tudnak. A teljes genomszekvenálás a teljes genomot vizsgálja: mind a 6 milliárd bázispárt, minden gént, minden gének közötti régiót. A JAMA Oncology folyóiratban megjelent Mayo Clinic-tanulmány megállapította, hogy a standard vizsgálati irányelvek az örökletes rákos mutációval rendelkező betegek több mint felét nem észlelték. A Genomtesztnek nincs rögzített listája.
Mit kapok, amikor elkészülnek az eredményeim?
A Dante Genome szolgáltatás több mint 200, orvosok számára kész jelentést biztosít klinikai kategóriák szerint csoportosítva – örökletes rák, szívbetegségek, ritka betegségek, farmakogenomika, hordozói státusz és egyebek. A jelentéseket a biztonságos Genome Manager felületére töltjük fel, és azok formázása közvetlen klinikai felhasználásra alkalmas. A genomadatok tartósan megőrzésre kerülnek, és a tudomány fejlődésével automatikusan újraelemzésre kerülnek.
Mi történik, ha klinikailag jelentős variánst találnak?
Ha kórokozó vagy valószínűleg kórokozó variánst azonosítunk, azt egyértelműen jelöljük az Ön orvos számára készített jelentésében, amely tartalmazza a klinikai összefüggéseket, a publikált bizonyítékokat és az ajánlott további lépéseket. Javasoljuk, hogy minden klinikailag jelentős eredményt ossza meg kezelőorvosával vagy egy genetikai tanácsadóval, aki segítséget nyújthat a megfigyeléssel, a kockázatcsökkentéssel vagy a családtagok kaszkádvizsgálatával kapcsolatos döntések meghozatalában.
Miben különbözik ez az olyan fogyasztói DNS-tesztektől, mint a 23andMe vagy az AncestryDNA?
A fogyasztói DNS-tesztek olyan genotípus-meghatározó chipeket használnak, amelyek a genom kevesebb mint 0,1%-át olvassák le – ez egy apró, előre kiválasztott halmaz a gyakori variánsokból. Ezeket az ősök és a populációs szintű jellemzők vizsgálatára optimalizálták, nem pedig klinikai genetikai eredmények megállapítására. A Dante Genomteszt a genom 100%-át szekvenálja 30-szoros lefedettséggel, ami ugyanaz a szabvány, mint a klinikai diagnosztikában. A két teszt nem összehasonlítható sem hatókörét, sem módszertanát, sem klinikai hasznosságát tekintve.
Mennyi idő alatt láthatók az eredmények, és hogyan kapjuk meg őket?
A mintavételi készletet a megrendeléstől számított 48 órán belül postázzuk. Amint a mintája megérkezik a CLIA-tanúsítvánnyal rendelkező laboratóriumunkba, a szekvenálás és az elemzés 6–8 hetet vesz igénybe. Az eredményeket biztonságosan a Genome Manager fiókjába továbbítjuk, ahol hozzáférhet a jelentésekhez, megoszthatja azokat orvosával, és automatikus értesítéseket kaphat, amint új eredményeket igazolnak a genomjával összehasonlítva.
Világszerte együttműködünk betegjogi szervezetekkel.
A Dante Labs bármilyen méretű betegjogi szervezettel együttműködik – a BAP1 tumorhajlam-szindróma, valamint egyéb ritka és gyakori betegségek területén. Bármely országban működő szervezeteket támogatunk, beleértve a virtuális betegjogi szervezeteket is.
Személyre szabott jelentéseket, csoportos kedvezményeket és a tagjaik igényeire szabott csomagokat kínálunk. Kérjük, vegye fel velünk a kapcsolatot az űrlapon keresztül, és két munkanapon belül visszahívjuk.
- Személyre szabott genomikai jelentések a tagjaid számára
- Csoportos kedvezmények és személyre szabott csomagok
- Bármely ország – beleértve a virtuális csoportokat is
- A lefedett ritka és gyakori betegségek
Üzenet fogadva.
2 munkanapon belül felvesszük Önnel a kapcsolatot. Ha közvetlenül szeretne kapcsolatba lépni velünk: hello@dantelabs.com
Egy teszt.
Egy életre szóló válaszok.
Egy készlet, házhoz szállítva. Teljes genomjának szekvenálása a diagnosztikai döntésekhez használt klinikai szabvány szerint. Több mint 200 orvosok számára kész jelentés, amelyet 6–8 héten belül elküldünk a Genome Manager fiókjába — végleges és a tudomány fejlődésével folyamatosan frissül.
48 órán belül kiszállítjuk · Az eredmények 6–8 héten belül