A Dante Omics AI a Rockefeller Egyetemmel, a Giunta Labbal és globális partnereinek hálózatával együttműködve összeállította a RPE-1 sejtvonal legteljesebb és legpontosabb diploid referenciagenomját – amely az egyik legszélesebb körben használt standard a komplex sejtmérnöki kísérletekhez.
Ez a mérföldkő valódi „forráskódot” biztosít a világ kutatói számára, lehetővé téve a szerkezeti komplexitás, a genom stabilitása és a CRISPR-alapú génmódosítás mélyebb megértését.
Miért fontos ez?
Az RPE-1 sejtvonal világszerte mércéül szolgál a sejtbiológiában, a rákkutatásban és a genomszerkesztésben. Eddig azonban a genomja hiányos volt, így egyes kulcsfontosságú régiók nem voltak teljesen tisztázottak, vagy egyáltalán nem szerepeltek benne.
Az új összeállításunk ezt megváltoztatja:
► Diploid teljesség – mind az anyai, mind az apai haplotípusok kromoszómák szintjén felbontva.► Rendkívül nagy pontosság – több kromoszómán 99,9999% felett.► Komplex régiók teljes lefedése – a centromerek, ismétlődő szekvenciák és szerkezetileg bonyolult DNS-szakaszok is feltérképezésre kerültek.► Több platformon történő integráció – adatok az Illumina rövid olvasmányokból, a PacBio HiFi-ből, az Oxford Nanopore hosszú olvasmányokból, valamint kiegészítő forrásokból.► Nyílt hozzáférés – az RPE1v1.1 összeállítás már elérhető az NCBI és az UCSC Genome Browser segítségével.
Közös eredmény
Ez a projekt kizárólag egy globális konzorcium tagjainak együttes szakértelmének köszönhetően valósulhatott meg, amelynek tagjai a következők:
Rockefeller EgyetemGiunta LaboratóriumRómai Sapienza EgyetemTennessee-i EgyetemTrieszti Tudományos ParkL’Aquila-i EgyetemDante Omics AI
Ahogy Andrea Riposati, a Dante Omics AI vezérigazgatója kifejtette: „Képzeljék el, milyen lenne szoftvert hibakeresni a forráskód egyes részeinek hiányában. Ezzel az összeállítással a kutatók végre teljes és pontos „forráskódhoz” jutottak az RPE-1 sejtekhez – egészen a korábban láthatatlan, legbonyolultabb régiókig.”
Következmények a tudomány és az orvostudomány számára
Új mérce a sejtmódosítás terén: a CRISPR és más génszerkesztési technikák immár megbízhatóbb alapra támaszkodhatnak.A DNS komplexitásának mélyebb feltárása: a korábban hozzáférhetetlen centromerek és ismétlődő szekvenciák ma már tanulmányozhatók.Szélesebb körű hatása a kutatási területeken: az onkológiától a szintetikus biológiáig ez a genom világszerte növeli a kísérletek pontosságát.Modell a jövőbeli összeállításokhoz: a módszer kiterjeszthető más sejtvonalakra és fajokra is.
Következtetés
A „Blurry to 4K DNA” nem csupán egy szlogen – ez a genomkutatás fordulópontját jelenti. Az AI-alapú multiomika és a legmodernebb szekvenálási technológiák ötvözésével a Dante Omics AI és partnerei a biológia egyik legfontosabb sejtmodelljéről eddig a legvilágosabb genomikus tervrajzot állították össze.
➡ Olvassa el a sajtóközleményt a BusinessWire-en
Kövesse a Dante Labs legújabb bejegyzéseit
Genomikai ismeretek, termékfrissítések és klinikai szempontok – közvetlenül az Ön postaládájába.
