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Gène

ZNF544

zinc finger protein 544

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.43
Coordonnées
Chromosome 19 : 58 228 914–58 263 644 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 34,7 kb
Protéine
715 acides aminés
Aussi appelé
AF020591
Transcrit MANE Select
ENST00000687789.1NM_014480.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ZNF544. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ZNF544

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de ZNF544. ZNF544 et 39 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 57 746 279 à 58 746 278.Chromosome 1919q13.43p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4357,8 Mb58 Mb58,2 Mb58,4 Mb58,6 Mb : 57 682 045–57 753 575, brin directZNF776 : 57 746 800–57 758 148, brin directZNF776ZNF552 : 57 768 451–57 814 972, brin inverseZNF552ZNF586 : 57 769 636–57 819 939, brin directZNF586ZNF587B : 57 819 706–57 846 238, brin directZNF587B : 57 819 719–57 858 941, brin directZNF814 : 57 848 731–57 889 077, brin inverseZNF814ZNF587 : 57 849 818–57 865 117, brin directZNF587 : 57 876 765–57 916 591, brin inverseZNF417 : 57 900 292–57 916 616, brin inverseZNF417ZNF418 : 57 920 526–57 935 413, brin inverseZNF418ZNF256 : 57 939 738–57 947 715, brin inverseZNF256C19orf18 : 57 958 437–57 974 534, brin inverseC19orf18ZNF606 : 57 977 053–58 003 349, brin inverseZNF606ZSCAN1 : 58 034 002–58 054 631, brin directZSCAN1ZNF135 : 58 059 238–58 086 310, brin directZNF135ZSCAN18 : 58 083 318–58 118 427, brin inverseZSCAN18ZNF329 : 58 126 248–58 155 110, brin inverseZNF329ZNF274 : 58 183 029–58 215 964, brin directZNF274ZNF544 : 58 228 914–58 263 644, brin directZNF544 : 58 228 914–58 315 183, brin directZNF8 : 58 278 949–58 302 791, brin directZNF8ERVK3-1 : 58 305 347–58 316 812, brin directERVK3-1ZSCAN22 : 58 326 994–58 342 346, brin directZSCAN22A1BG : 58 345 178–58 353 502, brin inverseA1BGZNF497 : 58 354 357–58 362 848, brin inverseZNF497ZNF837 : 58 367 614–58 381 054, brin inverseRPS5 : 58 380 570–58 394 810, brin directRPS5RNF225 : 58 395 656–58 397 079, brin directZNF584 : 58 401 504–58 431 736, brin directZNF584ZNF132 : 58 432 814–58 440 172, brin inverseZNF132ZNF324B : 58 450 369–58 459 868, brin directZNF324BZNF324 : 58 467 052–58 475 436, brin directZNF324ZNF446 : 58 474 017–58 483 992, brin directZNF446SLC27A5 : 58 479 512–58 512 413, brin inverseZBTB45 : 58 513 530–58 538 911, brin inverseZBTB45TRIM28 : 58 543 740–58 550 773, brin directTRIM28CHMP2A : 58 551 452–58 555 129, brin inverseCHMP2AUBE2M : 58 555 709–58 558 986, brin inverseUBE2MMZF1 : 58 561 915–58 573 603, brin inverseSchéma de ZNF544 : 7 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 1 : 58 228 914–58 228 946, 33 basesExon 2 : 58 229 468–58 229 570, 103 basesExon 3 : 58 230 394–58 230 462, 69 basesExon 4 : 58 243 965–58 244 056, 92 basesExon 5 : 58 246 301–58 246 427, 127 basesExon 6 : 58 246 711–58 246 794, 84 basesExon 7 : 58 260 851–58 263 644, 2 794 bases124675′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,3 kb sur les 34,7 kb du gène ; 2 148 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de ZNF544

4Facile

Difficulté de séquençage de ZNF544 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de ZNF544 se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de ZNF544 dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions28 %
  • Teneur en GC1,3 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ZNF544 : zinc finger protein 544. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/znf544

Vancouver

Dante Labs. Gène ZNF544 : zinc finger protein 544 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/znf544

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