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Gène

ZNF254

zinc finger protein 254

Résumé

Localisation cytogénétique
19p13
Coordonnées
Chromosome 19 : 24 087 187–24 129 968 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 42,8 kb
Protéine
659 acides aminés
Aussi appelé
HD-ZNF1, BMZF-5
Symboles précédents
ZNF91L, ZNF539
Transcrit MANE Select
ENST00000357002.5NM_203282.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ZNF254. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ZNF254

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de ZNF254. ZNF254 et 4 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 23 608 578 à 24 608 577.Chromosome 1919p13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4323,8 Mb24 Mb24,2 Mb24,4 Mb24,6 MbZNF675 : 23 525 631–23 687 234, brin inverseZNF675ZNF681 : 23 739 195–23 758 927, brin inverseZNF681RPSA2 : 23 762 944–23 871 162, brin directRPSA2ZNF726 : 23 914 874–23 945 159, brin directZNF726ZNF254 : 24 087 187–24 129 968, brin directZNF254Schéma de ZNF254 : 4 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 1 : 24 087 187–24 087 337, 151 basesExon 2 : 24 105 940–24 106 066, 127 basesExon 3 : 24 106 548–24 106 643, 96 basesExon 4 : 24 126 254–24 129 968, 3 715 bases1245′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,1 kb sur les 42,8 kb du gène ; 1 980 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de ZNF254

10Modérée

Difficulté de séquençage de ZNF254 avec des lectures courtes, sur 100

Certains exons de ZNF254 se situent dans des zones où les lectures courtes peuvent manquer ou mal placer une variation.

Facteur aggravant : la part des exons de ZNF254 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité4,5 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions35 %
  • Teneur en GC29 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ZNF254 : zinc finger protein 254. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/znf254

Vancouver

Dante Labs. Gène ZNF254 : zinc finger protein 254 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/znf254

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