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Gène

XCL1

X-C motif chemokine ligand 1

Résumé

Localisation cytogénétique
1q24.2
Coordonnées
Chromosome 1 : 168 576 605–168 582 069 (GRCh38)
Exons
3 exons sur 5,5 kb
Protéine
114 acides aminés
Aussi appelé
LPTN, ATAC, SCM-1a, SCM-1
Symboles précédents
LTN, SCYC1
Transcrit MANE Select
ENST00000367818.4NM_002995.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore XCL1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de XCL1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de XCL1. XCL1 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 168 079 337 à 169 079 336.Chromosome 11q24.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44168,2 Mb168,4 Mb168,6 Mb168,8 Mb169 MbGPR161 : 168 079 542–168 137 685, brin inverseGPR161TIPRL : 168 178 820–168 202 114, brin directTIPRLSFT2D2 : 168 225 938–168 263 172, brin directSFT2D2TBX19 : 168 280 877–168 314 426, brin directTBX19XCL2 : 168 540 765–168 544 113, brin inverseXCL2XCL1 : 168 576 605–168 582 069, brin directXCL1DPT : 168 695 246–168 729 207, brin inverseDPTSchéma de XCL1 : 3 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 168 576 605–168 576 698, 94 basesExon 2 : 168 580 063–168 580 177, 115 basesExon 3 : 168 581 052–168 582 069, 1 018 bases1235′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,2 kb sur les 5,5 kb du gène ; 345 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène XCL1 : X-C motif chemokine ligand 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/xcl1

Vancouver

Dante Labs. Gène XCL1 : X-C motif chemokine ligand 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/xcl1

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