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Gène

USP38

ubiquitin specific peptidase 38

Résumé

Localisation cytogénétique
4q31.21
Coordonnées
Chromosome 4 : 143 184 917–143 223 874 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 39 kb
Protéine
1 042 acides aminés
Aussi appelé
KIAA1891, HP43.8KD
Transcrit MANE Select
ENST00000307017.9NM_032557.6
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore USP38. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de USP38

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 4, avec un crochet à l'emplacement de USP38. USP38 et 4 gènes à proximité sur le chromosome 4, de 142 704 396 à 143 704 395.Chromosome 44q31.21p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.2142,8 Mb143 Mb143,2 Mb143,4 Mb143,6 MbINPP4B : 142 023 160–142 847 432, brin inverseINPP4BUSP38 : 143 184 917–143 223 874, brin directUSP38GAB1 : 143 336 150–143 474 565, brin directGAB1SMARCA5 : 143 513 445–143 557 486, brin directSMARCA5FREM3 : 143 577 302–143 700 675, brin inverseFREM3Schéma de USP38 : 10 exons sur le brin direct du chromosome 4Exon 1 : 143 184 917–143 186 132, 1 216 basesExon 2 : 143 187 826–143 187 961, 136 basesExon 3 : 143 195 716–143 195 845, 130 basesExon 4 : 143 197 823–143 197 924, 102 basesExon 5 : 143 203 408–143 203 566, 159 basesExon 6 : 143 206 033–143 206 226, 194 basesExon 7 : 143 209 564–143 209 657, 94 basesExon 8 : 143 212 318–143 212 424, 107 basesExon 9 : 143 213 581–143 214 943, 1 363 basesExon 10 : 143 220 295–143 223 874, 3 580 bases123456789105′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 7,1 kb sur les 39 kb du gène ; 3 129 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène USP38 : ubiquitin specific peptidase 38. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/usp38

Vancouver

Dante Labs. Gène USP38 : ubiquitin specific peptidase 38 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/usp38

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