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Gène

USP17L3

ubiquitin specific peptidase 17 like family member 3

Résumé

Localisation cytogénétique
8p23.1
Coordonnées
Chromosome 8 : 7 976 393–7 977 985 (GRCh38)
Exons
1 exon sur 1,6 kb
Protéine
530 acides aminés
Aussi appelé
USP17B, USP17F
Transcrit MANE Select
ENST00000530484.1NM_001256871.1
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore USP17L3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de USP17L3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 8, avec un crochet à l'emplacement de USP17L3. USP17L3 et 30 gènes à proximité sur le chromosome 8, de 7 477 189 à 8 477 188.Chromosome 88p23.1p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.37,6 Mb7,8 Mb8 Mb8,2 Mb8,4 MbDEFB106B : 7 482 504–7 486 400, brin inverseDEFB106BDEFB105B : 7 487 679–7 489 593, brin directDEFB105BDEFB107B : 7 495 911–7 509 311, brin directDEFB107BPRR23D1 : 7 539 627–7 542 450, brin directPRR23D1FAM90A7 : 7 556 700–7 559 712, brin inverseFAM90A7FAM90A22 : 7 571 995–7 575 006, brin inverseFAM90A22FAM90A23 : 7 579 644–7 582 653, brin inverseFAM90A23FAM90A14 : 7 715 443–7 718 453, brin directFAM90A18 : 7 723 091–7 726 101, brin directFAM90A16 : 7 730 739–7 733 749, brin directFAM90A8 : 7 738 387–7 741 396, brin directFAM90A17 : 7 746 034–7 749 044, brin directFAM90A19 : 7 751 570–7 756 692, brin directFAM90A19FAM90A9 : 7 761 330–7 764 340, brin directFAM90A9FAM90A10 : 7 766 902–7 772 547, brin directFAM90A10PRR23D2 : 7 778 591–7 781 413, brin inversePRR23D2DEFB107A : 7 811 720–7 815 716, brin inverseDEFB105A : 7 821 004–7 823 880, brin inverseDEFB106A : 7 825 139–7 829 053, brin directDEFB104A : 7 836 436–7 841 242, brin directDEFB104ASPAG11A : 7 847 876–7 868 867, brin directSPAG11ADEFB103A : 7 881 392–7 882 663, brin directDEFB103ADEFB4A : 7 894 676–7 896 716, brin directDEFB4AZNF705B : 7 926 337–7 952 413, brin directZNF705BUSP17L8 : 7 971 661–7 973 253, brin inverseUSP17L8USP17L3 : 7 976 393–7 977 985, brin inverseUSP17L3DEFB109C : 7 990 270–7 997 645, brin inverseDEFB109CFAM90A11 : 8 012 342–8 015 352, brin inverseFAM90A11FAM90A24 : 8 019 988–8 022 998, brin inverseFAM90A12 : 8 027 636–8 030 646, brin inversePRAG1 : 8 317 736–8 387 357, brin inversePRAG1Schéma de USP17L3 : un exon sur le brin inverse du chromosome 8Exon 1 : 7 976 393–7 977 985, 1 593 bases15′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,6 kb sur les 1,6 kb du gène ; 1 593 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de USP17L3

65Difficile

Difficulté de séquençage de USP17L3 avec des lectures courtes, sur 100

Une grande partie de USP17L3 se trouve dans des zones où les lectures courtes peuvent manquer ou mal placer une variation.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de USP17L3 dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité100 %
  • Homologie100 %
  • Répétitions0 %
  • Teneur en GC0 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène USP17L3 : ubiquitin specific peptidase 17 like family member 3. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/usp17l3

Vancouver

Dante Labs. Gène USP17L3 : ubiquitin specific peptidase 17 like family member 3 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/usp17l3

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