Gène
TMEM26
transmembrane protein 26
- HGNC 28550↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000196932↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 219623↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 10q21.2
- Coordonnées
- Chromosome 10 : 61 406 642–61 453 381 (GRCh38)
- Exons
- 6 exons sur 46,7 kb
- Protéine
- 368 acides aminés
- Aussi appelé
- MGC35010, Em:AC068892.1
- Transcrit MANE Select
- ENST00000399298.8NM_178505.8
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Structure de TMEM26
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 5,1 kb sur les 46,7 kb du gène ; 1 107 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de TMEM26
1Facile
Difficulté de séquençage de TMEM26 avec des lectures courtes, sur 100
0 · Facile100 · Difficile
Presque tous les exons de TMEM26 se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.
Ce qui s'y ajoute : la part des exons de TMEM26 dans chaque type de zone difficile
- MappabilitéPortions où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, un appel effectué à cet endroit pouvant donc être manquant ou erroné. Poids 35 %.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. Poids 30 %.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et séquences d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles risquent de ne pas couvrir entièrement. Poids 15 %.3 %
- Teneur en GCFenêtres contenant moins de 25 % ou plus de 65 % de G et de C, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. Poids 10 %.6,1 %
- Couverture de référenceLacunes de l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. Poids 10 %.0 %
Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du scoreChaque barre représente la part des bases exoniques de TMEM26 situées dans ce type de zone difficile. Un seul type peut suffire à rendre un gène difficile à analyser, et chaque type supplémentaire ajoute moins : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans une zone de ce type, 100 lorsque chaque base se trouve dans une zone où les lectures ne peuvent pas être placées de façon unique.
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène TMEM26 : transmembrane protein 26. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tmem26
Dante Labs. Gène TMEM26 : transmembrane protein 26 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tmem26
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