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Gène

TCAF2

TRPM8 channel associated factor 2

Résumé

Localisation cytogénétique
7q35
Coordonnées
Chromosome 7 : 143 620 974–143 730 410 (GRCh38)
Exons
8 exons sur 109,4 kb
Protéine
919 acides aminés
Aussi appelé
FLJ40722, GATD9B
Symboles précédents
FAM139A, FAM115C
Transcrit MANE Select
ENST00000684770.1NM_001363538.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TCAF2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TCAF2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 7, avec un crochet à l'emplacement de TCAF2. TCAF2 et 24 gènes à proximité sur le chromosome 7, de 143 175 692 à 144 175 691.Chromosome 77q35p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.3143,2 Mb143,4 Mb143,6 Mb143,8 Mb144 MbTAS2R39 : 143 183 419–143 184 435, brin directTAS2R39TAS2R40 : 143 222 037–143 223 079, brin directTAS2R40GSTK1 : 143 244 093–143 272 483, brin directGSTK1TMEM139 : 143 279 937–143 288 240, brin directTMEM139CASP2 : 143 288 215–143 307 696, brin directCASP2CLCN1 : 143 316 111–143 353 744, brin directCLCN1FAM131B : 143 353 395–143 362 815, brin inverseFAM131BZYX : 143 381 076–143 391 111, brin directZYXEPHA1 : 143 390 289–143 408 880, brin inverseEPHA1TAS2R60 : 143 443 453–143 444 409, brin directTAS2R60TAS2R41 : 143 477 873–143 478 796, brin directTAS2R41OR10AC1 : 143 509 256–143 519 469, brin inverseOR10AC1CTAGE15 : 143 571 801–143 574 387, brin directCTAGE15TCAF2 : 143 620 974–143 730 410, brin directTCAF2TCAF2C : 143 639 230–143 647 646, brin inverseTCAF2CCTAGE6 : 143 755 089–143 757 696, brin inverseCTAGE6TCAF1 : 143 850 360–143 903 890, brin inverseTCAF1OR2F2 : 143 935 233–143 936 186, brin directOR2F2OR2F1 : 143 954 844–143 997 312, brin directOR2F1OR6B1 : 144 000 320–144 008 793, brin directOR6B1OR2A5 : 144 048 948–144 058 845, brin directOR2A5OR2A25 : 144 069 811–144 075 870, brin directOR2A25OR2A12 : 144 086 278–144 098 953, brin directOR2A12OR2A2 : 144 109 583–144 110 539, brin directOR2A2OR2A14 : 144 123 176–144 131 188, brin directOR2A14Schéma de TCAF2 : 8 exons sur le brin direct du chromosome 7Exon 1 : 143 620 974–143 621 020, 47 basesExon 2 : 143 702 984–143 703 617, 634 basesExon 3 : 143 719 683–143 720 674, 992 basesExon 4 : 143 721 281–143 721 378, 98 basesExon 5 : 143 722 658–143 722 871, 214 basesExon 6 : 143 723 211–143 723 450, 240 basesExon 7 : 143 724 360–143 724 697, 338 basesExon 8 : 143 727 413–143 730 410, 2 998 bases124685′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,6 kb sur les 109,4 kb du gène ; 2 760 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TCAF2 : TRPM8 channel associated factor 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tcaf2

Vancouver

Dante Labs. Gène TCAF2 : TRPM8 channel associated factor 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tcaf2

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