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Gène

TBC1D3H

TBC1 domain family member 3H

Résumé

Localisation cytogénétique
17q12
Coordonnées
Chromosome 17 : 36 377 531–36 388 435 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 10,9 kb
Protéine
549 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000610350.4NM_001123392.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TBC1D3H. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TBC1D3H

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de TBC1D3H. TBC1D3H et 22 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 35 882 983 à 36 882 982.Chromosome 1717q12p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.336 Mb36,2 Mb36,4 Mb36,6 Mb36,8 MbRDM1 : 35 918 066–35 930 794, brin inverseRDM1LYZL6 : 35 934 518–35 943 713, brin inverseLYZL6CCL16 : 35 976 192–35 981 580, brin inverseCCL14 : 35 983 288–35 987 033, brin inverseCCL14CCL15-CCL14 : 35 983 656–36 001 621, brin inverseCCL15-CCL14CCL15 : 35 988 463–36 002 119, brin inverseCCL15CCL23 : 36 013 056–36 017 979, brin inverseCCL23CCL18 : 36 064 228–36 072 032, brin directCCL18CCL3 : 36 088 256–36 090 169, brin inverseCCL3CCL4 : 36 103 588–36 105 627, brin directCCL4TBC1D3B : 36 165 683–36 176 636, brin inverseTBC1D3BCCL3L3 : 36 194 869–36 196 758, brin inverseCCL3L3CCL4L2 : 36 210 924–36 212 878, brin directCCL4L2TBC1D3I : 36 253 456–36 264 570, brin inverseTBC1D3ITBC1D3G : 36 323 884–36 334 759, brin directTBC1D3GTBC1D3H : 36 377 531–36 388 435, brin inverseTBC1D3HTBC1D3F : 36 428 612–36 439 566, brin inverseTBC1D3FZNHIT3 : 36 486 629–36 499 310, brin directZNHIT3MYO19 : 36 495 118–36 545 889, brin inverseMYO19PIGW : 36 534 981–36 542 354, brin directPIGWGGNBP2 : 36 544 888–36 589 866, brin directGGNBP2DHRS11 : 36 591 782–36 600 809, brin directDHRS11MRM1 : 36 601 571–36 621 636, brin directMRM1Schéma de TBC1D3H : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 14 : 36 377 531–36 378 414, 884 basesExon 13 : 36 379 396–36 379 548, 153 basesExon 12 : 36 379 919–36 380 018, 100 basesExon 11 : 36 380 482–36 380 547, 66 basesExon 10 : 36 380 932–36 381 026, 95 basesExon 9 : 36 381 740–36 381 860, 121 basesExon 8 : 36 382 404–36 382 452, 49 basesExon 7 : 36 383 701–36 383 810, 110 basesExon 6 : 36 384 140–36 384 247, 108 basesExon 5 : 36 384 691–36 384 771, 81 basesExon 4 : 36 385 254–36 385 293, 40 basesExon 3 : 36 386 576–36 386 661, 86 basesExon 2 : 36 386 824–36 386 896, 73 basesExon 1 : 36 388 325–36 388 435, 111 bases14131211109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,1 kb sur les 10,9 kb du gène ; 1 650 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de TBC1D3H

100Difficile

Difficulté de séquençage de TBC1D3H avec des lectures courtes, sur 100

Une grande partie de TBC1D3H se trouve dans des zones où les lectures courtes peuvent manquer ou mal placer une variation.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de TBC1D3H dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité100 %
  • Homologie100 %
  • Shared with chrY0 %
  • Couverture de référence0 %
  • Répétitions0 %
  • Teneur en GC20 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TBC1D3H : TBC1 domain family member 3H. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tbc1d3h

Vancouver

Dante Labs. Gène TBC1D3H : TBC1 domain family member 3H [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tbc1d3h

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