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Gène

SSX2IP

SSX family member 2 interacting protein

Résumé

Localisation cytogénétique
1p22.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 84 643 706–84 690 461 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 46,8 kb
Protéine
614 acides aminés
Aussi appelé
hMsd1
Transcrit MANE Select
ENST00000342203.8NM_001166293.2
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SSX2IP. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SSX2IP

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de SSX2IP. SSX2IP et 12 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 84 167 084 à 85 167 083.Chromosome 11p22.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4484,2 Mb84,4 Mb84,6 Mb84,8 Mb85 MbPRKACB : 84 077 949–84 239 680, brin directPRKACBSAMD13 : 84 298 366–84 389 957, brin directSAMD13DNASE2B : 84 398 484–84 415 644, brin directDNASE2BRPF1 : 84 479 245–84 499 677, brin directRPF1GNG5 : 84 489 407–84 507 237, brin inverseGNG5SPATA1 : 84 505 491–84 567 379, brin directSPATA1CTBS : 84 541 988–84 574 484, brin inverseCTBSSSX2IP : 84 643 706–84 690 461, brin inverseSSX2IPLPAR3 : 84 811 541–84 893 540, brin inverseLPAR3MCOLN2 : 84 925 583–84 997 139, brin inverseMCOLN2DNAI3 : 84 999 147–85 133 274, brin directDNAI3MCOLN3 : 85 018 082–85 048 887, brin inverseMCOLN3SYDE2 : 85 156 511–85 201 751, brin inverseSYDE2Schéma de SSX2IP : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 14 : 84 643 706–84 647 607, 3 902 basesExon 13 : 84 650 362–84 650 527, 166 basesExon 12 : 84 651 883–84 651 997, 115 basesExon 11 : 84 655 832–84 656 005, 174 basesExon 10 : 84 656 348–84 656 484, 137 basesExon 9 : 84 658 318–84 658 468, 151 basesExon 8 : 84 662 198–84 662 375, 178 basesExon 7 : 84 662 455–84 662 530, 76 basesExon 6 : 84 664 417–84 664 552, 136 basesExon 5 : 84 666 122–84 666 232, 111 basesExon 4 : 84 669 681–84 669 893, 213 basesExon 3 : 84 670 646–84 670 815, 170 basesExon 2 : 84 671 177–84 671 308, 132 basesExon 1 : 84 690 371–84 690 461, 91 bases141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,8 kb sur les 46,8 kb du gène ; 1 845 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

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Dante Labs. (s.d.). Gène SSX2IP : SSX family member 2 interacting protein. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ssx2ip

Vancouver

Dante Labs. Gène SSX2IP : SSX family member 2 interacting protein [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ssx2ip

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