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Gène

SMCO2

single-pass membrane protein with coiled-coil domains 2

Résumé

Localisation cytogénétique
12p11.23
Coordonnées
Chromosome 12 : 27 446 736–27 502 185 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 55,5 kb
Protéine
343 acides aminés
Aussi appelé
LOC341346
Symboles précédents
C12orf70
Transcrit MANE Select
ENST00000535986.2NM_001395208.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SMCO2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SMCO2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de SMCO2. SMCO2 et 11 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 26 974 461 à 27 974 460.Chromosome 1212p11.23p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3327 Mb27,2 Mb27,4 Mb27,6 Mb27,8 MbTM7SF3 : 26 954 298–27 014 507, brin inverseTM7SF3MED21 : 27 022 544–27 066 343, brin directMED21C12orf71 : 27 081 057–27 084 592, brin inverseC12orf71STK38L : 27 243 968–27 325 961, brin directSTK38LBMAL2 : 27 332 801–27 425 289, brin directBMAL2SMCO2 : 27 446 736–27 502 185, brin directSMCO2PPFIBP1 : 27 523 431–27 696 302, brin directPPFIBP1REP15 : 27 696 447–27 697 596, brin directREP15MRPS35 : 27 710 796–27 756 301, brin directMRPS35MANSC4 : 27 762 291–27 780 236, brin inverseMANSC4KLHL42 : 27 779 415–27 803 040, brin directKLHL42PTHLH : 27 958 084–27 972 755, brin inversePTHLHSchéma de SMCO2 : 9 exons sur le brin direct du chromosome 12Exon 1 : 27 446 736–27 446 825, 90 basesExon 2 : 27 470 622–27 470 765, 144 basesExon 3 : 27 472 776–27 472 875, 100 basesExon 4 : 27 474 786–27 474 913, 128 basesExon 5 : 27 475 582–27 475 731, 150 basesExon 6 : 27 488 460–27 488 547, 88 basesExon 7 : 27 494 300–27 494 356, 57 basesExon 8 : 27 495 680–27 495 855, 176 basesExon 9 : 27 501 923–27 502 185, 263 bases1246895′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,2 kb sur les 55,5 kb du gène ; 1 032 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SMCO2 : single-pass membrane protein with coiled-coil domains 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/smco2

Vancouver

Dante Labs. Gène SMCO2 : single-pass membrane protein with coiled-coil domains 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/smco2

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