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Gène

SLCO5A1

solute carrier organic anion transporter family member 5A1

Résumé

Localisation cytogénétique
8q13.3
Coordonnées
Chromosome 8 : 69 667 046–69 834 978 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 167,9 kb
Protéine
848 acides aminés
Aussi appelé
OATPRP4, OATP-J, OATP5A1
Symboles précédents
SLC21A15
Transcrit MANE Select
ENST00000260126.9NM_030958.3
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SLCO5A1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SLCO5A1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 8, avec un crochet à l'emplacement de SLCO5A1. SLCO5A1 et 3 gènes à proximité sur le chromosome 8, de 69 251 012 à 70 251 011.Chromosome 88q13.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.369,4 Mb69,6 Mb69,8 Mb70 Mb70,2 MbSULF1 : 69 466 618–69 660 935, brin directSULF1SLCO5A1 : 69 667 046–69 834 978, brin inverseSLCO5A1PRDM14 : 70 049 063–70 072 862, brin inversePRDM14NCOA2 : 70 109 772–70 456 452, brin inverseNCOA2Schéma de SLCO5A1 : 10 exons sur le brin inverse du chromosome 8Exon 10 : 69 667 046–69 673 326, 6 281 basesExon 9 : 69 676 609–69 676 673, 65 basesExon 8 : 69 679 378–69 679 619, 242 basesExon 7 : 69 682 184–69 682 343, 160 basesExon 6 : 69 705 031–69 705 229, 199 basesExon 5 : 69 738 040–69 738 204, 165 basesExon 4 : 69 755 424–69 755 641, 218 basesExon 3 : 69 761 743–69 761 875, 133 basesExon 2 : 69 831 767–69 833 169, 1 403 basesExon 1 : 69 834 854–69 834 978, 125 bases10515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 9 kb sur les 167,9 kb du gène ; 2 547 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SLCO5A1 : solute carrier organic anion transporter family member 5A1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/slco5a1

Vancouver

Dante Labs. Gène SLCO5A1 : solute carrier organic anion transporter family member 5A1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/slco5a1

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