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Gène

PTPRS

protein tyrosine phosphatase receptor type S

Résumé

Localisation cytogénétique
19p13.3
Coordonnées
Chromosome 19 : 5 205 508–5 340 812 (GRCh38)
Exons
38 exons sur 135,3 kb
Protéine
1 948 acides aminés
Aussi appelé
PTPsigma, PTP-sigma
Transcrit MANE Select
ENST00000262963.11NM_002850.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PTPRS. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PTPRS

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de PTPRS. PTPRS et 15 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 4 773 160 à 5 773 159.Chromosome 1919p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.434,8 Mb5 Mb5,2 Mb5,4 Mb5,6 MbFEM1A : 4 791 734–4 801 273, brin directFEM1ATICAM1 : 4 815 932–4 831 749, brin inverseTICAM1PLIN3 : 4 838 334–4 867 717, brin inversePLIN3ARRDC5 : 4 890 437–4 902 948, brin inverseARRDC5UHRF1 : 4 903 080–4 962 154, brin directUHRF1KDM4B : 4 969 106–5 153 611, brin directKDM4BPTPRS : 5 205 508–5 340 812, brin inversePTPRSZNRF4 : 5 455 417–5 456 856, brin directZNRF4TINCR : 5 552 723–5 578 349, brin inverseTINCRSAFB2 : 5 586 981–5 624 046, brin inverseSAFB2SAFB : 5 622 963–5 668 478, brin directSAFBRPL36 : 5 674 947–5 691 881, brin directRPL36MICOS13 : 5 678 414–5 680 940, brin inverseMICOS13HSD11B1L : 5 680 604–5 688 524, brin directHSD11B1LLONP1 : 5 691 834–5 720 572, brin inverseLONP1CATSPERD : 5 720 637–5 778 734, brin directSchéma de PTPRS : 38 exons sur le brin inverse du chromosome 19Exon 38 : 5 205 508–5 206 842, 1 335 basesExon 37 : 5 207 922–5 208 057, 136 basesExon 36 : 5 208 237–5 208 391, 155 basesExon 35 : 5 210 469–5 210 594, 126 basesExon 34 : 5 210 679–5 210 805, 127 basesExon 33 : 5 211 590–5 211 768, 179 basesExon 32 : 5 211 965–5 212 250, 286 basesExon 31 : 5 212 337–5 212 491, 155 basesExon 30 : 5 214 361–5 214 480, 120 basesExon 29 : 5 214 561–5 214 736, 176 basesExon 28 : 5 215 289–5 215 412, 124 basesExon 27 : 5 215 498–5 215 595, 98 basesExon 26 : 5 216 720–5 216 767, 48 basesExon 25 : 5 218 420–5 218 532, 113 basesExon 24 : 5 218 787–5 218 798, 12 basesExon 23 : 5 219 310–5 219 467, 158 basesExon 22 : 5 219 939–5 220 154, 216 basesExon 21 : 5 220 260–5 220 353, 94 basesExon 20 : 5 221 000–5 221 253, 254 basesExon 19 : 5 222 123–5 222 220, 98 basesExon 18 : 5 222 689–5 223 297, 609 basesExon 17 : 5 225 727–5 225 844, 118 basesExon 16 : 5 229 316–5 229 342, 27 basesExon 15 : 5 229 491–5 229 684, 194 basesExon 14 : 5 231 310–5 231 615, 306 basesExon 13 : 5 238 919–5 239 063, 145 basesExon 12 : 5 240 199–5 240 332, 134 basesExon 11 : 5 243 901–5 244 482, 582 basesExon 10 : 5 245 776–5 246 045, 270 basesExon 9 : 5 256 108–5 256 119, 12 basesExon 8 : 5 258 017–5 258 127, 111 basesExon 7 : 5 260 805–5 260 822, 18 basesExon 6 : 5 262 964–5 262 972, 9 basesExon 5 : 5 265 008–5 265 196, 189 basesExon 4 : 5 273 442–5 273 583, 142 basesExon 3 : 5 274 199–5 274 344, 146 basesExon 2 : 5 286 050–5 286 234, 185 basesExon 1 : 5 340 664–5 340 812, 149 bases3830201015′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 7,4 kb sur les 135,3 kb du gène ; 5 847 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène PTPRS : protein tyrosine phosphatase receptor type S. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ptprs

Vancouver

Dante Labs. Gène PTPRS : protein tyrosine phosphatase receptor type S [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ptprs

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