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Gène

PTPN12

protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12

Résumé

Localisation cytogénétique
7q11.23
Coordonnées
Chromosome 7 : 77 537 295–77 640 069 (GRCh38)
Exons
18 exons sur 102,8 kb
Protéine
780 acides aminés
Aussi appelé
PTPG1, PTP-PEST
Transcrit MANE Select
ENST00000248594.11NM_002835.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PTPN12. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PTPN12

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 7, avec un crochet à l'emplacement de PTPN12. PTPN12 et 7 gènes à proximité sur le chromosome 7, de 77 088 682 à 78 088 681.Chromosome 77q11.23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.377,2 Mb77,4 Mb77,6 Mb77,8 Mb78 MbCCDC146 : 77 122 434–77 329 533, brin directCCDC146FGL2 : 77 193 182–77 199 884, brin inverseFGL2GSAP : 77 310 483–77 416 607, brin inverseGSAPPTPN12 : 77 537 295–77 640 069, brin directPTPN12RSBN1L : 77 696 440–77 783 022, brin directRSBN1LTMEM60 : 77 793 728–77 799 723, brin inverseTMEM60PHTF2 : 77 798 652–77 957 503, brin directPHTF2MAGI2 : 78 017 055–79 453 845, brin inverseMAGI2Schéma de PTPN12 : 18 exons sur le brin direct du chromosome 7Exon 1 : 77 537 295–77 537 645, 351 basesExon 2 : 77 571 078–77 571 186, 109 basesExon 3 : 77 581 427–77 581 503, 77 basesExon 4 : 77 583 555–77 583 650, 96 basesExon 5 : 77 585 543–77 585 581, 39 basesExon 6 : 77 592 185–77 592 256, 72 basesExon 7 : 77 597 842–77 597 901, 60 basesExon 8 : 77 600 664–77 600 806, 143 basesExon 9 : 77 607 235–77 607 301, 67 basesExon 10 : 77 610 765–77 610 842, 78 basesExon 11 : 77 610 948–77 611 046, 99 basesExon 12 : 77 618 480–77 618 565, 86 basesExon 13 : 77 626 705–77 627 675, 971 basesExon 14 : 77 632 348–77 632 425, 78 basesExon 15 : 77 635 782–77 635 849, 68 basesExon 16 : 77 637 018–77 637 048, 31 basesExon 17 : 77 638 624–77 638 731, 108 basesExon 18 : 77 639 219–77 640 069, 851 bases1246810121416185′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,4 kb sur les 102,8 kb du gène ; 2 343 de ces bases codent pour la protéine.

Traits associés à PTPN12

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que PTPN12 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PTPN12 : protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ptpn12

Vancouver

Dante Labs. Gène PTPN12 : protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ptpn12

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