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Gène

PDXDC1

pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1

Résumé

Localisation cytogénétique
16p13.11
Coordonnées
Chromosome 16 : 14 975 026–15 038 332 (GRCh38)
Exons
23 exons sur 63,3 kb
Protéine
788 acides aminés
Aussi appelé
KIAA0251
Transcrit MANE Select
ENST00000396410.9NM_015027.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PDXDC1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PDXDC1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de PDXDC1. PDXDC1 et 13 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 14 506 679 à 15 506 678.Chromosome 1616p13.11p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.314,6 Mb14,8 Mb15 Mb15,2 Mb15,4 MbPARN : 14 435 699–14 632 728, brin inversePARNBFAR : 14 632 813–14 669 252, brin directBFARPLA2G10 : 14 672 382–14 694 493, brin inversePLA2G10NPIPA3 : 14 703 411–14 726 342, brin directNPIPA3NPIPA2 : 14 742 533–14 765 462, brin directNPIPA2NOMO1 : 14 833 691–14 896 158, brin directNOMO1NPIPA1 : 14 922 802–14 952 060, brin directNPIPA1PDXDC1 : 14 975 026–15 038 332, brin directPDXDC1NTAN1 : 15 037 853–15 056 082, brin inverseNTAN1RRN3 : 15 059 964–15 094 311, brin inverseRRN3NPIPA5 : 15 363 628–15 381 047, brin inverseNPIPA5MPV17L : 15 395 747–15 413 271, brin directMPV17L : 15 395 754–15 515 348, brin directBMERB1 : 15 434 475–15 625 028, brin directBMERB1Schéma de PDXDC1 : 23 exons sur le brin direct du chromosome 16Exon 1 : 14 975 026–14 975 220, 195 basesExon 2 : 14 997 753–14 997 826, 74 basesExon 3 : 14 998 340–14 998 405, 66 basesExon 4 : 15 001 776–15 001 856, 81 basesExon 5 : 15 004 187–15 004 333, 147 basesExon 6 : 15 006 394–15 006 583, 190 basesExon 7 : 15 008 779–15 008 847, 69 basesExon 8 : 15 009 681–15 009 759, 79 basesExon 9 : 15 016 129–15 016 213, 85 basesExon 10 : 15 017 120–15 017 168, 49 basesExon 11 : 15 017 321–15 017 422, 102 basesExon 12 : 15 018 840–15 018 965, 126 basesExon 13 : 15 022 704–15 022 754, 51 basesExon 14 : 15 026 643–15 026 706, 64 basesExon 15 : 15 028 878–15 028 966, 89 basesExon 16 : 15 029 951–15 030 056, 106 basesExon 17 : 15 031 735–15 031 906, 172 basesExon 18 : 15 032 861–15 032 979, 119 basesExon 19 : 15 033 278–15 033 399, 122 basesExon 20 : 15 034 286–15 034 378, 93 basesExon 21 : 15 034 457–15 034 553, 97 basesExon 22 : 15 035 449–15 035 553, 105 basesExon 23 : 15 036 016–15 038 332, 2 317 bases15101520235′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,6 kb sur les 63,3 kb du gène ; 2 367 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PDXDC1 : pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pdxdc1

Vancouver

Dante Labs. Gène PDXDC1 : pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pdxdc1

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