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Gène

KRTAP13-4

keratin associated protein 13-4

Résumé

Localisation cytogénétique
21q22.11
Coordonnées
Chromosome 21 : 30 430 220–30 431 026 (GRCh38)
Exons
1 exon sur 0,8 kb
Protéine
160 acides aminés
Aussi appelé
KAP13.4
Transcrit MANE Select
ENST00000334068.4NM_181600.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore KRTAP13-4. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de KRTAP13-4

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 21, avec un crochet à l'emplacement de KRTAP13-4. KRTAP13-4 et 34 gènes à proximité sur le chromosome 21, de 29 930 623 à 30 930 622.Chromosome 2121q22.11p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.330 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbGRIK1 : 29 536 933–29 940 033, brin inverseGRIK1CLDN17 : 30 165 565–30 166 805, brin inverseCLDN17CLDN8 : 30 214 006–30 216 097, brin inverseCLDN8KRTAP24-1 : 30 281 309–30 282 950, brin inverseKRTAP25-1 : 30 289 145–30 289 514, brin inverseKRTAP25-1KRTAP26-1 : 30 319 124–30 320 315, brin inverseKRTAP26-1KRTAP27-1 : 30 337 013–30 337 694, brin inverseKRTAP27-1KRTAP23-1 : 30 348 399–30 348 606, brin inverseKRTAP23-1KRTAP13-2 : 30 371 390–30 372 271, brin inverseKRTAP13-1 : 30 396 031–30 396 822, brin directKRTAP13-1KRTAP13-3 : 30 425 380–30 425 926, brin inverseKRTAP13-3KRTAP13-4 : 30 430 220–30 431 026, brin directKRTAP13-4KRTAP15-1 : 30 440 275–30 440 869, brin directKRTAP15-1KRTAP19-1 : 30 479 706–30 480 367, brin inverseKRTAP19-2 : 30 487 043–30 487 436, brin inverseKRTAP19-2KRTAP19-3 : 30 491 462–30 492 013, brin inverseKRTAP19-4 : 30 496 824–30 497 165, brin inverseKRTAP19-5 : 30 501 657–30 502 141, brin inverseKRTAP19-6 : 30 541 535–30 541 864, brin inverseKRTAP19-6KRTAP19-7 : 30 560 875–30 561 314, brin inverseKRTAP19-7KRTAP22-2 : 30 590 105–30 590 397, brin inverseKRTAP22-2KRTAP6-3 : 30 592 440–30 593 055, brin directKRTAP6-3KRTAP6-2 : 30 598 590–30 598 902, brin inverseKRTAP22-1 : 30 601 087–30 601 382, brin directKRTAP6-1 : 30 613 431–30 613 930, brin inverseKRTAP20-1 : 30 616 425–30 616 699, brin directKRTAP20-4 : 30 620 627–30 620 850, brin directKRTAP20-2 : 30 635 206–30 635 619, brin directKRTAP20-3 : 30 642 864–30 643 136, brin directKRTAP21-3 : 30 718 525–30 718 777, brin inverseKRTAP21-3KRTAP21-2 : 30 746 794–30 747 259, brin inverseKRTAP21-2KRTAP21-1 : 30 755 015–30 755 428, brin inverseKRTAP21-1KRTAP8-1 : 30 812 697–30 813 274, brin inverseKRTAP8-1KRTAP7-1 : 30 829 039–30 829 759, brin inverseKRTAP7-1KRTAP11-1 : 30 880 644–30 881 580, brin inverseKRTAP11-1Schéma de KRTAP13-4 : un exon sur le brin direct du chromosome 21Exon 1 : 30 430 220–30 431 026, 807 bases15′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 0,8 kb sur les 0,8 kb du gène ; 483 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de KRTAP13-4

0Facile

Difficulté de séquençage de KRTAP13-4 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de KRTAP13-4 se situent dans des zones où les lectures courtes se positionnent sans ambiguïté.

Facteur aggravant : la part des exons de KRTAP13-4 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Partagé avec le chrY0 %
  • Couverture de la référence0 %
  • Répétitions0 %
  • Teneur en GC0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène KRTAP13-4 : keratin associated protein 13-4. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/krtap13-4

Vancouver

Dante Labs. Gène KRTAP13-4 : keratin associated protein 13-4 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/krtap13-4

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