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Gène

GSE1

Gse1 coiled-coil protein

Résumé

Localisation cytogénétique
16q24.1
Coordonnées
Chromosome 16 : 85 613 322–85 676 200 (GRCh38)
Exons
16 exons sur 62,9 kb
Protéine
1 217 acides aminés
Symboles précédents
KIAA0182
Transcrit MANE Select
ENST00000253458.12NM_014615.5
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore GSE1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de GSE1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de GSE1. GSE1 et 5 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 85 144 761 à 86 144 760.Chromosome 1616q24.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.385,2 Mb85,4 Mb85,6 Mb85,8 Mb86 MbGSE1 : 85 613 322–85 676 200, brin directGSE1GINS2 : 85 673 164–85 690 073, brin inverseGINS2CLMB : 85 690 084–85 751 143, brin inverseCLMBEMC8 : 85 771 758–85 800 193, brin inverseEMC8COX4I1 : 85 798 633–85 810 195, brin directCOX4I1IRF8 : 85 899 116–85 922 606, brin directIRF8Schéma de GSE1 : 16 exons sur le brin direct du chromosome 16Exon 1 : 85 613 322–85 613 398, 77 basesExon 2 : 85 633 914–85 634 132, 219 basesExon 3 : 85 648 552–85 648 751, 200 basesExon 4 : 85 654 278–85 654 450, 173 basesExon 5 : 85 654 794–85 654 991, 198 basesExon 6 : 85 655 726–85 655 917, 192 basesExon 7 : 85 656 343–85 656 665, 323 basesExon 8 : 85 657 277–85 657 604, 328 basesExon 9 : 85 661 146–85 661 765, 620 basesExon 10 : 85 662 981–85 663 093, 113 basesExon 11 : 85 663 344–85 663 614, 271 basesExon 12 : 85 665 015–85 665 128, 114 basesExon 13 : 85 665 976–85 666 347, 372 basesExon 14 : 85 668 140–85 668 424, 285 basesExon 15 : 85 670 995–85 671 098, 104 basesExon 16 : 85 672 405–85 676 200, 3 796 bases12468101214165′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 7,4 kb sur les 62,9 kb du gène ; 3 654 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de GSE1

5Faible

Difficulté de séquençage de GSE1 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions6 %
  • Teneur en GC41 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène GSE1 : Gse1 coiled-coil protein. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/gse1

Vancouver

Dante Labs. Gène GSE1 : Gse1 coiled-coil protein [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/gse1

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