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Gène

COL6A6

collagen type VI alpha 6 chain

Résumé

Localisation cytogénétique
3q22.1
Coordonnées
Chromosome 3 : 130 517 177–130 677 042 (GRCh38)
Exons
37 exons sur 159,9 kb
Protéine
2 263 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000358511.11NM_001102608.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore COL6A6. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de COL6A6

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de COL6A6. COL6A6 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 130 097 110 à 131 097 109.Chromosome 33q22.1p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29130,2 Mb130,4 Mb130,6 Mb130,8 Mb131 MbALG1L2 : 130 081 831–130 113 227, brin directALG1L2COL6A5 : 130 345 516–130 484 846, brin directCOL6A5COL6A6 : 130 517 177–130 677 042, brin directCOL6A6PIK3R4 : 130 678 923–130 746 857, brin inversePIK3R4ATP2C1 : 130 850 504–131 016 759, brin directATP2C1ASTE1 : 131 013 065–131 027 649, brin inverseASTE1NEK11 : 131 026 845–131 353 043, brin directNEK11Schéma de COL6A6 : 37 exons sur le brin direct du chromosome 3Exon 1 : 130 517 177–130 517 397, 221 basesExon 2 : 130 560 334–130 560 428, 95 basesExon 3 : 130 563 068–130 563 664, 597 basesExon 4 : 130 564 994–130 565 614, 621 basesExon 5 : 130 566 702–130 567 262, 561 basesExon 6 : 130 568 047–130 568 604, 558 basesExon 7 : 130 570 818–130 571 393, 576 basesExon 8 : 130 573 956–130 574 525, 570 basesExon 9 : 130 581 561–130 581 904, 344 basesExon 10 : 130 581 990–130 582 068, 79 basesExon 11 : 130 586 506–130 586 660, 155 basesExon 12 : 130 589 090–130 589 182, 93 basesExon 13 : 130 591 041–130 591 094, 54 basesExon 14 : 130 592 541–130 592 612, 72 basesExon 15 : 130 592 696–130 592 722, 27 basesExon 16 : 130 593 061–130 593 105, 45 basesExon 17 : 130 593 199–130 593 252, 54 basesExon 18 : 130 594 281–130 594 343, 63 basesExon 19 : 130 598 365–130 598 430, 66 basesExon 20 : 130 599 757–130 599 810, 54 basesExon 21 : 130 606 931–130 606 966, 36 basesExon 22 : 130 608 902–130 608 964, 63 basesExon 23 : 130 610 649–130 610 711, 63 basesExon 24 : 130 621 821–130 621 883, 63 basesExon 25 : 130 626 485–130 626 547, 63 basesExon 26 : 130 627 319–130 627 369, 51 basesExon 27 : 130 634 590–130 634 625, 36 basesExon 28 : 130 635 699–130 635 761, 63 basesExon 29 : 130 641 652–130 641 714, 63 basesExon 30 : 130 642 832–130 642 867, 36 basesExon 31 : 130 642 987–130 643 023, 37 basesExon 32 : 130 644 991–130 645 002, 12 basesExon 33 : 130 649 069–130 649 562, 494 basesExon 34 : 130 658 676–130 658 772, 97 basesExon 35 : 130 661 637–130 662 308, 672 basesExon 36 : 130 665 003–130 665 096, 94 basesExon 37 : 130 675 202–130 677 042, 1 841 bases15101520253035375′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 8,7 kb sur les 159,9 kb du gène ; 6 792 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène COL6A6 : collagen type VI alpha 6 chain. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/col6a6

Vancouver

Dante Labs. Gène COL6A6 : collagen type VI alpha 6 chain [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/col6a6

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