ATROPHIE MUSCULAIRE SPINALE

Atrophie musculaire spinale — une personne sur 50 est porteuse d'une variante du gène SMN1. Le dépistage du statut de porteur avant la planification familiale et le diagnostic précoce chez les nouveau-nés permettent d'accéder à des thérapies géniques susceptibles de changer la donne.

Le séquençage du génome entier permet d'identifier les délétions du gène SMN1 et le nombre de copies du gène SMN2, ce qui rend possible un traitement présymptomatique par thérapie génique ou par des médicaments modificateurs de la maladie.

Certifié CLIA Accrédité CAP Laboratoire médical ISO 15189 Offres d'emploi de l'ACMG HIPAA et RGPD Plus de 100 000génomes séquencés
À PROPOS DE L'ATROPHIE MUSCULAIRE SPINALE

Atrophie musculaire spinale (AMS)

Spinal muscular atrophy (SMA) is an autosomal recessive motor neuron disease caused by loss of function of SMN1 (survival motor neuron 1) gene, resulting in degeneration of anterior horn motor neurons. Incidence is approximately 1 in 6,000–10,000 live births; carrier frequency is approximately 1 in 50 across populations. SMA is characterized by progressive weakness, starting proximally and advancing distally, with respiratory and bulbar involvement in severe forms. The disease is classified into types based on age of onset and maximum motor function achieved: Type I (severe, onset <6 months, never able to sit independently, often fatal by age 2 without treatment), Type II (intermediate, onset 6–18 months, able to sit but never walk), Type III (mild, onset >18 months, able to walk), and Type IV (adult-onset). Approximately 95–98% of SMA cases are caused by homozygous deletion of SMN1 exons 7–8; the remaining cases result from homozygous or compound heterozygous point mutations. Disease severity is dramatically modulated by SMN2 copy number: SMN2 encodes an almost identical protein but with a critical splicing difference that produces mostly non-functional truncated protein; however, approximately 15% of SMN2 transcripts include exon 7, producing functional SMN protein.

Les gènes SMN1 et SMN2 sont pratiquement identiques (99,9 % d'homologie de séquence) et sont situés en tandem sur le chromosome 5q13, une région caractérisée par une forte homologie de séquence et de fréquentes variations du nombre de copies. Le gène SMN code pour la protéine de survie des motoneurones, essentielle à la biogenèse des snRNP et à l'épissage de l'ARNm dans les neurones ; la perte de la protéine SMN entraîne une dégénérescence des motoneurones. Le gène SMN2 est présent en plusieurs copies chez la plupart des individus (1 à 4 copies, médiane de 2) en raison d'une duplication. Bien que le gène SMN2 ne puisse pas compenser entièrement la perte du gène SMN1 en raison d'un déficit d'épissage de l'exon 7, le nombre de copies du gène SMN2 détermine de manière critique la gravité de la maladie : 1 à 2 copies produisent généralement le type I (grave) ; 3 copies correspondent au type II (intermédiaire) ; 3 à 4 copies correspondent au type III (léger). Les patients atteints d'AMS présymptomatiques dépistés lors du dépistage néonatal et présentant 2 à 3 copies du gène SMN2 sont exposés à un risque de type I ou II ; ceux présentant ≥ 4 copies ont un risque immédiat plus faible, bien qu'un traitement précoce puisse prévenir l'expression du phénotype dans tous les cas.

Le génotypage des gènes SMN1/SMN2 est essentiel pour le diagnostic de l'amyotrophie spinale (SMA) et le choix du traitement. Trois traitements approuvés sont disponibles : le nusinersen (Spinraza), un oligonucléotide antisens administré par voie intrathécale qui module l'épissage du gène SMN2 afin d'augmenter l'inclusion de l'exon 7 et la production de la protéine SMN2 pleine longueur ; l'onasemnogène abeparvovec (Zolgensma), une thérapie génique utilisant l'AAV9 pour administrer par voie intraveineuse, en une seule perfusion, de l'ADNc fonctionnel du gène SMN1 — une approche curative unique désormais privilégiée chez les patients présymptomatiques ; et le risdiplam (Evrysdi), un modificateur d'épissage oral permettant un traitement à domicile. Le traitement présymptomatique (nourrissons diagnostiqués à la naissance) produit des résultats nettement améliorés : la plupart des nourrissons présymptomatiques traités ne développent jamais de symptômes observables de la SMA et atteignent des étapes motrices normales ou quasi normales. Le nombre de copies du gène SMN2 aide à prédire la gravité naturelle de la maladie et guide le pronostic, bien qu'un traitement précoce puisse empêcher l'expression du phénotype même chez les patients destinés à être de type I.

POURQUOI LE SÉQUENÇAGE DU GÉNOME COMPLET ?

Le séquençage standard ne permet pas de distinguer de manière fiable le gène SMN1 du gène SMN2 en raison de leur forte homologie de séquence. Une analyse spécialisée du nombre de copies est nécessaire.

La détermination du nombre de copies des gènes SMN1 et SMN2 nécessite une analyse spécialisée

L'amyotrophie spinale (SMA) fait désormais partie du RUSP (panel recommandé pour le dépistage néonatal) dans la plupart des États américains, et le dépistage des porteurs est de plus en plus courant. Le séquençage standard ne permet pas de distinguer de manière fiable les copies des gènes SMN1 et SMN2 en raison de leur homologie de séquence de 99,9 % ; des techniques spécialisées d'analyse du nombre de copies (hybridation génomique comparative, MLPA ou NGS ciblé avec cartographie spécialisée des lectures) sont nécessaires. Les panels de dépistage des porteurs détectent généralement la délétion du gène SMN1, mais peuvent ne pas déterminer avec précision le nombre de copies du gène SMN2. Le séquençage du génome entier, associé à des algorithmes spécialisés de détection du nombre de copies, permet une évaluation précise du nombre de copies des gènes SMN1 et SMN2, ce qui rend possible un dépistage complet des porteurs et une prédiction de la gravité de la maladie.

Le nombre de copies du gène SMN2 détermine la gravité de la maladie et oriente le traitement présymptomatique

Le nombre de copies du gène SMN2 est le principal facteur déterminant de la gravité : 1 à 2 copies indiquent une forme de type I (grave, apparition infantile) ; 3 copies indiquent une forme de type II (intermédiaire, apparition entre 6 et 18 mois) ; 3 à 4 copies correspondent à une forme de type III (légère, avec capacité à marcher). Les patients atteints de SMA présymptomatique dépistés lors du dépistage néonatal et présentant 2 à 3 copies du gène SMN2 courent un risque de progression rapide de la maladie et nécessitent la mise en place immédiate d'un traitement. Ceux qui présentent ≥ 4 copies ont un risque immédiat plus faible, mais bénéficient d'un traitement précoce. Trois traitements approuvés offrent des résultats transformateurs : la thérapie génique (Zolgensma) est un traitement curatif unique ; la thérapie antisens (Spinraza) nécessite des perfusions intrathécales répétées ; le traitement oral (Evrysdi) permet un traitement à domicile. Consigné dans le dossier médical, le génotype SMN permet un diagnostic présymptomatique et la mise en place rapide d’un traitement, prévenant ainsi le développement de la maladie et permettant un développement moteur normal.

CE QUE SIGNIFIE RÉELLEMENT LE SÉQUENÇAGE DE VOTRE GÉNOME ENTIER
01

L'intégralité de votre ADN (et non pas seulement une partie)

Les tests génétiques traditionnels ne portent que sur des ensembles restreints de gènes, laissant de côté la majeure partie de votre génome. Nous séquençons l'intégralité de votre génome : chaque gène et chaque région entre les gènes.

02

Analyses approfondies et rapports spécialisés

Facile à lire et contenant des réponses sur lesquelles vous et votre médecin pouvez vous appuyer. Pas un dossier à décrypter — plus de 200 rapports cliniques, classés par catégorie.

03

Votre test gagne en valeur chaque année

Votre ADN ne change pas, mais les progrès de la génomique s'accélèrent. Chaque mois, de nouveaux liens entre des variants et des maladies sont mis en évidence. Nous validons ces résultats et mettons automatiquement à jour vos rapports. Votre test gagne en valeur chaque année.

RÉSULTATS

Les résultats que les médecins obtiennent dans les cas les plus difficiles.

Quarante ans d'incertitude. Un seul test.

Un patient avait passé des décennies dans le système de santé britannique sans qu'aucun diagnostic ne lui soit posé. Les données de Dante, acceptées par les équipes cliniques du NHS à l'hôpital universitaire Queen Elizabeth de Glasgow, ont permis d'identifier le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante du gène RUNX1 associée à la leucémie, qui était restée inaperçue. Après 40 ans, ils ont enfin obtenu une réponse.

Une lecture attentive permet d'avoir une vision d'ensemble.

Un patient s'est présenté chez Dante pour faire examiner une paralysie périodique. L'analyse du génome complet a permis de mettre en évidence une affection cardiaque héréditaire concomitante — le syndrome de Brugada — que son médecin a confirmée par un ECG. Ce résultat a également permis d'expliquer les antécédents cardiaques inexpliqués d'un membre de sa famille. Un seul test. Toutes les réponses s'y trouvent.

Séquençage effectué en 2019. Les données ont été analysées en 2021.

Jennifer a fait séquencer son génome avec Dante deux ans avant que son cancer du sein ne soit diagnostiqué. Lorsque le traitement a commencé, les données pharmacogénomiques de Dante ont montré que la chimiothérapie qui lui avait été prescrite entraînerait de graves effets indésirables. Son médecin a choisi une alternative — et elle a pu bénéficier d'un traitement efficace dès le premier jour.

Voir les résultats →
À QUI NOUS VENONS EN AIDE

Toute question d'ordre génétique mérite une réponse exhaustive.

Que vous cherchiez des réponses aujourd’hui ou que vous souhaitiez préserver votre santé pour demain, le séquençage complet de votre génome est le seul point de départ possible.

RISQUE HÉRÉDITAIRE

C'est de famille. Vous pouvez désormais savoir si c'est dans vos gènes.

Votre génome contient des variants héréditaires associés à des pathologies telles que les maladies cardiaques, le cancer et les troubles neurologiques. Nous les analysons tous, en y apportant toute la rigueur clinique nécessaire pour donner tout son sens au résultat.

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SYMPTÔMES INEXPLIQUÉS

Quand les analyses de laboratoire classiques indiquent que tout va bien. Et que vous savez que ce n'est pas le cas.

Les tests de dépistage classiques recherchent un ensemble prédéfini de réponses. Nous séquencons l'intégralité de votre ADN — y compris les parties qu'aucun test n'a été conçu pour analyser. Si la réponse se trouve dans votre génome, nous vous aiderons à la trouver.

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LE TRAITEMENT NE FONCTIONNE PAS

Votre diagnostic est peut-être correct. Votre plan de traitement est peut-être incomplet.

Vos gènes déterminent quels traitements ont le plus de chances d'être efficaces — et lesquels ne le sont pas. Nous fournissons à votre médecin les outils et les informations nécessaires pour établir votre plan de traitement.

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SANTÉ PRÉVENTIVE

Tu veux le savoir avant que quelque chose ne t'oblige à te poser la question.

Certaines personnes n'attendent pas d'avoir reçu un diagnostic ou de connaître leurs antécédents familiaux pour agir. Le séquençage du génome complet vous offre dès aujourd'hui une vue d'ensemble complète de votre profil génétique, ce qui vous permet, à vous et à votre médecin, de prendre des décisions éclairées avant que la situation ne devienne urgente.

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DÉJÀ TESTÉ

Vous avez déjà fait un test ADN. Voici ce qu'il n'a pas pu vous révéler.

La plupart des tests ADN grand public analysent moins de 0,1 % de votre génome. Nous, nous l'analysons dans son intégralité.

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Des résultats de qualité clinique. Choisi par les particuliers, recommandé par les médecins pour leurs cas les plus complexes.

30X couverture du génome entier
Plus de 5 millions variantes identifiées par test
Plus de 200 rapports cliniques personnalisés
99,98 % précision de séquençage

Le test Dante Genome a aidé les spécialistes d'un hôpital universitaire britannique spécialisé dans les soins aigus à diagnostiquer le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante génétique rare associée à une leucémie qui n'avait pas été détectée auparavant. Ce résultat a bouleversé la prise en charge médicale du patient.

Reconnu par et publié dans

Amendements relatifs à l'amélioration des laboratoires cliniques Collège américain des pathologistes Société américaine de génétique humaine Nature Société internationale de thérapie cellulaire et génique Gene Journal
FOIRE AUX QUESTIONS

Questions fréquentes sur le séquençage du génome entier.

Quelle est la différence entre le séquençage du génome entier et un test génétique ciblé ?

Les tests génétiques ciblés — y compris les panels standard de dépistage du cancer héréditaire — analysent une liste prédéfinie de variants connus au sein d'un ensemble spécifique de gènes. Ils sont conçus pour détecter ce qu'ils savent déjà rechercher. Le séquençage du génome entier analyse l'intégralité de votre génome : les 6 milliards de paires de bases, chaque gène, chaque région entre les gènes. Une étude de la Mayo Clinic publiée dans JAMA Oncology a révélé que les directives de dépistage standard ne détectaient pas plus de la moitié des patients présentant des mutations cancéreuses héréditaires. Le test génomique ne dispose pas d’une liste fixe.

Que vais-je recevoir lorsque mes résultats seront prêts ?

Votre Dante Genome vous fournit plus de 200 rapports prêts à être utilisés par les médecins, classés par catégorie clinique : cancers héréditaires, maladies cardiaques, maladies rares, pharmacogénomique, statut de porteur, etc. Les rapports sont transmis à votre Genome Manager sécurisé et sont présentés sous un format prêt à l'emploi en milieu clinique. Vos données génomiques sont conservées de manière permanente et réanalysées automatiquement à mesure que la science progresse.

Que se passe-t-il si une variante cliniquement significative est détectée ?

Si un variant pathogène ou potentiellement pathogène est identifié, il sera clairement signalé dans votre rapport destiné au médecin, accompagné du contexte clinique, des données scientifiques publiées et des mesures recommandées. Nous vous recommandons de faire part de tout résultat cliniquement significatif à votre médecin ou à un conseiller en génétique, qui pourra vous aider à prendre des décisions concernant la surveillance, la réduction des risques ou le dépistage en cascade des membres de votre famille.

En quoi cela diffère-t-il d'un test ADN grand public comme 23andMe ou AncestryDNA ?

Les tests ADN grand public utilisent des puces de génotypage qui analysent moins de 0,1 % de votre génome — un minuscule ensemble présélectionné de variants courants. Ils sont optimisés pour l'ascendance et les caractéristiques au niveau de la population, et non pour les résultats génétiques cliniques. Le test génomique Dante séquence 100 % de votre génome avec une couverture de 30X, soit la même norme que celle utilisée en diagnostic clinique. Ces deux tests ne sont pas comparables en termes de portée, de méthodologie ou d'utilité clinique.

Combien de temps faut-il pour obtenir des résultats, et comment sont-ils communiqués ?

Votre kit de prélèvement est expédié dans les 48 heures suivant votre commande. Une fois votre échantillon arrivé dans notre laboratoire certifié CLIA, le séquençage et l'analyse prennent entre 6 et 8 semaines. Les résultats sont transmis en toute sécurité vers votre Genome Manager, où vous pouvez consulter vos rapports, les partager avec votre médecin et recevoir des mises à jour automatiques à mesure que de nouvelles découvertes sont validées par rapport à votre génome.

ASSOCIATIONS DE DÉFENSE DES PATIENTS

Nous collaborons avec des associations de défense des patients partout dans le monde.

Dante Labs collabore avec des associations de patients de toutes tailles, qu'elles soient dédiées à l'amyotrophie spinale (SMA) ou à d'autres pathologies, rares ou courantes. Nous soutenons des associations dans tous les pays, y compris les associations de patients virtuelles.

Nous pouvons vous proposer des rapports personnalisés, des réductions de groupe et des formules sur mesure pour vos membres. N'hésitez pas à nous contacter via le formulaire ; nous vous répondrons dans les deux jours ouvrables.

  • Rapports génomiques personnalisés pour vos membres
  • Réductions pour les groupes et formules sur mesure
  • N'importe quel pays — y compris les groupes virtuels
  • Maladies rares et courantes prises en charge

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Un kit, livré à votre domicile. Le séquençage complet de votre génome selon les normes cliniques utilisées pour les décisions diagnostiques. Plus de 200 rapports prêts à être consultés par un médecin, transmis à votre « Genome Manager » en 6 à 8 semaines — disponibles en permanence et mis à jour au fur et à mesure des avancées scientifiques.

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Résultats en 6 à 8 semaines

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Kit de test génomique Dante Labs