Cancer gastrique diffus héréditaire — Une mutation de perte de fonction du gène CDH1 entraîne un risque de cancer gastrique pouvant atteindre 70 % au cours de la vie ; dans ce cas, le cancer se développe sous la muqueuse gastrique et reste invisible à l'endoscopie jusqu'à ce qu'il devienne inopérable.
Le séquençage du génome entier permet d'identifier toutes les variantes du gène CDH1 — y compris les délétions étendues et les mutations mosaïques — afin d'établir le diagnostic qui justifie la recommandation d'une gastrectomie totale prophylactique avant que le cancer, invisible à l'endoscopie, ne progresse.
Cancer gastrique diffus héréditaire
Le cancer gastrique diffus héréditaire (HDGC) est un syndrome de prédisposition au cancer à transmission autosomique dominante causé par des variants pathogènes du gène CDH1 (E-cadhérine) situé sur le chromosome 16q22.1. Le gène CDH1 code pour une protéine d'adhésion cellulaire essentielle à l'intégrité épithéliale ; sa perte de fonction entraîne un mode de croissance infiltrant et peu cohésif, caractéristique du cancer gastrique diffus (carcinome à cellules en anneau). Le HDGC a été défini pour la première fois en 1998 au sein d'une grande famille maorie de Nouvelle-Zélande, et reste l'un des syndromes de cancer héréditaire les plus mortels — le risque de cancer gastrique à vie chez les porteurs de variants pathogènes du gène CDH1 est estimé à 40-70 % chez les hommes et à 45-70 % chez les femmes. L'âge médian d'apparition dans les cas familiaux est de 38 ans, mais des cas ont été rapportés chez des patients âgés d'une vingtaine d'années.
Le défi clinique posé par le cancer gastrique à cellules en anneau (HDGC) réside dans le fait que ce cancer diffus se développe sous la forme de cellules en anneau isolées qui infiltrent la sous-muqueuse — un mode de croissance qui ne forme pas de masse visible et ne peut être détecté de manière fiable par endoscopie standard. La surveillance endoscopique, même avec des protocoles de biopsie systématiques, passe à côté de la majorité des lésions précoces de HDGC. Chaque gastrectomie totale réalisée à titre prophylactique chez les porteurs d'une variante pathogène du gène CDH1 révèle des foyers occultes de cellules en anneau au niveau de l'examen histopathologique — ce qui signifie que même les estomacs d'apparence « normale » abritent un cancer microscopique chez pratiquement tous les porteurs. Ce simple fait biologique justifie la recommandation d'une gastrectomie totale prophylactique pour les porteurs du gène CDH1 âgés de 18 à 40 ans, plutôt qu'une surveillance.
Les femmes porteuses du gène CDH1 sont également exposées à un risque considérablement accru de cancer du sein lobulaire — estimé entre 42 et 56 % au cours de leur vie. Le cancer du sein lobulaire, à l'instar du cancer gastrique diffus, se développe selon un schéma infiltrant en file indienne que la mammographie standard peut ne pas détecter, ce qui fait de l'IRM mammaire un élément essentiel de la surveillance. Le gène CDH1 figure dans la liste des résultats secondaires de l'ACMG SF v3.2, ce qui reflète le consensus selon lequel l'identification des porteurs du gène CDH1 avant l'apparition du cancer est à la fois cliniquement utile et vitale. Environ 40 % des familles répondant aux critères cliniques du HDGC sont CDH1-négatives ; certaines de ces familles présentent des variants du gène CTNNA1 (alpha-E-caténine) ou d'autres gènes, et une approche génomique complète est indiquée.
Les panels standard de dépistage du cancer héréditaire ne permettent pas de détecter les délétions importantes du gène CDH1 ni les variants mosaïques. Dans un syndrome où la chirurgie prophylactique dépend d'une confirmation moléculaire, un résultat génétique incomplet a des conséquences directes sur la prise en charge chirurgicale.
Les délétions importantes du gène CDH1 représentent 10 à 15 % des cas de cancer de l'estomac de type HDGC et ne sont pas détectées par les panels de séquençage d'exons
Environ 10 à 15 % des variants pathogènes du gène CDH1 chez les familles atteintes de cancer de l'ovaire héréditaire (HDGC) sont des délétions génomiques étendues couvrant un ou plusieurs exons. Les panels de séquençage d'exons qui n'incluent pas d'analyse des délétions/duplications par MLPA ni de détection des variants du nombre de copies ne permettront pas de détecter ces variants. De plus, le mosaïcisme somatique — où le variant CDH1 n'est présent que dans une fraction des cellules du patient — a été documenté dans certaines familles et peut échapper aux profondeurs de séquençage standard. Le séquençage du génome entier permet la détection simultanée des mutations ponctuelles et l'analyse des variants du nombre de copies sur l'ensemble du gène CDH1, permettant ainsi de mettre en évidence à la fois les variants intragéniques courants et les réarrangements structurels en un seul test.
Une gastrectomie prophylactique nécessite une confirmation moléculaire : un résultat négatif au test de dépistage ne correspond pas nécessairement à un résultat négatif réel
La gastrectomie totale est une intervention chirurgicale majeure qui a des répercussions importantes sur la qualité de vie à long terme. Elle est recommandée chez les porteurs du gène CDH1, car le cancer gastrique diffus à un stade précoce est invisible à l'endoscopie et la surveillance n'a pas permis d'éviter des décès dans les familles où la présence de porteurs est connue. Cette recommandation n'est appropriée que lorsqu'une confirmation moléculaire d'une variante pathogène du gène CDH1 a été établie. Un panel incomplet qui n'a pas évalué les délétions importantes ou effectué une analyse complète du gène CDH1 donne un faux sentiment de sécurité à une famille dans laquelle la variante pathogène peut encore exister, mais n'a tout simplement pas été détectée en raison de tests limités. Le séquençage du génome entier lève cette ambiguïté.
L'intégralité de votre ADN (et non pas seulement une partie)
Les tests génétiques traditionnels ne portent que sur des ensembles restreints de gènes, laissant de côté la majeure partie de votre génome. Nous séquençons l'intégralité de votre génome : chaque gène et chaque région entre les gènes.
Analyses approfondies et rapports spécialisés
Facile à lire et contenant des réponses sur lesquelles vous et votre médecin pouvez vous appuyer. Pas un dossier à décrypter — plus de 200 rapports cliniques, classés par catégorie.
Votre test gagne en valeur chaque année
Votre ADN ne change pas, mais les progrès de la génomique s'accélèrent. Chaque mois, de nouveaux liens entre des variants et des maladies sont mis en évidence. Nous validons ces résultats et mettons automatiquement à jour vos rapports. Votre test gagne en valeur chaque année.
Les résultats que les médecins obtiennent dans les cas les plus difficiles.
Quarante ans d'incertitude. Un seul test.
Un patient avait passé des décennies dans le système de santé britannique sans qu'aucun diagnostic ne lui soit posé. Les données de Dante, acceptées par les équipes cliniques du NHS à l'hôpital universitaire Queen Elizabeth de Glasgow, ont permis d'identifier le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante du gène RUNX1 associée à la leucémie, qui était restée inaperçue. Après 40 ans, ils ont enfin obtenu une réponse.
Une lecture attentive permet d'avoir une vision d'ensemble.
Un patient s'est présenté chez Dante pour faire examiner une paralysie périodique. L'analyse du génome complet a permis de mettre en évidence une affection cardiaque héréditaire concomitante — le syndrome de Brugada — que son médecin a confirmée par un ECG. Ce résultat a également permis d'expliquer les antécédents cardiaques inexpliqués d'un membre de sa famille. Un seul test. Toutes les réponses s'y trouvent.
Séquençage effectué en 2019. Les données ont été analysées en 2021.
Jennifer a fait séquencer son génome avec Dante deux ans avant que son cancer du sein ne soit diagnostiqué. Lorsque le traitement a commencé, les données pharmacogénomiques de Dante ont montré que la chimiothérapie qui lui avait été prescrite entraînerait de graves effets indésirables. Son médecin a choisi une alternative — et elle a pu bénéficier d'un traitement efficace dès le premier jour.
Toute question d'ordre génétique mérite une réponse exhaustive.
Que vous cherchiez des réponses aujourd’hui ou que vous souhaitiez préserver votre santé pour demain, le séquençage complet de votre génome est le seul point de départ possible.
C'est de famille. Vous pouvez désormais savoir si c'est dans vos gènes.
Votre génome contient des variants héréditaires associés à des pathologies telles que les maladies cardiaques, le cancer et les troubles neurologiques. Nous les analysons tous, en y apportant toute la rigueur clinique nécessaire pour donner tout son sens au résultat.
En savoir plus →Quand les analyses de laboratoire classiques indiquent que tout va bien. Et que vous savez que ce n'est pas le cas.
Les tests de dépistage classiques recherchent un ensemble prédéfini de réponses. Nous séquencons l'intégralité de votre ADN — y compris les parties qu'aucun test n'a été conçu pour analyser. Si la réponse se trouve dans votre génome, nous vous aiderons à la trouver.
En savoir plus →Votre diagnostic est peut-être correct. Votre plan de traitement est peut-être incomplet.
Vos gènes déterminent quels traitements ont le plus de chances d'être efficaces — et lesquels ne le sont pas. Nous fournissons à votre médecin les outils et les informations nécessaires pour établir votre plan de traitement.
En savoir plus →Tu veux le savoir avant que quelque chose ne t'oblige à te poser la question.
Certaines personnes n'attendent pas d'avoir reçu un diagnostic ou de connaître leurs antécédents familiaux pour agir. Le séquençage du génome complet vous offre dès aujourd'hui une vue d'ensemble complète de votre profil génétique, ce qui vous permet, à vous et à votre médecin, de prendre des décisions éclairées avant que la situation ne devienne urgente.
En savoir plus →Vous avez déjà fait un test ADN. Voici ce qu'il n'a pas pu vous révéler.
La plupart des tests ADN grand public analysent moins de 0,1 % de votre génome. Nous, nous l'analysons dans son intégralité.
En savoir plus →Des résultats de qualité clinique. Choisi par les particuliers, recommandé par les médecins pour leurs cas les plus complexes.
Le test Dante Genome a aidé les spécialistes d'un hôpital universitaire britannique spécialisé dans les soins aigus à diagnostiquer le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante génétique rare associée à une leucémie qui n'avait pas été détectée auparavant. Ce résultat a bouleversé la prise en charge médicale du patient.
Reconnu par et publié dans
Questions fréquentes sur le séquençage du génome entier.
Quelle est la différence entre le séquençage du génome entier et un test génétique ciblé ?
Les tests génétiques ciblés — y compris les panels standard de dépistage du cancer héréditaire — analysent une liste prédéfinie de variants connus au sein d'un ensemble spécifique de gènes. Ils sont conçus pour détecter ce qu'ils savent déjà rechercher. Le séquençage du génome entier analyse l'intégralité de votre génome : les 6 milliards de paires de bases, chaque gène, chaque région entre les gènes. Une étude de la Mayo Clinic publiée dans JAMA Oncology a révélé que les directives de dépistage standard ne détectaient pas plus de la moitié des patients présentant des mutations cancéreuses héréditaires. Le test génomique ne dispose pas d’une liste fixe.
Que vais-je recevoir lorsque mes résultats seront prêts ?
Votre Dante Genome vous fournit plus de 200 rapports prêts à être utilisés par les médecins, classés par catégorie clinique : cancers héréditaires, maladies cardiaques, maladies rares, pharmacogénomique, statut de porteur, etc. Les rapports sont transmis à votre Genome Manager sécurisé et sont présentés sous un format prêt à l'emploi en milieu clinique. Vos données génomiques sont conservées de manière permanente et réanalysées automatiquement à mesure que la science progresse.
Que se passe-t-il si une variante cliniquement significative est détectée ?
Si un variant pathogène ou potentiellement pathogène est identifié, il sera clairement signalé dans votre rapport destiné au médecin, accompagné du contexte clinique, des données scientifiques publiées et des mesures recommandées. Nous vous recommandons de faire part de tout résultat cliniquement significatif à votre médecin ou à un conseiller en génétique, qui pourra vous aider à prendre des décisions concernant la surveillance, la réduction des risques ou le dépistage en cascade des membres de votre famille.
En quoi cela diffère-t-il d'un test ADN grand public comme 23andMe ou AncestryDNA ?
Les tests ADN grand public utilisent des puces de génotypage qui analysent moins de 0,1 % de votre génome — un minuscule ensemble présélectionné de variants courants. Ils sont optimisés pour l'ascendance et les caractéristiques au niveau de la population, et non pour les résultats génétiques cliniques. Le test génomique Dante séquence 100 % de votre génome avec une couverture de 30X, soit la même norme que celle utilisée en diagnostic clinique. Ces deux tests ne sont pas comparables en termes de portée, de méthodologie ou d'utilité clinique.
Combien de temps faut-il pour obtenir des résultats, et comment sont-ils communiqués ?
Votre kit de prélèvement est expédié dans les 48 heures suivant votre commande. Une fois votre échantillon arrivé dans notre laboratoire certifié CLIA, le séquençage et l'analyse prennent entre 6 et 8 semaines. Les résultats sont transmis en toute sécurité vers votre Genome Manager, où vous pouvez consulter vos rapports, les partager avec votre médecin et recevoir des mises à jour automatiques à mesure que de nouvelles découvertes sont validées par rapport à votre génome.
Nous collaborons avec des associations de défense des patients partout dans le monde.
Dante Labs collabore avec des associations de patients de toutes tailles, qu'elles soient dédiées au cancer gastrique diffus héréditaire ou à d'autres pathologies, rares ou courantes. Nous soutenons des associations dans tous les pays, y compris les associations de patients virtuelles.
Nous pouvons vous proposer des rapports personnalisés, des réductions de groupe et des formules sur mesure pour vos membres. N'hésitez pas à nous contacter via le formulaire ; nous vous répondrons dans les deux jours ouvrables.
- Rapports génomiques personnalisés pour vos membres
- Réductions pour les groupes et formules sur mesure
- N'importe quel pays — y compris les groupes virtuels
- Maladies rares et courantes prises en charge
Message reçu.
Nous vous contacterons dans les deux jours ouvrables. Pour nous contacter directement : hello@dantelabs.com
Un test.
Une vie de réponses.
Un kit, livré à votre domicile. Le séquençage complet de votre génome selon les normes cliniques utilisées pour les décisions diagnostiques. Plus de 200 rapports prêts à être consultés par un médecin, transmis à votre « Genome Manager » en 6 à 8 semaines — disponibles en permanence et mis à jour au fur et à mesure des avancées scientifiques.
Expédié sous 48 heures · Résultats sous 6 à 8 semaines
