L'ataxie de Friedreich

L'ataxie de Friedreich — l'ataxie héréditaire la plus courante — bénéficie désormais du premier traitement approuvé par la FDA après des décennies de soins palliatifs ; la taille de l'expansion génétique détermine l'évolution de la maladie et la longueur de la répétition guide les décisions thérapeutiques.

Le séquençage du génome entier permet de déterminer avec précision la taille des expansions de répétitions GAA sur les deux allèles du gène FXN — détectant ainsi les cas d'hétérozygotie composée (expansion GAA + variant ponctuel) que les tests standard basés sur la PCR ne parviennent jamais à identifier, et fournissant la longueur de base de l'expansion qui sert de référence pour le pronostic.

Certifié CLIA Accrédité CAP Laboratoire médical ISO 15189 Offres d'emploi de l'ACMG HIPAA et RGPD Plus de 100 000génomes séquencés
À PROPOS DE L'ATAXIE DE FRIEDREICH

L'ataxie de Friedreich

L'ataxie de Friedreich (FRDA) est l'ataxie héréditaire la plus courante chez les personnes d'origine européenne ; elle touche environ 1 personne sur 50 000, avec une fréquence de porteurs d'environ 1 sur 100. Elle est causée par une perte de fonction autosomique récessive de la frataxine (codée par le gène FXN sur le chromosome 9q21.11), une protéine mitochondriale impliquée dans l'assemblage des clusters fer-soufre. Une déficience en frataxine entraîne une accumulation de fer dans les mitochondries, un stress oxydatif et une neurodégénérescence progressive. La FRDA se caractérise par une ataxie cérébelleuse et sensorielle progressive, une cardiomyopathie (présente dans plus de 90 % des cas et principale cause de décès), un diabète sucré (se développant chez environ 10 à 20 % des patients) et des déformations squelettiques (scoliose, pied creux).

La cause moléculaire de la FRDA est inhabituelle : environ 96 à 98 % des allèles pathogènes correspondent à des expansions de la répétition trinucléotidique GAA dans l'intron 1 du gène FXN. Les allèles normaux contiennent entre 5 et 33 répétitions GAA ; les allèles présentant une expansion complète en contiennent entre 66 et plus de 1 000, tandis que les allèles de prémutation, compris entre 34 et 65 répétitions, présentent un risque de déstabilisation mais ne provoquent pas la maladie à ce niveau. La longueur de l'expansion est étroitement liée au phénotype clinique : des expansions plus importantes dans l'allèle le plus court sont associées à un âge de début plus précoce et à une cardiomyopathie plus sévère. Environ 2 à 4 % des cas de FRDA sont hétérozygotes composés — un allèle présentant une expansion GAA et une mutation ponctuelle pathogène conventionnelle (missense, non-sens, site d'épissage) sur l'autre allèle. Ces cas hétérozygotes composés échappent complètement aux tests basés sur la PCR qui ne détectent que la longueur de l'expansion GAA.

Le premier traitement modificateur de la maladie pour la FRDA a été approuvé par la FDA en février 2023 : l'omaveloxolone (Skyclarys), un activateur de Nrf2 qui améliore la fonction mitochondriale et réduit le stress oxydatif. Cette autorisation marque une étape historique après des décennies durant lesquelles la prise en charge était purement symptomatique. Avec la mise à disposition d'un traitement approuvé, le diagnostic précoce et la caractérisation moléculaire précise — y compris la mesure de l'expansion et la détection de l'hétérozygotie composée — deviennent directement thérapeutiques pour déterminer l'éligibilité et surveiller la réponse au traitement.

2 à 4 % des cas de FRDA sont hétérozygotes composites : une expansion du gène GAA associée à une mutation ponctuelle sur l'autre allèle. Dans ces cas, les tests PCR standard pour le gène GAA indiquent que l'allèle le plus court est « normal », ce qui entraîne un résultat faussement négatif et empêche le diagnostic des patients.

POURQUOI LE SÉQUENÇAGE DU GÉNOME COMPLET ?

Le test standard de détection de l'expansion du gène GAA par PCR permet de détecter l'expansion homozygote — le cas le plus fréquent — mais ne permet pas de détecter la FRDA hétérozygote composée (expansion + mutation ponctuelle). Le séquençage du génome entier permet d'identifier ces deux mécanismes simultanément.

La FRDA hétérozygote composée n'est pas détectable par PCR standard, ce qui fait que 2 à 4 % des patients ne sont pas diagnostiqués

Le test de détection des répétitions GAA par PCR — test diagnostique de première intention standard pour la FRDA — mesure la taille des répétitions GAA sur les deux allèles. Chez les patients hétérozygotes composés (un allèle expansé + un allèle présentant une mutation ponctuelle), le test PCR standard détecte l'expansion sur un allèle mais indique un nombre de répétitions normal sur l'autre. Il en résulte un résultat qui semble indiquer une expansion GAA hétérozygote — souvent interprétée comme « porteur » plutôt que « atteint » — et conduit à un diagnostic erroné ou retardé. Le séquençage du gène FXN doit être effectué pour tous les résultats apparemment « d'expansion hétérozygote » afin d'exclure l'hétérozygotie composée. Le séquençage du génome entier permet à la fois de mesurer l'expansion des répétitions et d'effectuer le séquençage complet du gène FXN en une seule analyse.

Une évaluation précise de l'étendue de l'hypertrophie de l'anomalie GAA permet de déterminer le pronostic et d'orienter les décisions thérapeutiques concernant l'omaveloxolone

La longueur de la répétition GAA dans l'expansion la plus courte (allèle 1) est le facteur prédictif le plus important de l'âge d'apparition de la FRDA : chaque tranche supplémentaire de 100 répétitions GAA est associée à une apparition plus précoce d'environ un an. Les patients présentant des allèles plus courts, compris entre 66 et 400 répétitions, ont tendance à présenter une apparition plus tardive (à l'adolescence ou à l'âge adulte) avec une progression neurologique plus lente, mais peuvent néanmoins souffrir d'une cardiomyopathie importante. Les patients présentant des expansions de l'allèle 1 supérieures à 700 répétitions ont tendance à présenter une apparition plus précoce et une forme plus grave de la maladie. Ces informations sur la taille de l'expansion orientent le conseil pronostique, l'intensité de la surveillance cardiaque et — avec l'omaveloxolone désormais approuvée — éclairent la discussion sur le rapport bénéfice-risque lié au démarrage du traitement à différents stades de la maladie.

CE QUE SIGNIFIE RÉELLEMENT LE SÉQUENÇAGE DE VOTRE GÉNOME ENTIER
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Votre ADN ne change pas, mais les progrès de la génomique s'accélèrent. Chaque mois, de nouveaux liens entre des variants et des maladies sont mis en évidence. Nous validons ces résultats et mettons automatiquement à jour vos rapports. Votre test gagne en valeur chaque année.

RÉSULTATS

Les résultats que les médecins obtiennent dans les cas les plus difficiles.

Quarante ans d'incertitude. Un seul test.

Un patient avait passé des décennies dans le système de santé britannique sans qu'aucun diagnostic ne lui soit posé. Les données de Dante, acceptées par les équipes cliniques du NHS à l'hôpital universitaire Queen Elizabeth de Glasgow, ont permis d'identifier le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante du gène RUNX1 associée à la leucémie, qui était restée inaperçue. Après 40 ans, ils ont enfin obtenu une réponse.

Une lecture attentive permet d'avoir une vision d'ensemble.

Un patient s'est présenté chez Dante pour faire examiner une paralysie périodique. L'analyse du génome complet a permis de mettre en évidence une affection cardiaque héréditaire concomitante — le syndrome de Brugada — que son médecin a confirmée par un ECG. Ce résultat a également permis d'expliquer les antécédents cardiaques inexpliqués d'un membre de sa famille. Un seul test. Toutes les réponses s'y trouvent.

Séquençage effectué en 2019. Les données ont été analysées en 2021.

Jennifer a fait séquencer son génome avec Dante deux ans avant que son cancer du sein ne soit diagnostiqué. Lorsque le traitement a commencé, les données pharmacogénomiques de Dante ont montré que la chimiothérapie qui lui avait été prescrite entraînerait de graves effets indésirables. Son médecin a choisi une alternative — et elle a pu bénéficier d'un traitement efficace dès le premier jour.

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Que vous cherchiez des réponses aujourd’hui ou que vous souhaitiez préserver votre santé pour demain, le séquençage complet de votre génome est le seul point de départ possible.

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Plus de 5 millions variantes identifiées par test
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99,98 % précision de séquençage

Le test Dante Genome a aidé les spécialistes d'un hôpital universitaire britannique spécialisé dans les soins aigus à diagnostiquer le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante génétique rare associée à une leucémie qui n'avait pas été détectée auparavant. Ce résultat a bouleversé la prise en charge médicale du patient.

Reconnu par et publié dans

Amendements relatifs à l'amélioration des laboratoires cliniques Collège américain des pathologistes Société américaine de génétique humaine Nature Société internationale de thérapie cellulaire et génique Gene Journal
FOIRE AUX QUESTIONS

Questions fréquentes sur le séquençage du génome entier.

Quelle est la différence entre le séquençage du génome entier et un test génétique ciblé ?

Les tests génétiques ciblés — y compris les panels standard de dépistage du cancer héréditaire — analysent une liste prédéfinie de variants connus au sein d'un ensemble spécifique de gènes. Ils sont conçus pour détecter ce qu'ils savent déjà rechercher. Le séquençage du génome entier analyse l'intégralité de votre génome : les 6 milliards de paires de bases, chaque gène, chaque région entre les gènes. Une étude de la Mayo Clinic publiée dans JAMA Oncology a révélé que les directives de dépistage standard ne détectaient pas plus de la moitié des patients présentant des mutations cancéreuses héréditaires. Le test génomique ne dispose pas d’une liste fixe.

Que vais-je recevoir lorsque mes résultats seront prêts ?

Votre Dante Genome vous fournit plus de 200 rapports prêts à être utilisés par les médecins, classés par catégorie clinique : cancers héréditaires, maladies cardiaques, maladies rares, pharmacogénomique, statut de porteur, etc. Les rapports sont transmis à votre Genome Manager sécurisé et sont présentés sous un format prêt à l'emploi en milieu clinique. Vos données génomiques sont conservées de manière permanente et réanalysées automatiquement à mesure que la science progresse.

Que se passe-t-il si une variante cliniquement significative est détectée ?

Si un variant pathogène ou potentiellement pathogène est identifié, il sera clairement signalé dans votre rapport destiné au médecin, accompagné du contexte clinique, des données scientifiques publiées et des mesures recommandées. Nous vous recommandons de faire part de tout résultat cliniquement significatif à votre médecin ou à un conseiller en génétique, qui pourra vous aider à prendre des décisions concernant la surveillance, la réduction des risques ou le dépistage en cascade des membres de votre famille.

En quoi cela diffère-t-il d'un test ADN grand public comme 23andMe ou AncestryDNA ?

Les tests ADN grand public utilisent des puces de génotypage qui analysent moins de 0,1 % de votre génome — un minuscule ensemble présélectionné de variants courants. Ils sont optimisés pour l'ascendance et les caractéristiques au niveau de la population, et non pour les résultats génétiques cliniques. Le test génomique Dante séquence 100 % de votre génome avec une couverture de 30X, soit la même norme que celle utilisée en diagnostic clinique. Ces deux tests ne sont pas comparables en termes de portée, de méthodologie ou d'utilité clinique.

Combien de temps faut-il pour obtenir des résultats, et comment sont-ils communiqués ?

Votre kit de prélèvement est expédié dans les 48 heures suivant votre commande. Une fois votre échantillon arrivé dans notre laboratoire certifié CLIA, le séquençage et l'analyse prennent entre 6 et 8 semaines. Les résultats sont transmis en toute sécurité vers votre Genome Manager, où vous pouvez consulter vos rapports, les partager avec votre médecin et recevoir des mises à jour automatiques à mesure que de nouvelles découvertes sont validées par rapport à votre génome.

ASSOCIATIONS DE DÉFENSE DES PATIENTS

Nous collaborons avec des associations de défense des patients partout dans le monde.

Dante Labs collabore avec des associations de patients de toutes tailles, qu'elles soient dédiées à l'ataxie de Friedreich ou à d'autres pathologies, rares ou courantes. Nous soutenons des associations dans tous les pays, y compris les associations de patients virtuelles.

Nous pouvons vous proposer des rapports personnalisés, des réductions de groupe et des formules sur mesure pour vos membres. N'hésitez pas à nous contacter via le formulaire ; nous vous répondrons dans les deux jours ouvrables.

  • Rapports génomiques personnalisés pour vos membres
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Un kit, livré à votre domicile. Le séquençage complet de votre génome selon les normes cliniques utilisées pour les décisions diagnostiques. Plus de 200 rapports prêts à être consultés par un médecin, transmis à votre « Genome Manager » en 6 à 8 semaines — disponibles en permanence et mis à jour au fur et à mesure des avancées scientifiques.

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