Le mélanome familial — une perte de fonction du gène CDKN2A associée à un risque de mélanome de 60 à 90 % au cours de la vie et à un risque accru de cancer du pancréas — est souvent considéré comme une concentration de cas de cancer au sein d'une famille plutôt que comme un syndrome héréditaire.
Le séquençage du génome entier permet de séquencer l'intégralité du gène CDKN2A — qui code deux gènes suppresseurs de tumeurs distincts (p16/INK4a et p14/ARF) par le biais de cadres de lecture alternatifs — et d'identifier ainsi toutes les variantes, y compris les réarrangements que le séquençage standard ne détecte pas.
Mélanome familial — CDKN2A
Le syndrome familial de naevus multiples atypiques et de mélanome (FAMMM) est un syndrome de prédisposition au cancer héréditaire autosomique dominant, le plus souvent causé par des variants pathogènes germinaux du gène CDKN2A situé sur le chromosome 9p21.3. Le gène CDKN2A code pour deux protéines suppressives de tumeurs distinctes via des cadres de lecture alternatifs : p16/INK4a (codée par les exons 1α, 2 et 3), qui inhibe les kinases CDK4/6 et empêche la progression du cycle cellulaire, et p14/ARF (codée par les exons 1β, 2 et 3), qui stabilise la protéine p53. Les variants pathogènes du gène CDKN2A sont responsables d'environ 20 à 40 % des familles comptant au moins trois cas de mélanome et sont présents chez une proportion significative d'individus atteints de mélanomes primaires multiples. Les variants pathogènes de CDK4 provoquent un syndrome clinique presque identique dans une minorité de cas de mélanome familial.
Le risque de mélanome au cours de la vie chez les porteurs de variants pathogènes du gène CDKN2A varie entre environ 28 et 67 % dans les régions à faible incidence et entre 58 et 92 % dans les régions à forte exposition aux rayons UV (notamment en Australie). L'âge médian du premier diagnostic de mélanome chez les porteurs du gène CDKN2A est nettement plus jeune que dans la population générale, avec un taux élevé de mélanomes primaires multiples tout au long de la vie du porteur. Les porteurs du gène CDKN2A sont également exposés à un risque considérablement accru de cancer du pancréas — estimé à 11-17 % au cours de la vie —, en particulier en présence d'antécédents familiaux de cancer du pancréas. Les porteurs de variants spécifiques du gène p14/ARF (affectant uniquement l'exon 1β) peuvent présenter une prédisposition isolée au cancer du pancréas sans risque de mélanome.
Malgré le risque considérable de mélanome au cours de la vie, le mélanome familial est largement sous-diagnostiqué. Les cabinets de médecine générale et de dermatologie reçoivent fréquemment des patients dont plusieurs parents au premier degré ont eu un mélanome ; on leur parle alors de « malchance familiale » ou on leur donne simplement des conseils généraux de protection solaire, sans les orienter vers un dépistage génétique. Les recommandations du NCCN sur le mélanome préconisent une évaluation génétique pour les personnes présentant au moins trois mélanomes invasifs dans une même famille, plusieurs mélanomes primaires chez un même individu, ou une famille comptant au moins un mélanome et un cancer du pancréas. Les porteurs confirmés du gène CDKN2A doivent subir un examen cutané complet annuel, une dermatoscopie semestrielle et une surveillance pancréatique — un protocole structuré dont la mise en œuvre nécessite une confirmation moléculaire.
Le gène CDKN2A code pour deux protéines par le biais de cadres de lecture alternatifs. Les variants de l'exon 1β n'affectent que la protéine p14/ARF, entraînant une prédisposition au cancer du pancréas sans risque de mélanome. Les variants des exons 1α et 2-3 affectent la protéine p16/INK4a et entraînent généralement un risque à la fois de mélanome et de cancer du pancréas.
Les panels standard pour le mélanome utilisent des méthodes de séquençage limitées du gène CDKN2A qui ne permettent pas de détecter les réarrangements de grande ampleur ni les variants impliquant des cadres de lecture alternatifs. Le séquençage du génome entier permet de déterminer la structure complète du gène CDKN2A, y compris les cadres de lecture p16/INK4a et p14/ARF.
Deux protéines, deux cadres de lecture — le séquençage standard des exons pourrait ne pas permettre de les évaluer correctement toutes les deux
Le gène CDKN2A présente la particularité de coder deux protéines suppressives de tumeurs à partir d'un seul locus génomique, via des premiers exons alternatifs : l'exon 1α (pour p16/INK4a) et l'exon 1β (pour p14/ARF). Les panels standard de dépistage du cancer héréditaire séquencent généralement les exons codants du gène CDKN2A dans le cadre de lecture p16/INK4a. Les variants qui affectent spécifiquement le cadre de lecture p14/ARF — en particulier dans l'exon 1β — peuvent passer inaperçus si la conception du panel ne couvre pas explicitement ce premier exon alternatif. De tels variants confèrent une prédisposition au cancer du pancréas qui peut être négligée dans un panel axé sur le mélanome. Le séquençage du génome entier couvre l'intégralité du locus CDKN2A 9p21, y compris les deux premiers exons alternatifs et la région régulatrice complète.
Le risque de cancer du pancréas chez les familles présentant une mutation du gène CDKN2A nécessite une surveillance spécifique qui n'est pas prévue dans le cadre du suivi standard du mélanome
Les porteurs du gène CDKN2A identifiés au sein d'une famille présentant des antécédents de mélanome peuvent ne pas être informés de leur risque concomitant de cancer du pancréas (11 à 17 %) s'ils ne sont pas explicitement sensibilisés à ce double phénotype. Les recommandations actuelles pour les porteurs du gène CDKN2A ayant des antécédents familiaux compatibles avec un risque de cancer du pancréas préconisent une surveillance pancréatique annuelle à partir de 40-45 ans par échographie endoscopique ou IRM/CPMR — la même surveillance que celle recommandée pour les porteurs de gènes BRCA2 et ATM présentant un risque de cancer du pancréas. Ce protocole de surveillance pancréatique n'est mis en place que lorsque le diagnostic de CDKN2A est établi et que l'équipe clinique a connaissance du double risque de cancer. Le séquençage du génome entier permet d'identifier les variants pathogènes du gène CDKN2A dans le cadre d'une évaluation complète du risque de cancer.
L'intégralité de votre ADN (et non pas seulement une partie)
Les tests génétiques traditionnels ne portent que sur des ensembles restreints de gènes, laissant de côté la majeure partie de votre génome. Nous séquençons l'intégralité de votre génome : chaque gène et chaque région entre les gènes.
Analyses approfondies et rapports spécialisés
Facile à lire et contenant des réponses sur lesquelles vous et votre médecin pouvez vous appuyer. Pas un dossier à décrypter — plus de 200 rapports cliniques, classés par catégorie.
Votre test gagne en valeur chaque année
Votre ADN ne change pas, mais les progrès de la génomique s'accélèrent. Chaque mois, de nouveaux liens entre des variants et des maladies sont mis en évidence. Nous validons ces résultats et mettons automatiquement à jour vos rapports. Votre test gagne en valeur chaque année.
Les résultats que les médecins obtiennent dans les cas les plus difficiles.
Quarante ans d'incertitude. Un seul test.
Un patient avait passé des décennies dans le système de santé britannique sans qu'aucun diagnostic ne lui soit posé. Les données de Dante, acceptées par les équipes cliniques du NHS à l'hôpital universitaire Queen Elizabeth de Glasgow, ont permis d'identifier le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante du gène RUNX1 associée à la leucémie, qui était restée inaperçue. Après 40 ans, ils ont enfin obtenu une réponse.
Une lecture attentive permet d'avoir une vision d'ensemble.
Un patient s'est présenté chez Dante pour faire examiner une paralysie périodique. L'analyse du génome complet a permis de mettre en évidence une affection cardiaque héréditaire concomitante — le syndrome de Brugada — que son médecin a confirmée par un ECG. Ce résultat a également permis d'expliquer les antécédents cardiaques inexpliqués d'un membre de sa famille. Un seul test. Toutes les réponses s'y trouvent.
Séquençage effectué en 2019. Les données ont été analysées en 2021.
Jennifer a fait séquencer son génome avec Dante deux ans avant que son cancer du sein ne soit diagnostiqué. Lorsque le traitement a commencé, les données pharmacogénomiques de Dante ont montré que la chimiothérapie qui lui avait été prescrite entraînerait de graves effets indésirables. Son médecin a choisi une alternative — et elle a pu bénéficier d'un traitement efficace dès le premier jour.
Toute question d'ordre génétique mérite une réponse exhaustive.
Que vous cherchiez des réponses aujourd’hui ou que vous souhaitiez préserver votre santé pour demain, le séquençage complet de votre génome est le seul point de départ possible.
C'est de famille. Vous pouvez désormais savoir si c'est dans vos gènes.
Votre génome contient des variants héréditaires associés à des pathologies telles que les maladies cardiaques, le cancer et les troubles neurologiques. Nous les analysons tous, en y apportant toute la rigueur clinique nécessaire pour donner tout son sens au résultat.
En savoir plus →Quand les analyses de laboratoire classiques indiquent que tout va bien. Et que vous savez que ce n'est pas le cas.
Les tests de dépistage classiques recherchent un ensemble prédéfini de réponses. Nous séquencons l'intégralité de votre ADN — y compris les parties qu'aucun test n'a été conçu pour analyser. Si la réponse se trouve dans votre génome, nous vous aiderons à la trouver.
En savoir plus →Votre diagnostic est peut-être correct. Votre plan de traitement est peut-être incomplet.
Vos gènes déterminent quels traitements ont le plus de chances d'être efficaces — et lesquels ne le sont pas. Nous fournissons à votre médecin les outils et les informations nécessaires pour établir votre plan de traitement.
En savoir plus →Tu veux le savoir avant que quelque chose ne t'oblige à te poser la question.
Certaines personnes n'attendent pas d'avoir reçu un diagnostic ou de connaître leurs antécédents familiaux pour agir. Le séquençage du génome complet vous offre dès aujourd'hui une vue d'ensemble complète de votre profil génétique, ce qui vous permet, à vous et à votre médecin, de prendre des décisions éclairées avant que la situation ne devienne urgente.
En savoir plus →Vous avez déjà fait un test ADN. Voici ce qu'il n'a pas pu vous révéler.
La plupart des tests ADN grand public analysent moins de 0,1 % de votre génome. Nous, nous l'analysons dans son intégralité.
En savoir plus →Des résultats de qualité clinique. Choisi par les particuliers, recommandé par les médecins pour leurs cas les plus complexes.
Le test Dante Genome a aidé les spécialistes d'un hôpital universitaire britannique spécialisé dans les soins aigus à diagnostiquer le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante génétique rare associée à une leucémie qui n'avait pas été détectée auparavant. Ce résultat a bouleversé la prise en charge médicale du patient.
Reconnu par et publié dans
Questions fréquentes sur le séquençage du génome entier.
Quelle est la différence entre le séquençage du génome entier et un test génétique ciblé ?
Les tests génétiques ciblés — y compris les panels standard de dépistage du cancer héréditaire — analysent une liste prédéfinie de variants connus au sein d'un ensemble spécifique de gènes. Ils sont conçus pour détecter ce qu'ils savent déjà rechercher. Le séquençage du génome entier analyse l'intégralité de votre génome : les 6 milliards de paires de bases, chaque gène, chaque région entre les gènes. Une étude de la Mayo Clinic publiée dans JAMA Oncology a révélé que les directives de dépistage standard ne détectaient pas plus de la moitié des patients présentant des mutations cancéreuses héréditaires. Le test génomique ne dispose pas d’une liste fixe.
Que vais-je recevoir lorsque mes résultats seront prêts ?
Votre Dante Genome vous fournit plus de 200 rapports prêts à être utilisés par les médecins, classés par catégorie clinique : cancers héréditaires, maladies cardiaques, maladies rares, pharmacogénomique, statut de porteur, etc. Les rapports sont transmis à votre Genome Manager sécurisé et sont présentés sous un format prêt à l'emploi en milieu clinique. Vos données génomiques sont conservées de manière permanente et réanalysées automatiquement à mesure que la science progresse.
Que se passe-t-il si une variante cliniquement significative est détectée ?
Si un variant pathogène ou potentiellement pathogène est identifié, il sera clairement signalé dans votre rapport destiné au médecin, accompagné du contexte clinique, des données scientifiques publiées et des mesures recommandées. Nous vous recommandons de faire part de tout résultat cliniquement significatif à votre médecin ou à un conseiller en génétique, qui pourra vous aider à prendre des décisions concernant la surveillance, la réduction des risques ou le dépistage en cascade des membres de votre famille.
En quoi cela diffère-t-il d'un test ADN grand public comme 23andMe ou AncestryDNA ?
Les tests ADN grand public utilisent des puces de génotypage qui analysent moins de 0,1 % de votre génome — un minuscule ensemble présélectionné de variants courants. Ils sont optimisés pour l'ascendance et les caractéristiques au niveau de la population, et non pour les résultats génétiques cliniques. Le test génomique Dante séquence 100 % de votre génome avec une couverture de 30X, soit la même norme que celle utilisée en diagnostic clinique. Ces deux tests ne sont pas comparables en termes de portée, de méthodologie ou d'utilité clinique.
Combien de temps faut-il pour obtenir des résultats, et comment sont-ils communiqués ?
Votre kit de prélèvement est expédié dans les 48 heures suivant votre commande. Une fois votre échantillon arrivé dans notre laboratoire certifié CLIA, le séquençage et l'analyse prennent entre 6 et 8 semaines. Les résultats sont transmis en toute sécurité vers votre Genome Manager, où vous pouvez consulter vos rapports, les partager avec votre médecin et recevoir des mises à jour automatiques à mesure que de nouvelles découvertes sont validées par rapport à votre génome.
Nous collaborons avec des associations de défense des patients partout dans le monde.
Dante Labs collabore avec des associations de patients de toutes tailles, notamment celles qui s'occupent du mélanome familial (CDKN2A) et d'autres pathologies, qu'elles soient rares ou courantes. Nous soutenons des associations dans tous les pays, y compris les associations de patients virtuelles.
Nous pouvons vous proposer des rapports personnalisés, des réductions de groupe et des formules sur mesure pour vos membres. N'hésitez pas à nous contacter via le formulaire ; nous vous répondrons dans les deux jours ouvrables.
- Rapports génomiques personnalisés pour vos membres
- Réductions pour les groupes et formules sur mesure
- N'importe quel pays — y compris les groupes virtuels
- Maladies rares et courantes prises en charge
Message reçu.
Nous vous contacterons dans les deux jours ouvrables. Pour nous contacter directement : hello@dantelabs.com
Un test.
Une vie de réponses.
Un kit, livré à votre domicile. Le séquençage complet de votre génome selon les normes cliniques utilisées pour les décisions diagnostiques. Plus de 200 rapports prêts à être consultés par un médecin, transmis à votre « Genome Manager » en 6 à 8 semaines — disponibles en permanence et mis à jour au fur et à mesure des avancées scientifiques.
Expédié sous 48 heures · Résultats sous 6 à 8 semaines
