Hypersensibilité à l'abacavir — HLA-B*57:01, le variant qui fait de l'abacavir un traitement contre le VIH pour la plupart des patients, mais qui peut provoquer une réaction d'hypersensibilité potentiellement mortelle chez les 5 à 8 % d'Européens qui en sont porteurs.
Le séquençage du génome entier permet un typage complet des antigènes HLA de classe I — y compris l'allèle HLA-B*57:01, dont le dépistage est exigé par la FDA avant la prescription d'abacavir — ainsi que de tous les autres allèles HLA pertinents sur le plan pharmacogénomique.
Hypersensibilité à l'abacavir — HLA-B*57:01
L'abacavir (Ziagen) est un inhibiteur nucléosidique de la transcriptase inverse (INTI) utilisé comme élément central d'un traitement antirétroviral combiné contre l'infection par le VIH. Environ 5 à 8 % des patients à qui l'abacavir a été prescrit sans dépistage préalable du gène HLA-B*57:01 développent une réaction d'hypersensibilité (HSR) potentiellement mortelle, caractérisée par de la fièvre, des éruptions cutanées, des symptômes gastro-intestinaux et un malaise apparaissant dans les six premières semaines du traitement. Chez les patients qui développent une HSR et qui sont ensuite exposés à nouveau à l'abacavir par inadvertance — par exemple, si le diagnostic n'a pas été clairement documenté —, la réaction peut être grave et rapidement mortelle, avec une hypotension aiguë et une défaillance multiviscérale.
L'association entre le gène HLA-B*57:01 et l'hypersensibilité à l'abacavir est l'une des associations pharmacogénomiques les plus marquées en médecine. Les porteurs de HLA-B*57:01 qui reçoivent de l'abacavir présentent un risque d'environ 50 à 60 % de développer une réaction d'hypersensibilité (HSR), contre environ 0 à 1 % chez les non-porteurs. Le mécanisme implique la protéine HLA-B*57:01 qui présente l'abacavir ou ses métabolites dans la rainure de liaison peptidique aux lymphocytes T CD8+, déclenchant ainsi une réponse polyclonale des lymphocytes T cytotoxiques. Le gène HLA-B*57:01 est présent chez environ 5 à 8 % des personnes d'ascendance européenne, 1 à 3 % des personnes d'ascendance africaine et moins de 1 % des personnes d'ascendance asiatique, ce qui rend le dépistage particulièrement pertinent chez les populations séropositives d'ascendance européenne.
En 2008, la FDA a ajouté une mise en garde encadrée concernant l'abacavir, exigeant un dépistage du HLA-B*57:01 avant ou au moment de l'instauration d'un traitement par l'abacavir. Les recommandations de l'OMS sur le traitement du VIH préconisent également un dépistage du HLA-B*57:01 avant l'utilisation de l'abacavir. La mise en place d'un dépistage systématique avant le traitement a permis de réduire d'environ 50 % l'incidence des réactions d'hypersensibilité à l'abacavir confirmées par des tests immunologiques. Ce test fait partie des soins standard dans le traitement du VIH aux États-Unis, dans l'Union européenne et, de plus en plus, dans les pays à revenu faible ou intermédiaire. Le gène HLA-B*57:01 est également associé à des lésions hépatiques induites par la flucloxacilline et à un risque d'hypersensibilité à la carbamazépine, ce qui rend le typage HLA complet — tel qu'il est fourni par le séquençage du génome entier — très utile chez les patients suivant des schémas thérapeutiques complexes.
Il existe des tests commerciaux ciblant uniquement le HLA-B*57:01, qui constituent la norme de soins avant l'administration d'abacavir. Le séquençage du génome complet apporte en plus un typage HLA complet : il permet de détecter, en un seul test, le HLA-B*57:01 ainsi que le HLA-B*15:02, le HLA-B*58:01 et d'autres allèles HLA cliniquement pertinents.
Le typage HLA complet permet d'identifier, en un seul résultat, plusieurs allèles responsables d'hypersensibilité à des médicaments pouvant mettre la vie en danger
Le HLA-B*57:01 n'est que l'un des nombreux allèles HLA pour lesquels des associations avec une hypersensibilité médicamenteuse ont été documentées. HLA-B*15:02 (carbamazépine-SJS/TEN chez les populations d'Asie du Sud-Est), HLA-B*58:01 (allopurinol-SJS/TEN), HLA-B*57:01 (lésions hépatiques liées à la flucloxacilline) et HLA-A*31:01 (hypersensibilité à la carbamazépine chez les Européens) sont tous des allèles cliniquement exploitables présentant des distributions géographiques distinctes et des associations spécifiques à certains médicaments. Un patient recevant plusieurs médicaments peut présenter de multiples considérations pharmacogénomiques HLA pertinentes. Le séquençage du génome entier permet un typage complet et à haute résolution des HLA de classe I et II, fournissant ainsi le profil pharmacogénomique HLA complet en un seul test, plutôt que de commander des tests individuels pour chaque allèle pertinent pour chaque médicament concerné.
Le statut HLA-B*57:01 est un résultat définitif : le même génome qui permet de prédire le risque lié à l'abacavir sert également de base aux décisions de prescription tout au long de la vie
Contrairement à de nombreux résultats de laboratoire clinique qui nécessitent des réexamens périodiques, le génotype HLA est déterminé à la naissance et ne change jamais. Un résultat HLA-B*57:01 obtenu une seule fois — qu'il provienne d'un test ciblé ou d'un séquençage du génome entier — est valable à vie. La contre-indication à la prescription d'abacavir s'applique quel que soit le stade du traitement contre le VIH ou les comorbidités. Pour les patients séropositifs susceptibles de changer de schéma thérapeutique au fil des années, le fait d'avoir le génotype HLA consigné de manière permanente dans le dossier médical garantit que les schémas thérapeutiques contenant de l'abacavir seront évités à chaque étape future de la prise de décision thérapeutique, sans qu'il soit nécessaire de refaire des tests.
L'intégralité de votre ADN (et non pas seulement une partie)
Les tests génétiques traditionnels ne portent que sur des ensembles restreints de gènes, laissant de côté la majeure partie de votre génome. Nous séquençons l'intégralité de votre génome : chaque gène et chaque région entre les gènes.
Analyses approfondies et rapports spécialisés
Facile à lire et contenant des réponses sur lesquelles vous et votre médecin pouvez vous appuyer. Pas un dossier à décrypter — plus de 200 rapports cliniques, classés par catégorie.
Votre test gagne en valeur chaque année
Votre ADN ne change pas, mais les progrès de la génomique s'accélèrent. Chaque mois, de nouveaux liens entre des variants et des maladies sont mis en évidence. Nous validons ces résultats et mettons automatiquement à jour vos rapports. Votre test gagne en valeur chaque année.
Les résultats que les médecins obtiennent dans les cas les plus difficiles.
Quarante ans d'incertitude. Un seul test.
Un patient avait passé des décennies dans le système de santé britannique sans qu'aucun diagnostic ne lui soit posé. Les données de Dante, acceptées par les équipes cliniques du NHS à l'hôpital universitaire Queen Elizabeth de Glasgow, ont permis d'identifier le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante du gène RUNX1 associée à la leucémie, qui était restée inaperçue. Après 40 ans, ils ont enfin obtenu une réponse.
Une lecture attentive permet d'avoir une vision d'ensemble.
Un patient s'est présenté chez Dante pour faire examiner une paralysie périodique. L'analyse du génome complet a permis de mettre en évidence une affection cardiaque héréditaire concomitante — le syndrome de Brugada — que son médecin a confirmée par un ECG. Ce résultat a également permis d'expliquer les antécédents cardiaques inexpliqués d'un membre de sa famille. Un seul test. Toutes les réponses s'y trouvent.
Séquençage effectué en 2019. Les données ont été analysées en 2021.
Jennifer a fait séquencer son génome avec Dante deux ans avant que son cancer du sein ne soit diagnostiqué. Lorsque le traitement a commencé, les données pharmacogénomiques de Dante ont montré que la chimiothérapie qui lui avait été prescrite entraînerait de graves effets indésirables. Son médecin a choisi une alternative — et elle a pu bénéficier d'un traitement efficace dès le premier jour.
Toute question d'ordre génétique mérite une réponse exhaustive.
Que vous cherchiez des réponses aujourd’hui ou que vous souhaitiez préserver votre santé pour demain, le séquençage complet de votre génome est le seul point de départ possible.
C'est de famille. Vous pouvez désormais savoir si c'est dans vos gènes.
Votre génome contient des variants héréditaires associés à des pathologies telles que les maladies cardiaques, le cancer et les troubles neurologiques. Nous les analysons tous, en y apportant toute la rigueur clinique nécessaire pour donner tout son sens au résultat.
En savoir plus →Quand les analyses de laboratoire classiques indiquent que tout va bien. Et que vous savez que ce n'est pas le cas.
Les tests de dépistage classiques recherchent un ensemble prédéfini de réponses. Nous séquencons l'intégralité de votre ADN — y compris les parties qu'aucun test n'a été conçu pour analyser. Si la réponse se trouve dans votre génome, nous vous aiderons à la trouver.
En savoir plus →Votre diagnostic est peut-être correct. Votre plan de traitement est peut-être incomplet.
Vos gènes déterminent quels traitements ont le plus de chances d'être efficaces — et lesquels ne le sont pas. Nous fournissons à votre médecin les outils et les informations nécessaires pour établir votre plan de traitement.
En savoir plus →Tu veux le savoir avant que quelque chose ne t'oblige à te poser la question.
Certaines personnes n'attendent pas d'avoir reçu un diagnostic ou de connaître leurs antécédents familiaux pour agir. Le séquençage du génome complet vous offre dès aujourd'hui une vue d'ensemble complète de votre profil génétique, ce qui vous permet, à vous et à votre médecin, de prendre des décisions éclairées avant que la situation ne devienne urgente.
En savoir plus →Vous avez déjà fait un test ADN. Voici ce qu'il n'a pas pu vous révéler.
La plupart des tests ADN grand public analysent moins de 0,1 % de votre génome. Nous, nous l'analysons dans son intégralité.
En savoir plus →Des résultats de qualité clinique. Choisi par les particuliers, recommandé par les médecins pour leurs cas les plus complexes.
Le test Dante Genome a aidé les spécialistes d'un hôpital universitaire britannique spécialisé dans les soins aigus à diagnostiquer le syndrome de Noonan ainsi qu'une variante génétique rare associée à une leucémie qui n'avait pas été détectée auparavant. Ce résultat a bouleversé la prise en charge médicale du patient.
Reconnu par et publié dans
Questions fréquentes sur le séquençage du génome entier.
Quelle est la différence entre le séquençage du génome entier et un test génétique ciblé ?
Les tests génétiques ciblés — y compris les panels standard de dépistage du cancer héréditaire — analysent une liste prédéfinie de variants connus au sein d'un ensemble spécifique de gènes. Ils sont conçus pour détecter ce qu'ils savent déjà rechercher. Le séquençage du génome entier analyse l'intégralité de votre génome : les 6 milliards de paires de bases, chaque gène, chaque région entre les gènes. Une étude de la Mayo Clinic publiée dans JAMA Oncology a révélé que les directives de dépistage standard ne détectaient pas plus de la moitié des patients présentant des mutations cancéreuses héréditaires. Le test génomique ne dispose pas d’une liste fixe.
Que vais-je recevoir lorsque mes résultats seront prêts ?
Votre Dante Genome vous fournit plus de 200 rapports prêts à être utilisés par les médecins, classés par catégorie clinique : cancers héréditaires, maladies cardiaques, maladies rares, pharmacogénomique, statut de porteur, etc. Les rapports sont transmis à votre Genome Manager sécurisé et sont présentés sous un format prêt à l'emploi en milieu clinique. Vos données génomiques sont conservées de manière permanente et réanalysées automatiquement à mesure que la science progresse.
Que se passe-t-il si une variante cliniquement significative est détectée ?
Si un variant pathogène ou potentiellement pathogène est identifié, il sera clairement signalé dans votre rapport destiné au médecin, accompagné du contexte clinique, des données scientifiques publiées et des mesures recommandées. Nous vous recommandons de faire part de tout résultat cliniquement significatif à votre médecin ou à un conseiller en génétique, qui pourra vous aider à prendre des décisions concernant la surveillance, la réduction des risques ou le dépistage en cascade des membres de votre famille.
En quoi cela diffère-t-il d'un test ADN grand public comme 23andMe ou AncestryDNA ?
Les tests ADN grand public utilisent des puces de génotypage qui analysent moins de 0,1 % de votre génome — un minuscule ensemble présélectionné de variants courants. Ils sont optimisés pour l'ascendance et les caractéristiques au niveau de la population, et non pour les résultats génétiques cliniques. Le test génomique Dante séquence 100 % de votre génome avec une couverture de 30X, soit la même norme que celle utilisée en diagnostic clinique. Ces deux tests ne sont pas comparables en termes de portée, de méthodologie ou d'utilité clinique.
Combien de temps faut-il pour obtenir des résultats, et comment sont-ils communiqués ?
Votre kit de prélèvement est expédié dans les 48 heures suivant votre commande. Une fois votre échantillon arrivé dans notre laboratoire certifié CLIA, le séquençage et l'analyse prennent entre 6 et 8 semaines. Les résultats sont transmis en toute sécurité vers votre Genome Manager, où vous pouvez consulter vos rapports, les partager avec votre médecin et recevoir des mises à jour automatiques à mesure que de nouvelles découvertes sont validées par rapport à votre génome.
Nous collaborons avec des associations de défense des patients partout dans le monde.
Dante Labs collabore avec des associations de patients de toutes tailles — notamment pour l'hypersensibilité à l'abacavir — HLA-B*57:01 et d'autres pathologies, qu'elles soient rares ou courantes. Nous soutenons des associations dans tous les pays, y compris les associations de patients virtuelles.
Nous pouvons vous proposer des rapports personnalisés, des réductions de groupe et des formules sur mesure pour vos membres. N'hésitez pas à nous contacter via le formulaire ; nous vous répondrons dans les deux jours ouvrables.
- Rapports génomiques personnalisés pour vos membres
- Réductions pour les groupes et formules sur mesure
- N'importe quel pays — y compris les groupes virtuels
- Maladies rares et courantes prises en charge
Message reçu.
Nous vous contacterons dans les deux jours ouvrables. Pour nous contacter directement : hello@dantelabs.com
Un test.
Une vie de réponses.
Un kit, livré à votre domicile. Le séquençage complet de votre génome selon les normes cliniques utilisées pour les décisions diagnostiques. Plus de 200 rapports prêts à être consultés par un médecin, transmis à votre « Genome Manager » en 6 à 8 semaines — disponibles en permanence et mis à jour au fur et à mesure des avancées scientifiques.
Expédié sous 48 heures · Résultats sous 6 à 8 semaines
