Usherin oireyhtymä – yleisin geneettinen syy kuurouden ja sokeuden yhdistelmälle, jossa tietyn geenin tunnistaminen määrittää näön menetyksen etenemisnopeuden sekä kelpoisuuden geeniterapiakokeisiin, joilla jäljellä oleva näkö voitaisiin säilyttää.
Koko genomin sekvensointi analysoi samanaikaisesti kaikki yli 10 Usherin oireyhtymän geeniä – mukaan lukien USH2A-geenin, jonka osalta on tunnistettava syvällä intronissa sijaitsevia variaatioita, joita tavanomaisessa eksonisekvensointissa ei havaita – ja tarjoaa molekyylidiagnoosin, jonka perusteella määritetään potilaan soveltuvuus geeniterapiaan.
Usherin oireyhtymä
Usherin oireyhtymä on yleisin geneettinen syy kuulon ja näön menetyksen yhdistelmälle (kuurosokeus), ja sen osuus perinnöllisestä kuurosokeudesta on maailmanlaajuisesti noin 50 prosenttia. Se on autosomaalinen resessiivinen sairaus, joka luokitellaan kolmeen kliiniseen tyyppiin: tyyppi 1 (synnynnäinen vaikea sensorineuraalinen kuulonmenetys, puuttuva vestibulaarinen toiminta, prepuberttaalinen retinitis pigmentosa), tyyppi 2 (synnynnäinen kohtalainen tai vaikea kuulonmenetys, normaali vestibulaarinen toiminta, teini-iässä alkava RP) ja tyyppi 3 (progressiivinen kuulonmenetys, vaihteleva RP:n puhkeamisikä). Usherin oireyhtymä vaikuttaa noin 1:6 000–10 000 ihmiseen.
Geneettiseen taustaan liittyy vähintään 10 geeniä: USH1 johtuu MYO7A-geenin (USH1B, yleisin tyyppi 1), CDH23-geenin (USH1D), PCDH15-geenin (USH1F), USH1C-geenin tai USH1G-geenin muunnoksista. USH2 johtuu USH2A-geenin (yleisin yksittäinen Usher-geeni, joka vastaa noin 50 % kaikista Usherin oireyhtymän tapauksista), ADGRV1-geenin (USH2C) tai WHRN-geenin (USH2D) muunnoksista. USH3 johtuu CLRN1-geenin muunnoksista (yleisiä suomalaisessa ja aškenasijuutalaisessa väestössä). USH2A on yksi genomin suurimmista geeneistä (51 eksonia, jotka kattavat noin 800 kb genomin DNA:ta), ja patogeenisiin variantteihin kuuluu syviä intronivariaatioita, jotka luovat poikkeavia splays-kohtia – variantteja, joita tavalliset eksonien sekvensointipaneelit eivät havaitse.
Usherin oireyhtymän, erityisesti USH1B (MYO7A) ja USH2A -tyyppisen verkkokalvon rappeuman, osalta on meneillään aktiivisesti geeniterapian kliinisiä tutkimuksia. Subretinaalisen ja intravitreaalisen AAV-pohjaisen geeninsiirron tavoitteena on säilyttää jäljellä oleva fotoreseptoritoiminta potilailla, joilla on varhaisvaiheen pigmenttiretiniitti. Näihin tutkimuksiin osallistuminen edellyttää molekyylitason vahvistusta syynä olevasta geenistä ja sen variantista, ja yleensä riittävää jäljellä olevaa verkkokalvon toimintaa mitattavan terapeuttisen hyödyn saavuttamiseksi. Varhainen molekyylidiagnoosi – ennen kuin näön menetys muuttuu vakavaksi – maksimoi geeniterapian hoitovaihtoehtojen ajanjakson.
USH2A-geenin syvällä intronissa sijaitsevat variantit (kuten c.7595-2144A>G) aiheuttavat poikkeavia splays-kohtia, joita tavanomaisissa eksonien sekvensointipaneeleissa ei havaita. Nämä variantit muodostavat merkittävän osan kliinistä Usherin oireyhtymää tyyppi 2 sairastavien potilaiden ”puuttuvista” USH2A-alleeleista, kun potilaalla on tunnistettu vain yksi koodaava variantti.
USH2A-geenin syvällä intronissa sijaitsevat patogeeniset variantit eivät tule esiin eksonipaneelin sekvensoinnissa. Koko genomin sekvensointi kattaa koko 800 kb:n USH2A-lokuksen, jolloin havaitaan intronien splice-variantit, jotka auttavat selvittämään aiemmin ratkaisemattomia Usherin oireyhtymän tyypin 2 tapauksia.
Geeniterapiaan pääsemiseksi tarvitaan vahvistettu molekyylidiagnoosi – ja varhainen hoito säilyttää näkökyvyn paremmin
Usherin oireyhtymän aiheuttamaa verkkokalvon rappeutumista varten on meneillään useita geeniterapian kliinisiä tutkimuksia, joista osa kohdistuu erityisesti MYO7A- (USH1B), USH2A- ja muihin geeneihin. Osallistumisedellytyksenä on kyseisen syygeenin molekyylitason vahvistus, ja useimmissa tutkimuksissa vaaditaan riittävää jäljellä olevaa fotoreseptoritoimintaa mitattavan terapeuttisen vaikutuksen saavuttamiseksi. Koska Usherin oireyhtymän pigmenttiretiniitti on etenevää ja peruuttamatonta, jokainen molekyylidiagnoosin viivästymisvuosi merkitsee näön menetystä, mikä vähentää tulevan geeniterapian potentiaalisia hyötyjä. Koko genomin sekvensointi sensorineuraalista kuulonmenetystä sairastavilla lapsilla tunnistaa Usherin oireyhtymän genotyypit ennen näköoireiden ilmaantumista – mikä on optimaalinen ajankohta hoitoon puuttumiselle.
Jokaisella lapsella, jolla on selittämätön sensorineuraalinen kuulonalenema, tulisi selvittää, onko kyseessä Usherin oireyhtymä – ennen kuin verkkokalvon rappeutumisen oireet ilmenevät
Usherin oireyhtymän tyypin 2 retinitis pigmentosa alkaa tyypillisesti teini-iässä ilmenneenä hämäräsokeutena, jota seuraa näkökentän asteittainen kaventuminen seuraavien vuosikymmenien aikana. Kun RP on kliinisesti ilmeistä, merkittävää fotoreseptorien menetystä on jo tapahtunut. USH2A- tai muiden Usher-geenimuunnosten tunnistaminen lapsella, jolla on diagnosoitu sensorineuraalinen kuulonmenetys – vuosia ennen näköoireiden ilmaantumista – mahdollistaa ennakoivan silmätautien seurannan, varhaisen osallistumisen ennaltaehkäisyyn tähtääviin tutkimuksiin sekä psykologisen valmistautumisen etenevään näön menetykseen. Tämä varhainen tunnistaminen on mahdollista vain molekyylitestauksen avulla kuulonmenetysdiagnoosin yhteydessä.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – Usherin oireyhtymän sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
