Tyypin 1 diabeteksen geneettinen riski — HLA-haplotyypit, jotka selittävät puolet kaikesta tyypin 1 diabeteksen geneettisestä alttiudesta, mahdollistavat niiden lasten tunnistamisen, joiden riski on 10–20-kertainen ja jotka voivat nyt osallistua ennaltaehkäisyä koskeviin tutkimuksiin ennen kuin autoimmuunireaktio tuhoaa beetasolujen toiminnan.
Koko genomin sekvensointi tarjoaa kattavan HLA-DR/DQ-tyypityksen – jotka ovat tyypin 1 diabeteksen riskin tärkeimmät geneettiset tekijät – sekä polygeenisen riskipisteytyksen variantit, mikä mahdollistaa riskiryhmään kuuluvien lasten luokittelun ennaltaehkäisyohjelmia ja seulontaa varten teplitsumabin aikakaudella.
Tyypin 1 diabetes — Geneettinen riski
Tyypin 1 diabetes (T1D) on autoimmuunisairaus, jossa T-solujen välittämä haiman beetasolujen tuhoutuminen johtaa absoluuttiseen insuliinipuutokseen. T1D:llä on vahva mutta monimutkainen geneettinen rakenne — periytyvyys on noin 80 %, mutta penetraatio on epätäydellinen, mikä heijastaa merkittäviä ei-geneettisiä (ympäristöön liittyviä ja tarttuvia) taudin modifioijia. HLA-luokan II geenit muodostavat noin 40–50 % T1D:n kokonaisgeneettisestä riskistä. Korkeimman riskin HLA-haplotyyppiyhdistelmät – erityisesti DR3-DQ2 (HLA-DRB1*03:01-DQA1*05:01-DQB1*02:01) ja DR4-DQ8 (HLA-DRB1*04-DQA1*03:01-DQB1*03:02) — lisäävät dramaattisesti T1D:n elinikäistä riskiä, kun ne periytyvät yhdessä.
Lapsilla, jotka ovat DR3/DR4-yhdistelmäheterotsygootteja (yksi DR3-DQ2-haplotyyppi ja yksi DR4-DQ8-haplotyyppi), on noin 5–10 prosentin elinikäinen riski sairastua tyypin 1 diabetekseen – verrattuna noin 0,4 prosenttiin väestössä yleensä. DR3/DR4-genotyypin omaavien T1D-potilaiden ensimmäisen asteen sukulaisilla on vieläkin suurempi absoluuttinen riski, joka lähestyy 15–25 %:a elinaikana. HLA-suojaavat haplotyypit – erityisesti HLA-DRB1*15:02 (DR15) yhdessä DQ6:n kanssa – vähentävät merkittävästi T1D-riskiä, vaikka ne esiintyisivätkin riskialleelien rinnalla. Muut kuin HLA-lokukset (INS, PTPN22, CTLA4, IL2RA/CD25) vaikuttavat yksittäin vain vähän, mutta yhdessä ne muodostavat merkittävän polygeenisen riskin.
Teplizumabin (Tzield) saama FDA:n hyväksyntä vuonna 2022 – kyseessä on anti-CD3-monoklonaalinen vasta-aine, joka TrialNet-tutkimuksessa viivästytti tyypin 1 diabeteksen puhkeamista keskimäärin yli kahdella vuodella korkean riskin henkilöillä, joilla oli useita autoantigeenejä – on mullistanut tyypin 1 diabeteksen geneettisen riskiluokituksen kliinisen hyödyn. Korkean riskin HLA-henkilöitä voidaan nyt seurata saarekeautovasta-aineiden seulonnalla (vaihe 1: oireeton T1D:n tunnistaminen), ja ne, joilla on vähintään kaksi autovasta-ainetta, ovat oikeutettuja teplizumabiin – ensimmäiseen taudin kulkua muokkaavaan hoitoon, joka viivästyttää tai mahdollisesti estää kliinisen T1D:n. Tämä tekee geneettisestä riskiluokittelusta T1D-potilaiden lapsilla ja sisaruksilla suoraan hyödynnettävää tavalla, joka ei ollut mahdollista ennen vuotta 2022.
Monogeeninen diabetes (MODY) – jonka aiheuttavat yksittäisten geenien muunnokset GCK-, HNF1A-, HNF4A- ja muissa beetasolujen transkriptiotekijägeeneissä – voi muistuttaa varhain puhkeavaa tyypin 1 diabetesta, mutta sen hoito vaatii täysin erilaista lähestymistapaa. Tyypin 1 diabeteksen erottaminen MODY:stä edellyttää kattavaa molekyylitutkimusta.
Tyypin 1 diabeteksen riskin luokittelua varten tarvitaan tarkka, nelinumeroinen luokan II alleelien määrittäminen. Koko genomin sekvensointi mahdollistaa täydellisen HLA-DR/DQ-haplotyyppien määrittämisen sekä polygeenisten riskipisteytysvarianttien ja MODY-geenien arvioinnin yhdellä ainoalla testillä.
Korkean riskin HLA-tyypin tunnistaminen mahdollistaa teplitsumabihoidon aloittamisen ennaltaehkäisevästi – sekä autoantigeenien seurannan jo ennen oireiden ilmaantumista
Teplizumabin käyttökelpoisuus edellyttää vaiheen 2 oireetonta tyypin 1 diabeteksen diagnoosia – vähintään kahden saarekeautovasta-aineen esiintymistä ja poikkeavaa glukoosinsietokykyä. Vaiheen 2 tyypin 1 diabeteksen tunnistaminen edellyttää järjestelmällistä autovasta-aineiden seurantaa, joka kohdistetaan henkilöihin, joilla tiedetään olevan kohonnut geneettinen riski. Ilman HLA-riskiluokitusta tämä seuranta tapahtuu vain T1D-potilaiden ensimmäisen asteen sukulaisilla (jotka käyvät läpi TrialNet-seulonnan) — paljon suurempaa geneettisesti riskialtista väestöryhmää, jolla ei ole T1D-suvussa, ei tunnisteta systemaattisesti. Koko genomin sekvensointiin perustuva HLA-tyypitys voi tunnistaa nämä korkean riskin henkilöt ja käynnistää autovasta-aineiden seulonnan sekä TrialNet-rekisteröinnin.
Koko genomin sekvensointi mahdollistaa MODY-geenien samanaikaisen analysoinnin – mikä auttaa erottamaan tyypin 1 diabeteksen hoidettavissa olevasta monogeenisestä diabeteksesta
Nuoruusiän MODY-diabetes (Maturity-onset diabetes of the young) – jonka aiheuttavat yksittäiset heterotsygoottiset variantit GCK-, HNF1A-, HNF4A-, HNF1B- ja muissa geeneissä – diagnosoidaan usein virheellisesti tyypin 1 tai tyypin 2 diabetekseksi. MODY-diabeteksen osuus kaikista diabetesdiagnooseista on noin 1–2 %, mutta se voi edustaa jopa 5–10 % nuoruusiän diabetestapauksista. Kliininen ero on ratkaiseva: GCK-MODY ei yleensä vaadi hoitoa; HNF1A- ja HNF4A-MODY ovat erittäin herkkiä sulfonyyliureoille eivätkä välttämättä vaadi insuliinia. Koko genomin sekvensointi arvioi HLA-haplotyyppejä tyypin 1 diabeteksen riskin suhteen sekä MODY-geenipaneelin täydellisen sekvensoinnin — yhdistelmä, joka ratkaisee diagnostisen epäselvyyden epätyypillisissä nuorena puhkeavissa diabetestapauksissa.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – tyypin 1 diabeteksen, geneettisen riskin sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
