Tuberoottinen skleroosi – TSC1- tai TSC2-geenin muunnoksista johtuvat kohtaukset, ihomuutokset ja elinvauriot. Sen selvittäminen, kumpi geeni on kyseessä, vaikuttaa hoitosuunnitelmaan ja pitkäaikaiseen seurantaohjelmaan.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa TSC1- ja TSC2-geenimuunnokset, mikä mahdollistaa mTOR-estäjähoidon aloittamisen varhaisessa vaiheessa sekä geneettiseen profiiliisi räätälöidyn elinkohtaisen seurannan.
Tuberoottinen skleroosi
Tuberous sclerosis complex (TSC) on autosomaalinen dominantti sairaus, jota esiintyy noin yhdellä 6 000:sta tai yhdellä 10 000:sta henkilöstä ja jonka aiheuttavat TSC1- tai TSC2-geenien mutaatiot. Nämä geenit koodaavat proteiineja, jotka säätelevät mTOR-signalointireittiä (mammalian target of rapamycin) – solujen kasvun pääsäätelijää. TSC1- tai TSC2-geenin toimintahäiriöitä aiheuttavat variantit aiheuttavat mTOR:n yliaktivaatiota, mikä johtaa liialliseen solujen kasvuun ja hyvänlaatuisten kasvainten muodostumiseen koko kehossa. TSC ilmenee aivojen aivokuoren tuberina, subependymaalina jättisoluastrocytomina (SEGA), munuaisten angiomyolipomina, ihomanifestaatioina (hypomelanoottiset makulat, angiofibroomat) ja keuhkojen lymfangioleiomyomatoosina.
Neurologiset oireet muodostavat suurimman osan TSC-taudin oireista: noin 80–90 %:lla potilaista kehittyy epilepsia, jonka kohtaukset alkavat usein jo vauvaiässä. Kehityksen viivästyminen ja kehitysvammaisuus esiintyvät vaihtelevasti. Autismikirjon häiriöt ovat yleisiä. Noin 33 % TSC-tapauksista johtuu de novo -mutaatioista. Ratkaisevaa on, että TSC2-mutaatioista johtuu noin 70 % tapauksista, ja ne liittyvät huomattavasti vakavampaan taudin fenotyyppiin – aikaisempaan kohtausten puhkeamiseen, suurempaan kehitysvammaisuuden esiintyvyyteen ja suurempaan kasvaintaakkaan. TSC1-mutaatioista (~30 % tapauksista) johtuu tyypillisesti lievempiä fenotyyppejä, joissa kohtaukset puhkeavat myöhemmin ja kognitiiviset tulokset ovat paremmat. Yli 1 000 erilaista TSC1/TSC2-varianttia on tunnistettu.
Genotyypin ja fenotyypin välinen korrelaatio ohjaa seurannan intensiteettiä ja ennusteen arviointia. TSC2-positiivisissa perheissä on varauduttava aggressiivisempaan taudin kulkuun, joka edellyttää aivojen ja munuaisten tiivistä seurantaa. Vahvistettu TSC1- tai TSC2-diagnoosi edellyttää kattavia seurantaprotokollia: aivojen magneettikuvaus 1–3 vuoden välein SEGA-kasvaimien kehittymisen seurantaa varten (SEGA-kasvaimet aiheuttavat vesipäisyyttä ja vaativat hoitoa); munuaisten kuvantaminen 1–3 vuoden välein angiomyolipomien ja kystisen sairauden arviointia varten; sekä sydämen ultraäänitutkimus imeväisiässä. Everolimus (Votubia), FDA:n hyväksymä mTOR-estäjä, kohdistuu suoraan TSC:n menetyksen molekyylitason seurauksiin – SEGA-kasvainten ja angiomyolipomien kutistumiseen sekä pitkäaikaisten tulosten parantumiseen. Tämä on yksi menestyneimmistä geneettisestä tutkimuksesta lääkekehitykseen johtaneista esimerkeistä harvinaissairauksien alalla.
TSC2-mutaatioista seuraa vakavampi sairaus, jossa kohtaukset alkavat aikaisemmin ja kasvainten määrä on suurempi; TSC1-mutaatioista seuraa tyypillisesti lievempiä oireita ja paremmat pitkän aikavälin ennusteet.
TSC1/TSC2-paneelit ovat suhteellisen kattavia, mutta niissä jää havaitsematta suuret deleetiot ja säätelygeenimuutokset. De novo -muutosten havaitseminen voi olla haastavaa ilman vertailua vanhempien geeneihin.
TSC1/TSC2-geenien rakenteelliset variaatiot voivat jäädä huomaamatta tavanomaisissa paneelitesteissä
Vaikka TSC1 ja TSC2 ovat ainoat tuberous skleroosiin liittyvät geenit, tavanomaiset kohdennetut sekvensointipaneelit kattavat suurimman osan koodaavista sekvensseistä, mutta jättävät usein huomiotta suuret deleetiot, intronimuutokset ja säätelyalueiden muutokset. De novo -muutosten havaitseminen voi olla haastavaa satunnaisissa tapauksissa, jos vanhempien näytteitä ei ole saatavilla vertailua varten. Noin kolmasosa TSC-tapauksista on de novo -tapauksia, ja kattava molekyylidiagnoosi näissä tapauksissa voi olla vaikeaa paneelipohjaisilla menetelmillä. Koko genomin sekvensointi tarjoaa täydellisen TSC1/TSC2-peiton ja mahdollistaa suurten rakenteellisten varianttien ja intronimuutosten havaitsemisen, jotka kohdennetut menetelmät jättävät huomiotta.
Genotyyppi ennustaa taudin vakavuutta ja ohjaa seurannan intensiteettiä
TSC2-geenin patogeeninen variantti ennustaa huomattavasti aggressiivisempaa taudin kulkua – aikaisempaa kohtausten puhkeamista, suurempaa kehitysvammaisuuden esiintyvyyttä, suurempaa kasvainkuormitusta sekä aikaisempaa SEGA-muutoksen kehittymistä, joka edellyttää mTOR-estäjän käyttöä. TSC1-variantti ennustaa tyypillisesti lievempää tautia, jossa kohtaukset alkavat myöhemmin ja kognitiiviset tulokset ovat paremmat. Tämä genotyypin ja fenotyypin välinen korrelaatio vaikuttaa suoraan seurantaprotokolliin: TSC2-perheet tarvitsevat intensiivisempää aivojen kuvantamisseurantaa ja matalampia kynnysarvoja mTOR-estäjän käytön aloittamiselle. Everolimuusihoito voidaan aloittaa aikaisemmin TSC2-potilailla SEGA:n etenemisen estämiseksi. Cascade-perheiden seulonta tunnistaa ensimmäisen asteen sukulaiset.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – tuberoottisen skleroosin ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, parissa. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
