Talassemia – maailman yleisin yksigeeninen sairaus, jossa täydellinen globiinigeenityyppi määrää, onko henkilö oireeton kantaja, kärsiikö hän hoidettavissa olevasta kroonisesta sairaudesta vai onko hän verensiirroista riippuvainen.
Koko genomin sekvensointi kartoittaa alfa-globiini- (HBA1/HBA2) ja beeta-globiini- (HBB) geeniklusterit kokonaisuudessaan ja tunnistaa kaikki deleetiot, pistemutaatiot ja yhdistelmäheterotsygoottiset yhdistelmät – eli koko rakenteen, jota tavanomaisissa kantajaseuloissa ei pystytä määrittämään.
Talassemia
Talassemiaoireyhtymät ovat autosomaalisesti resessiivisiä hemoglobinopatioita, jotka johtuvat alfa- tai beeta-globiiniketjujen tuotannon vähenemisestä tai puuttumisesta. Tämä aiheuttaa globiiniketjujen synteesin epätasapainon, tehottoman punasolujen muodostumisen ja kroonisen hemolyyttisen anemian. Yhteensä talassemiat ovat maailmanlaajuisesti yleisimpiä yksigeenisiä sairauksia – arviolta 270 miljoonaa ihmistä kantaa talassemian varianttia, ja vuosittain syntyy noin 60 000 vakavasti sairastunutta lasta. Talassemian kantajuus on suurinta malarian endeemisillä alueilla: Välimerellä, Saharan eteläpuolisessa Afrikassa, Lähi-idässä, Etelä- ja Kaakkois-Aasiassa sekä Etelä-Kiinassa.
Alfa-talassemia johtuu kromosomin 16p13.3:lla sijaitseviin HBA1- ja HBA2-geeneihin kohdistuvista deleetioista tai mutaatioista. Koska alfa-globiinigeenejä on neljä kopiota (kaksi HBA1- ja kaksi HBA2-geeniä kummassakin kromosomissa 16), alfa-talassemian vakavuus noudattaa annoksesta riippuvaa asteikkoa: yksi geeni puuttuu (alfa-talassemian hiljainen kantaja), kaksi geeniä puuttuu (alfa-talassemian piirre), kolme geeniä puuttuu (HbH-tauti, kohtalainen anemia), neljä geeniä puuttuu (Hb Bartin hydrops fetalis, joka ilman hoitoa johtaa poikkeuksetta sikiön kuolemaan kohdussa). Beeta-talassemia johtuu pistemutaatioista tai pienistä lisäyksistä/poistoista HBB-geenissä. Beeta-talassemia major (Cooleyn anemia, beeta⁰/beeta⁰) vaatii elinikäisiä verensiirtoja; beeta-talassemia intermedia on vakavuudeltaan vaihteleva; beeta-talassemia-piirre on oireeton.
Talassemian geneettinen rakenne on yksi monimutkaisimmista mendeliläisistä sairauksista. On tunnistettu yli 300 beeta-globiinimuunnosta ja kymmeniä alfa-globiinin deleetiotyyppejä. Yhdistetty heterotsygoottisuus – eli eri talassemiamuunnoksien periminen kummaltakin vanhemmalta – tuottaa fenotyyppejä, joita ei voida ennustaa kummankaan muunnoksen perusteella yksinään. Alfa- ja beeta-talassemian samanaikainen periytyminen muuttaa taudin vakavuutta: samanaikainen alfa-talassemia vähentää globiiniketjujen epätasapainoa beeta-talassemiassa, mikä paradoksaalisesti lievittää tilaa. Geeniterapia (betibeglogene autotemcel, hyväksytty 2022) ja geenimuokkaus (exagamglogene autotemcel/exa-cel, hyväksytty 2023) tarjoavat parantavan hoidon mahdollisuuden verensiirroista riippuvaisille potilaille, jolloin lopullinen genotyyppaus mahdollistaa suoraan hoidon aloittamisen.
Alfa- ja beeta-talassemiaan liittyy erilaisia geenejä ja perintömuotoja. Monimutkaiset heterotsygoottiset yhdistelmät aiheuttavat erilaisia kliinisiä ilmenemismuotoja, joita ei voida ennustaa pelkästään yksittäisten varianttien testaamisen perusteella.
Tavalliset kantajaseulontatestit yleisten alueellisten talassemian muunnoksien varalta. Testillä ei voida määrittää täydellistä alfa-globiinin deleetion genotyyppiä, yhdistelmäheterotsygoottisia tiloja tai modifioivia lokuksia, jotka vaikuttavat taudin kliiniseen vakavuuteen ja lisääntymisriskiin.
Alfa-globiinigeenin kopioiden lukumäärän määrittäminen edellyttää genomitason tarkkuutta – SNP-paneeleilla sitä ei voida selvittää
Alfa-talassemia johtuu pääasiassa suurista deleetioista, joissa yksi tai molemmat alfa-globiinigeenit puuttuvat kromosomista. Jäljelle jääneiden toiminnallisten alfa-globiinigeenikopioiden lukumäärän määrittäminen – joka on kliinisen vakavuuden tärkein määrittäjä – edellyttää deleetion kartoitusta ja katkaisupisteiden karakterisointia. SNP-pohjaiset kantajaseulontapaneelit eivät tunnista geenideleetioita. Jopa kohdennetut deleetiotestit (MLPA, Gap-PCR) arvioivat vain yleisimpiä alueellisia deleetiotyyppejä, ja harvinaiset tai epätyypilliset deleetiot voivat jäädä havaitsematta. Koko genomin sekvensointi kartoittaa kaikki alfa-globiinideleetiot, määrittää tarkan geenikopioiden lukumäärän ja karakterisoi katkaisupisteet – tiedot, joita tarvitaan alfa-talassemian piirteiden erottamiseen (”cis”- ja ”trans”-deleetiokonfiguraatiot) ja sikiön hydropsin riskin ennustamiseen.
Geeniterapiaan pääsemiseksi tarvitaan lopullinen genotyyppi – ei seulontatulosta
Betibeglogene autotemcelin (Zynteglo, 2022) ja exa-celin (Casgevy, 2023) hyväksyminen verensiirrosta riippuvaan beeta-talassemiaan on tehnyt lopullisesta HBB-genotyypin määrittämisestä suoraan hoidon edellytyksen. Geeniterapian kelpoisuuskriteerit määrittelevät beeta-talassemian genotyypin ja joissakin protokollissa sulkevat pois tietyt varianttityypit. Potilailla, joita arvioidaan parantavaa geeniterapiaa tai geenimuokkausta varten, täydellinen globiinigenotyyppi – mukaan lukien mahdollisen hoitovasteeseen vaikuttavan perinnöllisen alfa-talassemian tunnistaminen – on määritettävä varmuudella. Koko genomin sekvensointi tarjoaa tämän lopullisen genotyypin yhdellä kattavalla testillä.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – talassemian ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
