Spinoserebellaarinen ataksia — yli 40 geneettistä alatyyppiä etenevää pikkuaivojen rappeutumista, jossa antisense-oligonukleotidien kliiniset tutkimukset etenevät nopeasti ja molekyylitason alatyypin tunnistaminen ratkaisee potilaan kelpoisuuden geenikohtaisiin hoitoihin.
Koko genomin sekvensointi kattaa yli 40 SCA-geenin – mukaan lukien CAG-toistojaksojen pitenemiset (SCA1/2/3/6/7/17), ei-koodaavien toistojaksojen pitenemiset (SCA8/10/36) ja perinteiset mutaatiot (SCA5/11/13/14) – yhdellä kattavalla analyysillä.
Spinoserebellaarinen ataksia
Spinoserebellaariset ataksioista (SCA) muodostuu ryhmä, johon kuuluu yli 40 autosomaalisesti dominanttia, etenevää pikkuaivojen rappeutumissairautta. Ne on numeroitu SCA1:stä SCA48+:aan sitä mukaa, kun uusia geenejä tunnistetaan. Maailmanlaajuisesti yleisimmät SCA-muodot ovat SCA3/Machado-Josephin tauti (ATXN3-CAG-laajennus, ~21 % maailmanlaajuisesti), SCA2 (ATXN2-CAG-laajennus, ~15 %), SCA6 (CACNA1A-CAG-laajennus, ~15 %), SCA1 (ATXN1-CAG-laajennus, ~6 %) ja SCA7 (ATXN7-CAG-laajennus, ~5 %). SCA-tautien yhteenlaskettu esiintyvyys on noin 1–5 tapausta 100 000:ta kohti, ja se vaihtelee väestön ja maantieteellisen sijainnin mukaan.
SCA-taudit ilmenevät etenevänä pikkuaivoataksiana (kävelyn epävakaus, dysartria, silmänliikkeiden häiriöt), ja niihin liittyy vaihtelevia muita oireita riippuen taudin alatyypistä: SCA1:een ja SCA2:een liittyy pyramidaalisia oireita ja ääreishermoston vaurioita; SCA3:een liittyy dystoniaa, silmänliikkeiden halvauksia ja parkinsonismia; SCA6 on puhdas, myöhään alkava pikkuaivoataksia; SCA7:ään liittyy etenevä verkkokalvon rappeuma (ainoa SCA, johon liittyy makuladystrofia). Taudin puhkeamisikä on käänteisesti verrannollinen toistojakson pituuteen (anticipation — pidemmät toistojaksot aiheuttavat aikaisemman puhkeamisen peräkkäisissä sukupolvissa, erityisesti isän puolelta periytyessä).
Polyglutamiinia koodaaviin mRNA-transkripteihin kohdistuvat antisense-oligonukleotidihoidot (ASO) ovat kliinisissä tutkimuksissa SCA1-, SCA2- ja SCA3-tyyppien osalta – näiden kolmen yleisimmän polyglutamiini-SCA-tyypin hoidossa. Näiden geenien ilmentymistä vaimentavien hoitomuotojen tavoitteena on vähentää myrkyllisten proteiinien tuotantoa. Lisäksi arvioidaan ionikanavien modulaattoreita ja pieniä molekyylejä, jotka kohdistuvat pikkuaivojen rappeutumista edistäviin signaalireitteihin. Kaikissa tutkimuksissa osallistujilta vaaditaan vahvistettu SCA-alatyypin molekyylidiagnoosi. Varhaisen molekyylidiagnoosin merkitys ulottuu nykyisten tutkimusten osallistumisen ulkopuolelle: myös tulevien tutkimusten tulosmittareita määrittävät luonnonhistoriatutkimukset edellyttävät genotyyppitestattuja osallistujia.
SCA7 on ainoa SCA-muoto, johon liittyy verkkokalvon rappeutuminen – kaikille potilaille, joilla on etenevä ataksia ja makuladystrofia, tulisi tehdä ATXN7-toistojaksojen määritys. Verkkokalvon oireet voivat ilmetä ennen ataksiaa, jolloin tila muistuttaa erillistä verkkokalvodystrofiaa.
Yli 40:tä SCA-alatyyppiä ei voida testata peräkkäin. Toistojaksojen tunnistustekniikan ansiosta WGS-menetelmällä voidaan nyt tunnistaa CAG-toistojaksoja ja koodaamattomia toistojaksoja, joiden tunnistamiseen on aiemmin tarvittu erikoistestejä.
SCA1/2/3:n ASO-hoidot kliinisissä tutkimuksissa – molekyylityyppi määrää kelpoisuuden geenikohtaisiin vaimentamismenetelmiin
ATXN1- (SCA1), ATXN2- (SCA2) tai ATXN3- (SCA3) mRNA:n ilmentymisen estämiseen suunnitellut antisense-oligonukleotidit ovat geenikohtaisia – SCA1-ASO:ta ei voida käyttää SCA3:n hoitoon ja päinvastoin. Kliiniseen tutkimukseen osallistuminen edellyttää vahvistettua molekyylidiagnoosia, jossa toistojakson pituus on dokumentoitu. Ilman molekyylityypitystä potilaat, joilla on kliinisesti erottamaton progressiivinen pikkuaivoataksia, eivät voi osallistua geenikohtaisiin tutkimuksiin. WGS tunnistaa tietyn SCA-alatyypin yhdellä testillä, mikä lopettaa vaiheittaisen yksittäisten geenien testaamisen, joka viivästyttää tutkimukseen osallistumista.
Ennakoiva lähestymistapa tarkoittaa, että SCA-potilaiden lapsilla oireet voivat ilmetä jo vuosikymmeniä aikaisemmin – oireettomassa vaiheessa tehtävät tutkimukset mahdollistavat suunnittelun ja tulevan osallistumisen tutkimuksiin
SCA1/2/3/7-tyyppisissä sairauksissa CAG-toistojaksojen pidentyminen noudattaa ennakointia – sukupolvien välinen toistojaksojen epävakaus (erityisesti isän puolelta periytyessä) tuottaa jälkeläisissä pidempiä toistojaksoja, mikä johtaa taudin aikaisempaan puhkeamiseen ja vakavampaan kulkuun. Vanhemmalla, jolla SCA3 on puhjennut 45-vuotiaana, voi olla lapsi, jolla tauti puhkeaa 25-vuotiaana. Oireettomien henkilöiden testaus tunnistaa riskiryhmään kuuluvat perheenjäsenet ennen oireiden puhkeamista, mikä mahdollistaa osallistumisen ennaltaehkäisyyn tähtääviin tutkimuksiin, elämänsuunnittelun ja välittömän pääsyn kliinisiin tutkimuksiin oireiden puhkeamisen jälkeen. Geneettinen neuvonta ennen oireettomien henkilöiden testausta on välttämätöntä.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – spinoserebellaarisen ataksian sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
