Sirppisoluanemia – HBB-geenissä tapahtuva yksittäinen nukleotidin muutos, joka muuttaa punasolujen rakennetta, haittaa mikroverenkiertoa ja edellyttää elinikäistä hoitoa.
Koko genomin sekvensointi määrittää HBB-geenin genotyypin kokonaisuudessaan – mukaan lukien monimutkaiset heterotsygoottiset yhdistelmät, taudin vakavuutta muokkaavat lokukset sekä samanaikaisesti periytyvät alfa-talassemian variantit, jotka jäävät järjestelmällisesti huomaamatta tavanomaisissa kantajaseuloissa.
Sirppisoluanemia
Sirppisoluanemia (SCD) on autosomaalinen resessiivinen hemoglobinopatia, jonka aiheuttaa glutamiinihapon korvautuminen valiiniksi beeta-globiinigeenin (HBB p.Glu7Val; rs334) kodonissa 6. Tämä yksittäinen nukleotidimuutos aiheuttaa hemoglobiini S:n (HbS) polymeroitumisen hapettomissa olosuhteissa, mikä vääristää punasolut jäykiksi sirppimäisiksi. Nämä epämuodostuneet solut tukkivat pienet verisuonet, mikä laukaisee verisuonia tukkivia kriisejä, hemolyyttistä anemiaa ja etenevää elinvaurioita lähes kaikissa elinjärjestelmissä – mukaan lukien perna, munuaiset, keuhkot, aivot ja luusto. Sirppisoluanemia vaikuttaa vuosittain noin 300 000 vastasyntyneeseen maailmanlaajuisesti, ja sen esiintyvyys on suurin Saharan eteläpuolisessa Afrikassa, Intiassa ja Lähi-idässä, vaikka sitä esiintyy kaikissa väestöryhmissä.
SCD:n genotyyppinen rakenne on monimutkaisempi kuin klassisen HbSS-muodon tapaus. HbSC-tauti (HBB Glu7Val/Glu6Lys) ja HbS-beeta-talassemia (HbS/beeta⁰ tai HbS/beeta⁺) aiheuttavat erillisiä kliinisiä fenotyyppejä, joiden vakavuusasteet ja hoidon vaatimukset vaihtelevat. Vakavuutta säätelevät lisäksi sikiön hemoglobiinipitoisuudet (HbF) — joihin vaikuttavat BCL11A-, HBS1L-MYB- ja itse HBB-lokuksen variantit — sekä samanaikaisesti periytyvä alfa-talassemia (HBA1/HBA2-deleetiot), joka vähentää HbS-polymerisaatiota ja liittyy lievempään tautiin. Tavanomaisella kahden alleelin kantajatestillä tunnistetaan keskeinen Glu7Val-variantti, mutta testiä ei ole suunniteltu raportoimaan sitä täyttä genotyyppistä monimutkaisuutta, joka määrää yksilön taudin kulun.
Kantajastatuksen selvittäminen ennen raskautta tai raskauden aikana on geneettisen testauksen pääasiallinen käyttötarkoitus perheissä, joissa ei ole aiemmin ollut tautia sairastaneita jäseniä. Perintötekijöiden seulonta tunnetuissa kantajaperheissä sekä vahvistava genotyyppaus vastasyntyneiden seulonnan positiivisten tulosten yhteydessä ovat vakiintuneita kliinisiä käyttöaiheita. Sairastuneiden potilaiden osalta täydellisen genotyyppauksen – mukaan lukien HbF:n modifioivat lokukset ja samanaikaisesti periytyvä alfa-talassemia – merkitys hydroksimetyylikarbamidin hoitovasteen ennustamisessa ja luuydinsiirron kelpoisuuskriteerien määrittämisessä tunnustetaan yhä laajemmin.
HbSS-, HbSC-, HbS-beta⁰-talassemia- ja HbS-beta⁺-talassemia-muotojen kliininen ennuste vaihtelee. Pelkästään HBB-genotyyppi ei riitä vakavuuden ennustamiseen; modifioivat lokukset ja samanaikaisesti periytyvät variantit ovat osa kokonaiskuvaa.
Tavallisissa kantajatesteissä havaitaan Glu7Val-variantti. Testit eivät anna tietoa koko genotyypistä, modifioivista lokuksista tai samanaikaisesti periytyvistä varianteista, jotka vaikuttavat taudin kulkuun.
Yhdistelmäheterotsygoottinen tila on yhtä tärkeä kuin kantajastatus
Henkilöllä, joka perii yhden HbS-alleelin ja yhden beeta-talassemia-alleelin, on sirppisoluanemia – ei pelkästään sirppisoluperimää. Tavalliset kahden variantin kantajatestit on suunniteltu tunnistamaan rs334 Glu7Val-substituutio, mutta niitä ei ole optimoitu beeta-talassemia-alleelien samanaikaiseen karakterisointiin koko HBB-geenin alueella. Koko genomin sekvensointi lukee koko HBB-koodaus- ja säätelysekvenssin, tunnistaa Glu7Val-alleelin rinnalla mahdolliset periytyneet beeta-talassemia-variantit ja määrittää, onko kantajaparilla riski HbSS-, HbSC-, HbS-beeta-talassemia- vai HbS-piirteeseen.
HbF-modifioijagenot ja alfa-talassemian samanaikainen periytyminen eivät näy tavanomaisissa geenitestipaneeleissa
Sikiöhemoglobiinipitoisuus on tunnetuista tekijöistä voimakkain tekijä, joka vaikuttaa sirppisoluanemian vakavuuteen. Korkea HbF-pitoisuus estää HbS-polymerisaatiota, mikä vähentää verisuonten tukkeutumista ja kohde-elinvaurioita. HbF-pitoisuuksia säätelevät yleiset variantit BCL11A-geenissä (rs1427407), HBS1L-MYB-geenien välisellä alueella (rs28384513) ja HBB-lokuksen Xmn1-kohdassa. Yhdessä periytyvä alfa-talassemia (HBA1/HBA2-geenien deleetiot) muokkaa edelleen taudin vakavuutta. Mikään näistä modifioivista lokuksista ei sisälly tavallisiin kahden alleelin kantajaseulontoihin tai hemoglobinopatiapaneleihin. Koko genomin sekvensointi tallentaa ne kaikki samanaikaisesti ensisijaisen HBB-genotyypin kanssa.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – sikkelisoluanemian ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, parissa. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, myös virtuaalisia potilasjärjestöjä.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
