Retinoblastooma – lasten yleisin silmänsisäinen syöpä, jossa RB1-geenin perimämuutos määrää toisen syövän seurannan selviytyneen potilaan loppuelämän ajan.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa kaikki RB1-geenin varianttityypit – mukaan lukien mosaiikkimutaatiot, jotka voivat jäädä huomaamatta tavanomaisissa verikokeissa – ja ratkaisee sukusolujen ja somaattisten solujen välisen eron, joka määrittää elinikäisen syöpäseurannan tarpeen.
Retinoblastooma
Retinoblastooma (Rb) on lasten yleisin silmänsisäinen pahanlaatuinen kasvain, jota esiintyy noin yhdellä 15 000–20 000 elävänä syntyneestä lapsesta, ja maailmanlaajuisesti diagnosoidaan vuosittain noin 8 000 uutta tapausta. Se syntyy verkkokalvon epäkypsistä esisoluista, retinoblasteista, johtuen kromosomin 13q14.2:lla sijaitsevan RB1-kasvainsuppressorigeenin biallelisesta inaktivoitumisesta – tämä on ensimmäinen molekyylitasolla karakterisoitu kasvainsuppressorigeeni. Retinoblastooma ilmenee leukokoriana (valkoinen pupillirefleksi), karsastuksena ja näön menetyksenä, yleensä alle 5-vuotiailla lapsilla. Nykyisellä hoidolla kokonaiseloonjäämisaste on yli 95 % korkean tulotason maissa, vaikka tulokset vaihtelevat huomattavasti taudin vaiheen ja resurssien saatavuuden mukaan.
Noin 40 % retinoblastoomatapauksista on perinnöllisiä – ne johtuvat RB1-geenin sukusolujen (konstitutiivisesta) patogeenisestä muunnoksesta. Perinnöllinen retinoblastooma on tyypillisesti kahdenpuoleinen (75–80 %) tai monipesäkkeinen, ja diagnoosin keski-ikä on alhaisempi kuin satunnaisissa tapauksissa. Loput noin 60 % tapauksista on satunnaisia (ei-perinnöllisiä), ja ne johtuvat kahdesta somaattisesta RB1-mutaatiosta yhdessä verkkokalvosolussa. Yksipuolinen retinoblastooma voi olla perinnöllinen tai satunnainen – noin 15 %:ssa yksipuolisista tapauksista on sukusolujen RB1-mutaatioita, ja tämä osuus nousee lähes 100 %:iin kaksipuolisissa tapauksissa. Noin 10–15 %:ssa yksipuolisista retinoblastoomista, joissa ei ole havaittavissa sukusolujen RB1-mutaatioita, esiintyy somaattisia mosaiikkimutaatioita, jotka ovat havaittavissa vain kasvaimessa tai syväsekvensoinnilla.
Perinnöllisen ja ei-perinnöllisen retinoblastooman välinen ratkaiseva ero ei piile silmätuumorin ennusteessa, vaan elinikäisessä toisen syövän riskissä. Perinnöllisten RB1-geenin kantajilla on arviolta 50 prosentin kumulatiivinen riski sairastua toiseen primaariseen syöpään 50 vuoden ikään mennessä; kyseessä ovat pääasiassa säteilykenttään liittyvät osteosarkoomat, pehmytkudossarkoomat ja melanooma. Tämä riski kasvaa huomattavasti sädehoidon seurauksena, jota vältetään mahdollisuuksien mukaan sukusolujen RB1-geenin kantajien kohdalla. Perinnöllisen retinoblastooman selviytyminen käynnistää elinikäisen seurantaprotokollan: säännöllinen kuvantaminen pehmytkudos- ja luukasvainten varalta, UV-säteilyn välttäminen sekä jälkeläisten peräkkäiset geenitestit ja silmätutkimukset vauvaiässä. Geeniterapiaa ja kohdennettuja RB1-reitin hoitomuotoja tutkitaan parhaillaan.
Mosaikkimaiset RB1-mutaatiot – joissa sukusoluvariantti esiintyy vain osassa soluista – esiintyvät noin 10–12 prosentissa perinnöllisistä retinoblastoomista, ja ne voivat jäädä havaitsematta tavanomaisessa verinäytteeseen perustuvassa sekvensoinnissa. Syväsekvensointi ja kasvainkudoksen analysointi parantavat havaitsemista.
Sukusolujen ja somaattisen mosaiikin RB1-statuksen määrittäminen edellyttää sekä verinäytteen että kasvainkudoksen analysointia sekvensointisyvyydellä, jota vakiopaneelit eivät välttämättä pysty saavuttamaan. Perinteisissä testeissä jää huomaamatta veressä esiintyvät mosaiikkimuunnokset, joiden alleeliosuus on 5–20 %.
Tavallisissa sukusolujen testeissä Mosaic RB1 -muunnokset jäävät havaitsematta – ja niillä on kliinisiä seurauksia koko perheelle
Retinoblastooman somaattinen mosaiikkisuus – jossa RB1-geenin patogeeninen variantti on syntynyt zygotin muodostumisen jälkeen ja esiintyy vain osassa soluista – koskee noin 10–12 %:a perinnöllisistä tapauksista. Mosaikkisen RB1-muunnoksen omaavan indeksipotilaan vanhemmilla voi itsekin olla mosaiikkimosaikismi, jossa muunnoksen alleeliosuus on hyvin pieni. Tavallinen eksomi- ja paneelisequencing on kalibroitu sukusolujen heterotsygoottisille muunnoksille, joiden alleeliosuus on noin 50 %; 10–20 %:n osuudella esiintyvät mosaiikkimuunnokset voivat jäädä alle muunnoksen tunnistuskynnyksen. Koko genomin syväsekvensointi, jossa on parannettu herkkyys alleeliosuudeltaan pienille muunnoksille, parantaa mosaiikin havaitsemista. Jos vanhemman mosaiikkinen sukusolujen RB1-variantti jää huomaamatta, se johtaa virheelliseen neuvontaan toistumisriskistä – seuraava raskaus esitetään riskittömänä, vaikka vanhempi voi itse asiassa siirtää variantin.
RB1-geenin perimämuutos määrittää sädehoidon valintoja kasvaimen hoidon aikana
Retinoblastooman ulkoinen sädehoito lisää merkittävästi toisen primaarisyövän riskiä säteilyalueella olevilla RB1-geenin kantajilla – erityisesti silmäkuopan alueen osteosarkooman osalta. Tästä syystä perinnöllisen retinoblastooman nykyisessä hoidossa suositaan voimakkaasti muita kuin säteilyyn perustuvia hoitomuotoja (valtimoon annettava kemoterapia, lasiaiseen annettava melfalaani, paikallishoidot), mikäli se on mahdollista, nimenomaan säteilyyn liittyvän toisen syövän riskin välttämiseksi. Tämän hoitopäätöksen tekeminen edellyttää germline-RB1-statuksen tuntemista alkuhoidon ajankohtana – ei vuosia myöhemmin, kun toinen syöpä kehittyy. Koko genomin sekvensointi tarjoaa täydellisen RB1-genotyypin, mukaan lukien mosaiikkitunnistuksen, hoidon suunnittelun tueksi ensimmäisestä päivästä lähtien.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – retinoblastooman ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
